More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1475 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 237 aa  479  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3327  50S ribosomal protein L1  78.39 
 
 		 240 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.24535  normal  0.407372 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4319  50S ribosomal protein L1  78.9 
 
 		 240 aa  354  8.999999999999999e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.686674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0123  50S ribosomal protein L1  70.13 
 
 		 237 aa  345  4e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.991337  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  67.81 
 
 		 242 aa  325  3e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  60.62 
 
 		 235 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  58.97 
 
 		 234 aa  279  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  57.45 
 
 		 235 aa  278  7e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  57.33 
 
 		 230 aa  276  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  58.52 
 
 		 233 aa  275  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  55.46 
 
 		 233 aa  275  6e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  63.16 
 
 		 232 aa  274  7e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  53.88 
 
 		 233 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  57.51 
 
 		 234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  56.84 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  57.89 
 
 		 231 aa  273  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  57.26 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  58.37 
 
 		 236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  60.96 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0358  50S ribosomal protein L1  57.46 
 
 		 236 aa  269  2.9999999999999997e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235543  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  57.26 
 
 		 233 aa  268  8e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  55.7 
 
 		 231 aa  266  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  56.22 
 
 		 237 aa  266  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0883  50S ribosomal protein L1  55.74 
 
 		 237 aa  265  4e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.184517  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  57.89 
 
 		 236 aa  265  5.999999999999999e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  58.01 
 
 		 233 aa  265  7e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  57.08 
 
 		 233 aa  265  7e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  56.64 
 
 		 231 aa  264  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  55.26 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  55.7 
 
 		 230 aa  263  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  58.33 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  55.7 
 
 		 230 aa  263  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  54.74 
 
 		 236 aa  262  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  54.39 
 
 		 232 aa  262  3e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  56.52 
 
 		 233 aa  262  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  54.89 
 
 		 238 aa  262  4e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  56.58 
 
 		 231 aa  261  4.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  56.52 
 
 		 233 aa  261  6e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  56.64 
 
 		 241 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  59.21 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  57.96 
 
 		 242 aa  260  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  57.14 
 
 		 229 aa  259  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  57.14 
 
 		 229 aa  259  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  56.19 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  54.74 
 
 		 235 aa  258  4e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  57.08 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  57.45 
 
 		 239 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1739  50S ribosomal protein L1  55.04 
 
 		 238 aa  257  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27781  50S ribosomal protein L1  55.51 
 
 		 244 aa  257  9e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  58.3 
 
 		 233 aa  257  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1763  50S ribosomal protein L1  55.04 
 
 		 238 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00323247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  52.34 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0205  50S ribosomal protein L1  53.04 
 
 		 235 aa  254  6e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  54.89 
 
 		 235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  51.97 
 
 		 235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02321  50S ribosomal protein L1  53.04 
 
 		 235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  52.47 
 
 		 233 aa  253  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  54.78 
 
 		 230 aa  252  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02231  50S ribosomal protein L1  52.61 
 
 		 235 aa  252  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  54.63 
 
 		 225 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  56.14 
 
 		 230 aa  251  5.000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  53.19 
 
 		 238 aa  251  6e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2685  ribosomal protein L1  53.71 
 
 		 229 aa  251  6e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0114395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  54.81 
 
 		 236 aa  251  7e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  52.54 
 
 		 242 aa  251  9.000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 242 aa  250  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1019  50S ribosomal protein L1  53.19 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726287 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  56.58 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2470  50S ribosomal protein L1  54.24 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.538849  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  52.4 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02211  50S ribosomal protein L1  51.74 
 
 		 235 aa  249  3e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  52.19 
 
 		 235 aa  249  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1570  50S ribosomal protein L1  52.12 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02791  50S ribosomal protein L1  52.12 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.475982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0296  50S ribosomal protein L1P  55.36 
 
 		 239 aa  247  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02211  50S ribosomal protein L1  53.71 
 
 		 234 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.54632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  51.75 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  55.9 
 
 		 230 aa  246  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  56.33 
 
 		 230 aa  245  4e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  52.19 
 
 		 234 aa  245  4e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0677  50S ribosomal protein L1  54.51 
 
 		 238 aa  245  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  55.36 
 
 		 230 aa  245  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 229 aa  245  4e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  56.33 
 
 		 230 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  55.26 
 
 		 235 aa  245  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0952  50S ribosomal protein L1  53.62 
 
 		 235 aa  244  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0641  50S ribosomal protein L1  58.62 
 
 		 233 aa  244  6e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0924  50S ribosomal protein L1  53.62 
 
 		 235 aa  244  6e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0941  50S ribosomal protein L1  53.62 
 
 		 235 aa  244  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  55.9 
 
 		 230 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  55.9 
 
 		 230 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  55.9 
 
 		 230 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  55.9 
 
 		 230 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  55.9 
 
 		 230 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  55.9 
 
 		 230 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  55.35 
 
 		 234 aa  244  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  55.9 
 
 		 230 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  53.07 
 
 		 229 aa  244  8e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>