159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1708 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1708  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
444 aa  887    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1037  putative PAS/PAC sensor protein  49.89 
 
 
484 aa  411  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0409  putative PAS/PAC sensor protein  48.08 
 
 
492 aa  395  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4422  putative PAS/PAC sensor protein  26.41 
 
 
492 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  38.18 
 
 
361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  31.42 
 
 
638 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  41.32 
 
 
372 aa  107  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  36.7 
 
 
385 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  30.29 
 
 
428 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
388 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  36.77 
 
 
362 aa  100  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  37.32 
 
 
509 aa  99.8  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  27.37 
 
 
430 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  39.17 
 
 
521 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
562 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  36.69 
 
 
523 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5196  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476105  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  34.21 
 
 
653 aa  94.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2296  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 
342 aa  94.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0948081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  36.92 
 
 
271 aa  93.2  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  34.32 
 
 
370 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1485  anti-sigma-factor antagonist  34.57 
 
 
367 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  32.74 
 
 
325 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  40.18 
 
 
275 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 
568 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 
361 aa  90.5  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3649  anti-sigma-factor antagonist  31.85 
 
 
361 aa  90.1  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4698  anti-sigma-factor antagonist  33.94 
 
 
363 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4490  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 
511 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  decreased coverage  0.000741245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2206  anti-sigma-factor antagonist  34.67 
 
 
367 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  33.58 
 
 
291 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  34.11 
 
 
281 aa  88.2  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1894  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 
344 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0179  anti-sigma-factor antagonist  34.87 
 
 
359 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00135922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4192  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 
380 aa  86.7  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2210  anti-sigma-factor antagonist  33.58 
 
 
580 aa  86.7  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0268  anti-sigma-factor antagonist  30.73 
 
 
363 aa  86.7  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0598617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  31.33 
 
 
653 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3473  anti-sigma-factor antagonist  32.58 
 
 
422 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.551903  normal  0.0822697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  32.02 
 
 
424 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  25.83 
 
 
323 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  31.11 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  26.26 
 
 
428 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  31.55 
 
 
388 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  34.19 
 
 
559 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  31.33 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  31.58 
 
 
653 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  33.61 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  32.23 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  29.48 
 
 
667 aa  83.2  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3476  anti-sigma-factor antagonist  33.73 
 
 
380 aa  83.2  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.837777  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0868  anti-sigma-factor antagonist  32.64 
 
 
506 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  32.37 
 
 
357 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3609  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.196503  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 
549 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2660  anti-sigma-factor antagonist  32.57 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4325  anti-sigma-factor antagonist  31.29 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0978917  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  30.88 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1856  anti-sigma-factor antagonist  35.66 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.616563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  31.25 
 
 
655 aa  80.9  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  31.51 
 
 
556 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1492  anti-sigma-factor antagonist  30.71 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  35.04 
 
 
445 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  31.39 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4858  anti-sigma-factor antagonist  33.59 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4067  putative PAS/PAC sensor protein  27.17 
 
 
429 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  32.17 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  28.85 
 
 
371 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  33.58 
 
 
439 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  32.03 
 
 
231 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 
306 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  28.93 
 
 
315 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 
312 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  32.33 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  34.01 
 
 
538 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  30.77 
 
 
694 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  36.63 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4191  anti-sigma-factor antagonist  25.81 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  32.21 
 
 
433 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0577  anti-sigma-factor antagonist  33.04 
 
 
385 aa  77  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  30.28 
 
 
549 aa  76.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3124  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.4 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3768  anti-sigma-factor antagonist  32.76 
 
 
284 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  32.5 
 
 
421 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5779  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
288 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2416  anti-sigma-factor antagonist  32.54 
 
 
288 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2635  anti-sigma-factor antagonist  31.67 
 
 
355 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0129  anti-sigma-factor antagonist  33.9 
 
 
287 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4970  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  30.83 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0148  putative PAS/PAC sensor protein  28.23 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0195  putative PAS/PAC sensor protein  28 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1074  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0474  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3857  anti-sigma-factor antagonist  29.49 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3133  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  30.15 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1393  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.632841  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2486  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.43 
 
 
294 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>