More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1825 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 128 aa  249  7e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0425  peptidoglycan-binding LysM  65.85 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00647142  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1069  peptidoglycan-binding LysM  54.78 
 
 		 168 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4268  peptidoglycan-binding LysM  44.94 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000954581  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.77 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  55.32 
 
 		 788 aa  57  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  58.7 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  47.06 
 
 		 751 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1982  LysM domain-containing protein  47.37 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  55.32 
 
 		 250 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  41.18 
 
 		 203 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0876  stage VI sporulation protein D  47.92 
 
 		 351 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  39.73 
 
 		 286 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  40.28 
 
 		 265 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  48.94 
 
 		 470 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  49.02 
 
 		 175 aa  53.5  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  40.28 
 
 		 265 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  51.67 
 
 		 414 aa  53.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0093  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.37 
 
 		 192 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  36.45 
 
 		 427 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1699  Peptidoglycan-binding LysM  56.52 
 
 		 183 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.578392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  34.02 
 
 		 447 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  55.56 
 
 		 202 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  36.45 
 
 		 427 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 		 337 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  50 
 
 		 303 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0021  Peptidoglycan-binding LysM  46.3 
 
 		 522 aa  51.6  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  45.45 
 
 		 754 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0922  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  51.11 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.005941  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  55.56 
 
 		 261 aa  51.2  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21400  Peptidoglycan-binding LysM  53.33 
 
 		 500 aa  51.6  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2827  Peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797997  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 204 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  39.29 
 
 		 310 aa  50.8  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  52.27 
 
 		 429 aa  50.8  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  31.03 
 
 		 253 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1636  Peptidoglycan-binding LysM  45.45 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0164  Peptidase M23  50 
 
 		 353 aa  50.8  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  28.71 
 
 		 412 aa  50.4  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  47.83 
 
 		 1021 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  37.5 
 
 		 499 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  45.1 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  53.33 
 
 		 445 aa  50.4  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  40 
 
 		 414 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  48.39 
 
 		 733 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  36.47 
 
 		 727 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2576  stage VI sporulation protein D  40.74 
 
 		 431 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  46.55 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2843  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 580 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  36.47 
 
 		 727 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  50 
 
 		 368 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1239  Peptidoglycan-binding LysM  48.15 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04252  LysM domain protein  40.43 
 
 		 424 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  53.33 
 
 		 428 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  44.23 
 
 		 539 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  38.96 
 
 		 1001 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  47.27 
 
 		 297 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  35 
 
 		 534 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  48.33 
 
 		 255 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  46.51 
 
 		 390 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  53.49 
 
 		 430 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1770  3D domain-containing protein  50 
 
 		 526 aa  48.9  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.103231  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  41.67 
 
 		 307 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  45.61 
 
 		 191 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  50 
 
 		 503 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0849  peptidase M23B  47.27 
 
 		 251 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  33.96 
 
 		 530 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0893  Peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  50 
 
 		 448 aa  48.5  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  45.1 
 
 		 338 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3007  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.59 
 
 		 230 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1088  peptidoglycan-binding LysM  54.35 
 
 		 190 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155027  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 590 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  41.18 
 
 		 335 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  42 
 
 		 568 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1186  Slt family transglycosylase  43.4 
 
 		 398 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  48.78 
 
 		 511 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  47.54 
 
 		 285 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  40.35 
 
 		 1556 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 595 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 423 aa  47.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  48.78 
 
 		 539 aa  47.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1867  aggregation promoting factor-like surface protein  46.34 
 
 		 212 aa  47.8  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  43.86 
 
 		 440 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  43.55 
 
 		 514 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0560  Peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 		 507 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0820449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  48.84 
 
 		 553 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0326  muramidase  53.66 
 
 		 372 aa  47.4  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0474  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  45.1 
 
 		 801 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  35.56 
 
 		 301 aa  47.4  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1998  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 123 aa  47.4  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0170304  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  51.16 
 
 		 527 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  44 
 
 		 474 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  33.91 
 
 		 285 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  48.89 
 
 		 341 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  48.84 
 
 		 515 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  48.84 
 
 		 515 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0894  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.9 
 
 		 472 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  36.11 
 
 		 587 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>