More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1749 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
538 aa  1085    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  33.71 
 
 
561 aa  243  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2078  extracellular solute-binding protein  31.74 
 
 
550 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0155484  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  32.77 
 
 
554 aa  230  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  32.9 
 
 
554 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  31.82 
 
 
505 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  30.97 
 
 
516 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3816  twin-arginine translocation pathway signal  31.36 
 
 
522 aa  206  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.961587  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.19 
 
 
545 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  29.87 
 
 
518 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 
545 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5006  extracellular solute-binding protein family 5  28.95 
 
 
536 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.264167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  29.08 
 
 
539 aa  192  9e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1922  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  29.76 
 
 
535 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  29.36 
 
 
535 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5304  extracellular solute-binding protein family 5  28.84 
 
 
536 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.85757 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5634  extracellular solute-binding protein family 5  29.82 
 
 
540 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5692  extracellular solute-binding protein family 5  27.02 
 
 
555 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 
540 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5666  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.12 
 
 
537 aa  184  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 
523 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5072  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 
519 aa  184  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.49 
 
 
516 aa  183  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  30.38 
 
 
502 aa  183  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 
519 aa  182  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6276  extracellular solute-binding protein family 5  30.17 
 
 
496 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0695772 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6426  extracellular solute-binding protein family 5  28.52 
 
 
529 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312111 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  28.99 
 
 
532 aa  178  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2914  extracellular solute-binding protein family 5  28.32 
 
 
537 aa  177  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 
529 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  27.45 
 
 
529 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4502  extracellular solute-binding protein family 5  29.31 
 
 
526 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146925  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6274  extracellular solute-binding protein family 5  28.17 
 
 
511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0245039 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2945  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 
509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3699  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 
527 aa  175  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0786  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.1 
 
 
526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2183  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 
529 aa  173  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6090  extracellular solute-binding protein family 5  27.46 
 
 
538 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194048  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1543  extracellular solute-binding protein family 5  28.72 
 
 
513 aa  172  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.397228  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  31 
 
 
511 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 
510 aa  171  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2156  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 
543 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.470572  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 
520 aa  170  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2781  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 
525 aa  169  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  27.83 
 
 
527 aa  169  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1495  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.04 
 
 
538 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.045715  hitchhiker  0.00127227 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 
515 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2105  extracellular solute-binding protein family 5  30.67 
 
 
538 aa  166  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0251373  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6277  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 
527 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0281814  normal  0.114415 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6444  twin-arginine translocation pathway signal  27.85 
 
 
527 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6679  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component  27.85 
 
 
527 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140574  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.57 
 
 
510 aa  164  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6279  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 
512 aa  163  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  27.91 
 
 
513 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 
492 aa  162  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2844  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 
534 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.415189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
510 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  28.69 
 
 
514 aa  161  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4961  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
537 aa  161  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  normal  0.0265573 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6354  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 
527 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6057  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 
527 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  28.01 
 
 
532 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3074  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 
536 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3804  extracellular solute-binding protein  30.42 
 
 
501 aa  158  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000726853  hitchhiker  0.0000406829 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  30.57 
 
 
516 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.51 
 
 
535 aa  158  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
500 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3525  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  28.37 
 
 
535 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2843  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 
535 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  30.68 
 
 
495 aa  155  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 
535 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  32.75 
 
 
519 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1360  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 
543 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0151381 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3524  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.17 
 
 
534 aa  154  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.413747  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  28.76 
 
 
516 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.63 
 
 
512 aa  151  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3168  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 
534 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3756  putative peptide ABC transporter, substrate- binding protein  30.47 
 
 
514 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279615  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  27.23 
 
 
509 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  32.24 
 
 
506 aa  148  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0960  extracellular solute-binding protein family 5  26.7 
 
 
547 aa  148  3e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.23 
 
 
534 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 
515 aa  147  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.36 
 
 
542 aa  147  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3049  extracellular solute-binding protein family 5  29.52 
 
 
503 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  27.44 
 
 
512 aa  146  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  28.25 
 
 
503 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.41 
 
 
540 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 
535 aa  144  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 
564 aa  143  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.96 
 
 
513 aa  144  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 
503 aa  143  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1506  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 
501 aa  143  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0306373  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  29.32 
 
 
537 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  25.97 
 
 
510 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4559  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.62 
 
 
530 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 
512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 
512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 
512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  27.61 
 
 
508 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>