More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1307 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  57.74 
 
 		 650 aa  746    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  56.59 
 
 		 642 aa  660    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 652 aa  1339    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  52.85 
 
 		 663 aa  672    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  53.36 
 
 		 645 aa  699    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  50.94 
 
 		 649 aa  676    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  53.69 
 
 		 638 aa  674    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  56.2 
 
 		 643 aa  689    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  49.53 
 
 		 646 aa  658    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  57.53 
 
 		 672 aa  689    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  49.24 
 
 		 641 aa  580  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  48.12 
 
 		 661 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  46.74 
 
 		 657 aa  570  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  45.38 
 
 		 650 aa  560  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  48.14 
 
 		 644 aa  548  1e-154  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  44.03 
 
 		 651 aa  548  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  44.98 
 
 		 651 aa  544  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  45.95 
 
 		 636 aa  532  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  44.05 
 
 		 650 aa  531  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  48.62 
 
 		 667 aa  530  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  45.98 
 
 		 650 aa  509  1e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  45.95 
 
 		 639 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  44.34 
 
 		 645 aa  478  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  41.04 
 
 		 638 aa  451  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  29.84 
 
 		 553 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  29 
 
 		 1088 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  28.67 
 
 		 1121 aa  204  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  27.83 
 
 		 548 aa  203  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  27.88 
 
 		 1085 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  27.72 
 
 		 534 aa  203  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  28.04 
 
 		 1088 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  28.88 
 
 		 1092 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  28.04 
 
 		 1088 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  28.37 
 
 		 572 aa  200  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  28.29 
 
 		 553 aa  200  6e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  28.29 
 
 		 572 aa  200  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  27.22 
 
 		 551 aa  197  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  28.24 
 
 		 1102 aa  197  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  26.3 
 
 		 551 aa  197  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  28.37 
 
 		 1088 aa  197  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  27.96 
 
 		 1102 aa  195  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  27.96 
 
 		 1102 aa  194  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  27.65 
 
 		 1088 aa  193  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  27.4 
 
 		 1119 aa  192  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  27.73 
 
 		 1101 aa  191  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  28.34 
 
 		 1088 aa  191  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  27.58 
 
 		 1123 aa  190  5.999999999999999e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  27.77 
 
 		 601 aa  190  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  28.01 
 
 		 1099 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  27.99 
 
 		 1100 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  27.8 
 
 		 1100 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  27.64 
 
 		 1100 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  26.03 
 
 		 1104 aa  187  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  27.19 
 
 		 1100 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  28.16 
 
 		 1130 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  28.7 
 
 		 1108 aa  187  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  27.66 
 
 		 606 aa  186  8e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  26.09 
 
 		 1114 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  26.11 
 
 		 1100 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  27.5 
 
 		 1100 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  26.96 
 
 		 1108 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  27.05 
 
 		 1116 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  27.24 
 
 		 1116 aa  185  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  27.45 
 
 		 577 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  28.62 
 
 		 1094 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  25.88 
 
 		 1100 aa  184  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  28.22 
 
 		 1152 aa  184  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  28.86 
 
 		 1137 aa  183  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  27.86 
 
 		 1109 aa  182  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  27.66 
 
 		 682 aa  183  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  27.13 
 
 		 1110 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  27.55 
 
 		 1105 aa  182  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  27.34 
 
 		 556 aa  182  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  28.19 
 
 		 572 aa  182  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  27.4 
 
 		 1113 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  28.49 
 
 		 1137 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  27.06 
 
 		 1111 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  26.56 
 
 		 567 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  28.93 
 
 		 1136 aa  181  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  27.35 
 
 		 1110 aa  181  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  26.57 
 
 		 1093 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  26.57 
 
 		 1093 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  28.75 
 
 		 1137 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  28.75 
 
 		 1137 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  28.75 
 
 		 1137 aa  180  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  27.13 
 
 		 1100 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  25.84 
 
 		 588 aa  178  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  27.77 
 
 		 1108 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  28.75 
 
 		 1138 aa  179  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  27.66 
 
 		 591 aa  179  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  27.69 
 
 		 1154 aa  178  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  27.82 
 
 		 571 aa  178  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  26.16 
 
 		 1112 aa  177  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  26.71 
 
 		 1139 aa  177  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  27.99 
 
 		 1105 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  26.74 
 
 		 1094 aa  177  6e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  27.26 
 
 		 1164 aa  177  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  27.26 
 
 		 1164 aa  177  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  26.62 
 
 		 1121 aa  176  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  27.32 
 
 		 1106 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>