More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1186 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 
799 aa  1650    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1010  CRISPR-associated helicase Cas3  40.34 
 
 
859 aa  500  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.445271  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  27.36 
 
 
850 aa  171  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  31.48 
 
 
566 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  30.16 
 
 
779 aa  107  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  29.69 
 
 
781 aa  106  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  31.47 
 
 
780 aa  106  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.78 
 
 
492 aa  106  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  25.55 
 
 
828 aa  105  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  28.07 
 
 
763 aa  103  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  28.92 
 
 
726 aa  102  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2279  CRISPR-associated helicase Cas3  27.27 
 
 
548 aa  97.1  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  26.81 
 
 
741 aa  96.3  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1134  CRISPR-associated helicase Cas3  29.21 
 
 
566 aa  96.7  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0626867  hitchhiker  0.000000190446 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  26.96 
 
 
741 aa  95.1  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  29.23 
 
 
775 aa  94.4  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  24.64 
 
 
764 aa  93.6  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  26.76 
 
 
744 aa  92.4  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  29.7 
 
 
783 aa  90.9  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  27.04 
 
 
750 aa  90.5  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  28.65 
 
 
917 aa  88.2  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  23.63 
 
 
736 aa  86.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1268  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.69 
 
 
488 aa  85.9  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0968245 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  27.1 
 
 
804 aa  84.7  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  26.13 
 
 
778 aa  84.7  0.000000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0428  CRISPR-associated helicase Cas3  28.54 
 
 
897 aa  84.3  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752021  normal  0.154756 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  27.41 
 
 
729 aa  84.3  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  26.89 
 
 
795 aa  83.6  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  42.5 
 
 
843 aa  82.4  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  24.41 
 
 
737 aa  81.6  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1525  CRISPR-associated helicase Cas3  24.43 
 
 
582 aa  80.1  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  23.69 
 
 
807 aa  80.1  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  27.39 
 
 
1027 aa  80.5  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  26.76 
 
 
801 aa  80.5  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  25.47 
 
 
888 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  27.09 
 
 
729 aa  79.7  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  31.37 
 
 
885 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0941  CRISPR-associated helicase Cas3  30.69 
 
 
933 aa  79.7  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156849  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  26.34 
 
 
921 aa  79  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4562  CRISPR-associated helicase Cas3  24.26 
 
 
914 aa  78.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  38.21 
 
 
948 aa  77.4  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  24.85 
 
 
750 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  28.28 
 
 
701 aa  76.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  24.11 
 
 
765 aa  75.9  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  29.01 
 
 
892 aa  75.9  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  26.24 
 
 
823 aa  75.5  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  25.63 
 
 
837 aa  75.5  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  40.4 
 
 
929 aa  75.1  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  25.27 
 
 
888 aa  75.1  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  30.87 
 
 
854 aa  74.3  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  24.87 
 
 
887 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  24.87 
 
 
887 aa  73.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2649  CRISPR-associated helicase Cas3  27.14 
 
 
873 aa  73.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00423349  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  25.6 
 
 
888 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  26.65 
 
 
762 aa  72.4  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0778  CRISPR-associated helicase Cas3  27.91 
 
 
888 aa  72.4  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2961  DEAD/H associated domain protein  27.47 
 
 
819 aa  72.4  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136531 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  35.43 
 
 
776 aa  72  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  22.82 
 
 
800 aa  72  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0308  CRISPR-associated helicase Cas3  36.03 
 
 
777 aa  71.6  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  26.87 
 
 
836 aa  71.2  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01735  ATP-dependent helicase  26.26 
 
 
833 aa  71.2  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3063  CRISPR-associated helicase Cas3  27.09 
 
 
885 aa  71.2  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.949207  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  28.64 
 
 
906 aa  70.9  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0340  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.03 
 
 
885 aa  70.5  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  25.06 
 
 
919 aa  70.5  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  23.96 
 
 
832 aa  70.5  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  26.39 
 
 
912 aa  70.5  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  24.47 
 
 
784 aa  70.5  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0778  CRISPR-associated helicase Cas3  26.23 
 
 
887 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  27.24 
 
 
811 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3341  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.65 
 
 
751 aa  70.1  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127091  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  25.57 
 
 
883 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  24.46 
 
 
778 aa  68.9  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  27.47 
 
 
827 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  23.32 
 
 
800 aa  69.3  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  25 
 
 
801 aa  68.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0480  CRISPR-associated helicase Cas3  25.92 
 
 
868 aa  69.3  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227979  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1593  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.5 
 
 
944 aa  68.2  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0156673  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  27.27 
 
 
887 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0475  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  25.51 
 
 
717 aa  67.8  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  27.61 
 
 
922 aa  67  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0175  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.08 
 
 
920 aa  67  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  38.1 
 
 
962 aa  67.4  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2808  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  25.71 
 
 
933 aa  67.4  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  23.62 
 
 
905 aa  67.4  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00865  CRISPR-associated helicase Cas3  23.22 
 
 
915 aa  66.6  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.798987  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4478  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25 
 
 
967 aa  65.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2889  CRISPR-associated helicase Cas3  25.82 
 
 
899 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0793506  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  25.07 
 
 
899 aa  65.5  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0224  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.25 
 
 
897 aa  65.1  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249114  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0029  DEAD/H associated  24.27 
 
 
839 aa  65.1  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28840  putative helicase  24.45 
 
 
736 aa  65.1  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474734  decreased coverage  0.00000000117417 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.5 
 
 
724 aa  64.7  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4014  CRISPR-associated helicase Cas3  25.82 
 
 
899 aa  64.7  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.317175  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02701  crispr-associated helicase Cas3 domain protein  26.04 
 
 
722 aa  64.7  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0428162  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0936  CRISPR-associated helicase Cas3  26.75 
 
 
881 aa  64.3  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0922  CRISPR-associated helicase Cas3  26.33 
 
 
860 aa  64.3  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226971  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.51 
 
 
801 aa  64.3  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.536438 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.08 
 
 
892 aa  63.9  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>