More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1244 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  100 
 
 
283 aa  573  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  74.18 
 
 
279 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  72.46 
 
 
279 aa  418  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  58.76 
 
 
274 aa  301  7.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  45.39 
 
 
277 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  45.39 
 
 
277 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  45.13 
 
 
276 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  45.02 
 
 
277 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  45.99 
 
 
372 aa  225  7e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  41.67 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  41.79 
 
 
280 aa  218  8.999999999999998e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  37.81 
 
 
311 aa  218  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  39.35 
 
 
278 aa  208  8e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  39.78 
 
 
303 aa  206  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  43.38 
 
 
272 aa  206  4e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  44.28 
 
 
355 aa  204  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  40.22 
 
 
365 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  43.7 
 
 
365 aa  200  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  42.7 
 
 
355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  40.74 
 
 
371 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  40.74 
 
 
371 aa  198  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  42.7 
 
 
386 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40 
 
 
373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.37 
 
 
371 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.81 
 
 
362 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  39.34 
 
 
359 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.99 
 
 
358 aa  192  4e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  41.7 
 
 
361 aa  192  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  40.96 
 
 
359 aa  192  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  40.49 
 
 
280 aa  191  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.99 
 
 
358 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  39.11 
 
 
364 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.63 
 
 
358 aa  190  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  39.11 
 
 
367 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.75 
 
 
364 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  39.11 
 
 
364 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  38.97 
 
 
359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  40.22 
 
 
358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  45.02 
 
 
275 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  38.38 
 
 
364 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  38.75 
 
 
364 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  41.91 
 
 
359 aa  189  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  38.75 
 
 
364 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  38.75 
 
 
365 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  38.38 
 
 
364 aa  188  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  40.14 
 
 
706 aa  188  7e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  41.24 
 
 
382 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  37.73 
 
 
373 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  42.14 
 
 
371 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  38.38 
 
 
365 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  39.34 
 
 
371 aa  186  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  42.8 
 
 
355 aa  186  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  41.54 
 
 
359 aa  185  7e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  37.19 
 
 
286 aa  185  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  38.01 
 
 
356 aa  184  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40.51 
 
 
387 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  42.44 
 
 
367 aa  183  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  39.26 
 
 
356 aa  183  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.83 
 
 
358 aa  182  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  39.71 
 
 
287 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.46 
 
 
368 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  37.36 
 
 
382 aa  181  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  37.5 
 
 
362 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42.8 
 
 
360 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1186  prephenate dehydratase  38.83 
 
 
393 aa  178  9e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42.8 
 
 
360 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42.8 
 
 
360 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42.8 
 
 
360 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42.8 
 
 
360 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42.8 
 
 
360 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42.8 
 
 
360 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1204  chorismate mutase  38.83 
 
 
393 aa  177  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42.8 
 
 
360 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  42.65 
 
 
306 aa  177  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  40.29 
 
 
418 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  41.01 
 
 
288 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  41.01 
 
 
288 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  37 
 
 
358 aa  176  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  37.64 
 
 
402 aa  176  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  37.13 
 
 
359 aa  176  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  38.06 
 
 
296 aa  175  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  43.91 
 
 
360 aa  175  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  40.44 
 
 
379 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  40.81 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.11 
 
 
358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  33.94 
 
 
271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  39.19 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  39.11 
 
 
358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  43.54 
 
 
360 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08570  prephenate dehydratase  38.08 
 
 
286 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  38.49 
 
 
305 aa  172  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  38.24 
 
 
381 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  38.81 
 
 
413 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  42.59 
 
 
363 aa  170  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4522  prephenate dehydratase  37.99 
 
 
318 aa  170  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1284  prephenate dehydratase  35.82 
 
 
295 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000630901  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  36.56 
 
 
326 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  35.9 
 
 
385 aa  169  5e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  37.64 
 
 
374 aa  169  5e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  36.33 
 
 
327 aa  169  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>