96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1195 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1195  ribonuclease P protein component  100 
 
 
135 aa  263  5.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000104376  decreased coverage  0.00023065 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1424  ribonuclease P protein component  52.99 
 
 
122 aa  98.2  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18331  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3966  ribonuclease P protein component  51.72 
 
 
122 aa  97.4  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142048  normal  0.0834112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  46.09 
 
 
123 aa  96.7  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  38.83 
 
 
121 aa  76.6  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  34.29 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  26.32 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  27.93 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  31.53 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  30.3 
 
 
109 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  28.93 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  40.54 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  35.71 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  41.03 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  28.04 
 
 
119 aa  57.4  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  30 
 
 
121 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  37.25 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  28.7 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  34.15 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  31.53 
 
 
125 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  31.53 
 
 
125 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  25 
 
 
107 aa  55.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  35.29 
 
 
137 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  35.29 
 
 
137 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  28.85 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  27.83 
 
 
126 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  26.55 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  25 
 
 
121 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  22.52 
 
 
115 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  22.52 
 
 
115 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  21.62 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  21.62 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  22.52 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  21.62 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  21.62 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  22.52 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  21.62 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  21.62 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  25 
 
 
131 aa  50.1  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0167  ribonuclease P  32.74 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00183081  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  22.41 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  27.52 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  40.58 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  22.94 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  28.18 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  32.38 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  41.94 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  40 
 
 
227 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  26.55 
 
 
119 aa  47.4  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3123  ribonuclease P protein component  31.87 
 
 
108 aa  47.4  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000870513  hitchhiker  0.0000000610775 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  40.32 
 
 
133 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  32.29 
 
 
115 aa  45.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  60.61 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  27.83 
 
 
127 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  41.38 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  34.86 
 
 
154 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5376  ribonuclease P protein  33.33 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827192  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  40.32 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  26.47 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  23.08 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  25.89 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  24.8 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  40.68 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  33.93 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  26.14 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  26.14 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  28.33 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  36.47 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  36.23 
 
 
93 aa  43.9  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  42.86 
 
 
189 aa  43.5  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  41.38 
 
 
129 aa  43.5  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  18.52 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5080  ribonuclease P protein component  35.87 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  34.51 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  37.31 
 
 
145 aa  41.6  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  31.86 
 
 
125 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  33.01 
 
 
119 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  41.1 
 
 
116 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  33.01 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000140717  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  35.71 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  30.56 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3777  ribonuclease P  34.91 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000556747  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  25 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  34.25 
 
 
240 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  27 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0006  ribonuclease P  33.96 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3868  ribonuclease P  33.96 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000277263  unclonable  0.00000245558 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2523  ribonuclease P protein component  35 
 
 
93 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0265349  hitchhiker  0.0000065266 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03486  ribonuclease P protein component  35.42 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1368  ribonuclease P protein component  41.03 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.778952  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0857  ribonuclease P protein component  35.71 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4382  ribonuclease P  33.02 
 
 
118 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000348711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4327  ribonuclease P  33.02 
 
 
118 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000794478  unclonable  0.00000000000188803 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4381  ribonuclease P  33.02 
 
 
118 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000190839  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4523  ribonuclease P  33.02 
 
 
118 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000021378  hitchhiker  0.000108776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>