More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1544 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1544  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 504 aa  999    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0500  secretion protein HlyD family protein  39.84 
 
 		 502 aa  246  6e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3638  secretion protein HlyD family protein  40.48 
 
 		 503 aa  232  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.17 
 
 		 608 aa  187  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3213  multidrug resistance efflux pump-like protein  34.61 
 
 		 502 aa  186  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0355  secretion protein HlyD family protein  36.61 
 
 		 520 aa  167  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  hitchhiker  0.000000558214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2709  multidrug resistance efflux pump-like protein  34.25 
 
 		 501 aa  162  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  30.1 
 
 		 641 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2438  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.71 
 
 		 586 aa  133  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  30.39 
 
 		 621 aa  131  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  33.86 
 
 		 586 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0268  RND family efflux transporter MFP subunit  35.38 
 
 		 587 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0795166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4067  RND family efflux transporter MFP subunit  30.23 
 
 		 621 aa  106  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2731  secretion protein HlyD family protein  38.34 
 
 		 497 aa  104  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.01 
 
 		 504 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.66 
 
 		 509 aa  84  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4302  secretion protein HlyD family protein  28.96 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.358477  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0790  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.15 
 
 		 521 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  25.22 
 
 		 517 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  30.67 
 
 		 489 aa  74.7  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  27.65 
 
 		 500 aa  72.8  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0010  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  23.08 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.860595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0535  hypothetical protein  39.71 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2093  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  25 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000985853 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4169  secretion protein HlyD family protein  29.13 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00575947  hitchhiker  0.00428587 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3151  secretion protein HlyD family protein  26.08 
 
 		 533 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1441  RND family efflux transporter MFP subunit  26.65 
 
 		 634 aa  70.5  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.05 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1868  secretion protein HlyD  32.48 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0092  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  25.38 
 
 		 479 aa  67.4  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 		 489 aa  67  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0207  RND family efflux transporter MFP subunit  26.96 
 
 		 400 aa  67  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000100142 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 384 aa  66.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3403  HlyD family secretion protein  26.47 
 
 		 401 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00376035  normal  0.420161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.46 
 
 		 490 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.71 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2802  secretion protein HlyD  26.11 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0304  RND family efflux transporter MFP subunit  26.11 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1593  RND family efflux transporter MFP subunit  25.2 
 
 		 631 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351482  normal  0.814117 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  26.11 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140483  hitchhiker  0.000000766037 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1719  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.8 
 
 		 517 aa  63.5  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0477  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2452  RND family efflux transporter MFP subunit  34.62 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.85 
 
 		 487 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.59 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  27.98 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  30.85 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2316  secretion protein HlyD family protein  25.79 
 
 		 533 aa  62  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  32.09 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  32.56 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.2 
 
 		 663 aa  61.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.52 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2236  secretion protein HlyD  31.85 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.53 
 
 		 505 aa  60.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0231  RND family efflux transporter MFP subunit  25.62 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.77 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3586  secretion protein HlyD  25.53 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659041  normal  0.0297067 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0223  RND family efflux transporter MFP subunit  27.09 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  27.52 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  27.4 
 
 		 450 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.40893 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1232  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  24.71 
 
 		 444 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000100981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  32.56 
 
 		 509 aa  59.7  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  29.52 
 
 		 355 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  28.49 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  28.49 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  28.49 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.47 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  33.33 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1951  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1097 aa  58.9  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00270024  hitchhiker  0.000836755 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  28.1 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  0.000000000906287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  29.52 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1375  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.77 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3640  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  29.69 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.800892  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6201  putative accessory protein to ABC-type macrolide transport protein MacB  34.43 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.5 
 
 		 496 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  34.82 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.45 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4357  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  25.93 
 
 		 514 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  28.65 
 
 		 395 aa  57  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1423  RND family efflux transporter MFP subunit  34.15 
 
 		 401 aa  57  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2754  RND efflux transporter  34.15 
 
 		 401 aa  57  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.98 
 
 		 496 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  29.68 
 
 		 399 aa  57  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5856  secretion protein HlyD  27.27 
 
 		 425 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249167  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2731  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  23.74 
 
 		 607 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  25.87 
 
 		 402 aa  56.6  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  34.82 
 
 		 353 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.34 
 
 		 414 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21240  multidrug resistance efflux pump  27.98 
 
 		 536 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  31.56 
 
 		 404 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  28.12 
 
 		 456 aa  55.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  31.2 
 
 		 346 aa  55.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1312  RND efflux transporter  36.11 
 
 		 401 aa  55.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130358  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  34.82 
 
 		 367 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  26.56 
 
 		 328 aa  54.7  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1295  efflux protein  36.07 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  26.56 
 
 		 328 aa  54.7  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  37.09 
 
 		 359 aa  54.7  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3589  HlyD family secretion protein  43.24 
 
 		 320 aa  54.3  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  29.27 
 
 		 402 aa  54.7  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>