More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1351 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 225 aa  448  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  76.79 
 
 		 224 aa  341  5.999999999999999e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  76.34 
 
 		 224 aa  340  8e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  68.16 
 
 		 236 aa  302  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  59.73 
 
 		 228 aa  260  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.28 
 
 		 224 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.27 
 
 		 228 aa  255  4e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  56.25 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.37 
 
 		 224 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  56.31 
 
 		 240 aa  247  8e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  53.36 
 
 		 224 aa  245  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  54.46 
 
 		 224 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  58.82 
 
 		 226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.8 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  56.11 
 
 		 225 aa  243  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  55.61 
 
 		 227 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.91 
 
 		 233 aa  241  9e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  52.47 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.64 
 
 		 224 aa  239  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  53.57 
 
 		 224 aa  239  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  53.12 
 
 		 224 aa  238  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  52.25 
 
 		 223 aa  237  8e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  53.12 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.91 
 
 		 224 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.91 
 
 		 224 aa  235  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.11 
 
 		 227 aa  235  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.89 
 
 		 229 aa  234  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.12 
 
 		 225 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.75 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  52.02 
 
 		 224 aa  232  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  49.38 
 
 		 246 aa  231  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 223 aa  229  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  51.79 
 
 		 230 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  51.79 
 
 		 230 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  51.79 
 
 		 230 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  51.56 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 		 226 aa  228  6e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  50.88 
 
 		 226 aa  228  6e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  51.56 
 
 		 231 aa  228  6e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 226 aa  225  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  51.1 
 
 		 228 aa  225  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  55.8 
 
 		 225 aa  224  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  48.17 
 
 		 222 aa  223  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 		 228 aa  222  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 		 225 aa  222  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  53.07 
 
 		 237 aa  221  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  50.68 
 
 		 225 aa  221  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  49.33 
 
 		 227 aa  221  6e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  49.33 
 
 		 227 aa  221  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 		 227 aa  221  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  49.33 
 
 		 227 aa  221  6e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  56.44 
 
 		 229 aa  221  7e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  51.82 
 
 		 226 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 		 406 aa  219  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  219  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.55 
 
 		 223 aa  218  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  49.32 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 224 aa  218  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  47.77 
 
 		 230 aa  218  6e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.42 
 
 		 227 aa  218  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  49.32 
 
 		 224 aa  218  7e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  51.08 
 
 		 235 aa  218  8.999999999999998e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  50 
 
 		 228 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.76 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5099  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.64 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  50.89 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  53.33 
 
 		 283 aa  216  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.42 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.96 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1208  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  51.82 
 
 		 226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.42 
 
 		 223 aa  215  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 226 aa  215  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6295  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.42 
 
 		 223 aa  215  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.803537  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1749  two component heavy metal response transcriptional regulator  50 
 
 		 242 aa  215  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1841  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 228 aa  215  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.99331  hitchhiker  0.00000222676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.11 
 
 		 238 aa  215  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  49.1 
 
 		 226 aa  215  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.7 
 
 		 228 aa  215  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.51 
 
 		 223 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.51 
 
 		 223 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 		 223 aa  214  5.9999999999999996e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  46.7 
 
 		 227 aa  214  9e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 222 aa  214  9e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.54 
 
 		 226 aa  214  9e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1398  DNA-binding response regulator  46.98 
 
 		 246 aa  214  9e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000136334  hitchhiker  8.832960000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.55 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 		 273 aa  213  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  47.96 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  48.88 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  47.75 
 
 		 228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1625  DNA-binding response regulator CsrR  47.56 
 
 		 229 aa  212  2.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137799  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.18 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.18 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.18 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.27 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0422  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.55 
 
 		 227 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.36 
 
 		 221 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>