More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1288 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 453 aa  913    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  42.3 
 
 		 436 aa  316  6e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  38.74 
 
 		 458 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  40 
 
 		 434 aa  300  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  39.78 
 
 		 434 aa  299  8e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  39.38 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  39.54 
 
 		 434 aa  296  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  38.59 
 
 		 418 aa  293  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  37.27 
 
 		 464 aa  293  5e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  40.42 
 
 		 423 aa  289  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  37.28 
 
 		 443 aa  289  8e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  41.32 
 
 		 434 aa  288  9e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  38.9 
 
 		 420 aa  287  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  40.05 
 
 		 425 aa  288  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  37.33 
 
 		 443 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  39.91 
 
 		 428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  39.91 
 
 		 428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  39.18 
 
 		 464 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  40.38 
 
 		 418 aa  286  4e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  38.71 
 
 		 434 aa  286  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  40.53 
 
 		 438 aa  286  5e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  37.97 
 
 		 419 aa  285  9e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  41.77 
 
 		 432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  39.67 
 
 		 418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  39.45 
 
 		 421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  40.23 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  40.5 
 
 		 436 aa  280  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  38.86 
 
 		 428 aa  280  5e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  37.9 
 
 		 428 aa  279  7e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  39.29 
 
 		 419 aa  279  8e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  37.21 
 
 		 454 aa  279  9e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  40.32 
 
 		 422 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  41.7 
 
 		 425 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  40.18 
 
 		 418 aa  278  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  39.33 
 
 		 431 aa  278  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  40.09 
 
 		 422 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  32.07 
 
 		 441 aa  275  8e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  39.08 
 
 		 446 aa  276  8e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  40.78 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  38.41 
 
 		 428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  37.95 
 
 		 425 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  40.05 
 
 		 418 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  41.07 
 
 		 425 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  38.85 
 
 		 416 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  40.73 
 
 		 446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  40.09 
 
 		 425 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  40.6 
 
 		 425 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  39.36 
 
 		 429 aa  273  6e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  39.68 
 
 		 428 aa  272  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  39.77 
 
 		 425 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  39.86 
 
 		 425 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  35.88 
 
 		 436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  39.34 
 
 		 418 aa  270  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  35.86 
 
 		 422 aa  269  5.9999999999999995e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  39.32 
 
 		 441 aa  270  5.9999999999999995e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  39.81 
 
 		 418 aa  269  7e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  39.53 
 
 		 425 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  37.91 
 
 		 418 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  37.91 
 
 		 418 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  37.91 
 
 		 418 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  40.48 
 
 		 424 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  37.91 
 
 		 418 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  37.76 
 
 		 432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  38.94 
 
 		 416 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  38.36 
 
 		 414 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  37.68 
 
 		 418 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3460  glutamyl-tRNA reductase  38.61 
 
 		 426 aa  267  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000782916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  40.71 
 
 		 422 aa  266  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  37.64 
 
 		 426 aa  266  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  37.29 
 
 		 420 aa  266  8e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  38.15 
 
 		 418 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  38.15 
 
 		 418 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  38.15 
 
 		 418 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  38.15 
 
 		 418 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  38.35 
 
 		 422 aa  265  8.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  38.15 
 
 		 418 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  38.15 
 
 		 418 aa  265  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  34.1 
 
 		 444 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  39.33 
 
 		 419 aa  265  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  38.15 
 
 		 418 aa  265  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  38.15 
 
 		 418 aa  265  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  38.15 
 
 		 418 aa  265  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  37.95 
 
 		 416 aa  264  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  38.76 
 
 		 421 aa  264  2e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  38.37 
 
 		 416 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2461  glutamyl-tRNA reductase  39.44 
 
 		 420 aa  263  6e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000933086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2067  glutamyl-tRNA reductase  39.44 
 
 		 420 aa  263  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.85694e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  37.79 
 
 		 443 aa  263  6.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  38.94 
 
 		 440 aa  263  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  37.79 
 
 		 443 aa  263  6.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  38.31 
 
 		 435 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  38.61 
 
 		 416 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1855  glutamyl-tRNA reductase  38.39 
 
 		 418 aa  261  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163682  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  38.61 
 
 		 416 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  38.61 
 
 		 416 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3127  glutamyl-tRNA reductase  36.45 
 
 		 416 aa  261  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000225636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  38.61 
 
 		 416 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3686  glutamyl-tRNA reductase  36.93 
 
 		 416 aa  260  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  0.509552 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  37.17 
 
 		 443 aa  259  6e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  35.71 
 
 		 438 aa  259  7e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>