141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0961 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0961  putative transcriptional regulator  100 
 
 
225 aa  456  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.189509  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0303  transcriptional regulator, TrmB  52.22 
 
 
209 aa  221  7e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0707  transcriptional regulator, TrmB  52.22 
 
 
209 aa  218  8.999999999999998e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0414  putative transcriptional regulator  42.03 
 
 
220 aa  161  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.802259  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3070  transcriptional regulator, TrmB  32.51 
 
 
215 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272047 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2493  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
211 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0117208  normal  0.769487 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3238  putative transcriptional regulator  33.5 
 
 
211 aa  101  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1570  putative transcriptional regulator  35.03 
 
 
219 aa  99.4  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.417601  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0414  putative transcriptional regulator  29.49 
 
 
219 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0425  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.973468  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3451  putative transcriptional regulator  29.76 
 
 
217 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  hitchhiker  0.00000000543336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3726  putative transcriptional regulator  32.29 
 
 
212 aa  95.1  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110577  hitchhiker  0.00164762 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1733  transcriptional regulator  30.81 
 
 
214 aa  88.2  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.86463 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3558  putative transcriptional regulator  28.14 
 
 
210 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0136  transcriptional regulator, DeoR family  28.99 
 
 
210 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.790585  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5103  transcriptional regulator, DeoR family  28.99 
 
 
210 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2543  putative transcriptional regulator  34.43 
 
 
199 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0018  putative transcriptional regulator  27.36 
 
 
214 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4354  transcriptional regulator  27.98 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4997  putative transcriptional regulator  26.42 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4828  DeoR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00756639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4669  DeoR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5193  DeoR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.076054  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2786  putative transcriptional regulator  31.63 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5064  transcriptional regulator, DeoR family  28.4 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5097  DeoR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4686  DeoR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000645179  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0915  putative transcriptional regulator  30 
 
 
218 aa  82  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.949391 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5102  transcriptional regulator, DeoR family  27.81 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2175  transcriptional regulator TrmB  31.69 
 
 
203 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168136  normal  0.574645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0423  transcriptional regulator  30.7 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956901  normal  0.107177 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4136  hypothetical protein  26.89 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3788  hypothetical protein  26.89 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4781  putative transcriptional regulator  25.13 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2681  putative transcriptional regulator  27.69 
 
 
223 aa  79  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381379  normal  0.0939386 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4801  putative transcriptional regulator  28.22 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472031 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2387  transcriptional regulator protein-like protein  28.65 
 
 
250 aa  79  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.328356  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13330  predicted transcriptional regulator  32.09 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.763143  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14610  predicted transcriptional regulator  30.8 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.330701  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2060  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000547125  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03001  regulatory proteins, AsnC family protein  25.89 
 
 
215 aa  75.9  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.764788 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0307  putative transcriptional regulator  31.05 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.519243  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1629  putative transcriptional regulator  28.88 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.346983  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1166  putative transcriptional regulator  32.95 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21960  predicted transcriptional regulator  29.67 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153457  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2819  putative transcriptional regulator  33.17 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4139  putative transcriptional regulator  25.38 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.936463  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0795  putative transcriptional regulator  28.71 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2549  transcriptional regulator  31.65 
 
 
240 aa  71.6  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12553  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1139  putative transcriptional regulator  27.93 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.140272  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4804  putative transcriptional regulator  27.87 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000646734 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0077  transcriptional regulator  27.86 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.53122  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1289  hypothetical protein  27.86 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2275  putative transcriptional regulator  32.16 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171437  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1134  putative transcriptional regulator  30.16 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal  0.0484804 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1043  hypothetical protein  28 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0030  hypothetical protein  28 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0384  hypothetical protein  28 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1579  hypothetical protein  28 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145631  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1494  hypothetical protein  28 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1200  hypothetical protein  28 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108281  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2341  putative transcriptional regulator  33.17 
 
 
270 aa  68.6  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.265482 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0028  transcriptional regulator  28.5 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.572077  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2262  putative transcriptional regulator  28.86 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0091  hypothetical protein  26.87 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2284  transcriptional regulator  28.96 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.123055 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0435  putative transcriptional regulator  27.81 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.341746  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3584  hypothetical protein  26.26 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0896  putative transcriptional regulator  25.37 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610602 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2998  transcriptional regulator  26.26 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00441752  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3079  transcriptional regulator  26.26 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0625169  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2239  hypothetical protein  26.02 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00716  hypothetical protein  24.74 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1452  putative transcriptional regulator  26.09 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293298  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2510  putative transcriptional regulator  29.08 
 
 
236 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1011  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 
207 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2441  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 
244 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.125946 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1080  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1113  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 
207 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  24.76 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  25.37 
 
 
231 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  25.37 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3176  transcriptional regulator  26.26 
 
 
206 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2918  putative transcriptional regulator  33.51 
 
 
265 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  25.37 
 
 
231 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  25.37 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  24.88 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2102  transcriptional regulator  30.58 
 
 
289 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.697253  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  29.71 
 
 
222 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2382  regulatory protein ArsR  26.18 
 
 
274 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.307498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  25.37 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2063  putative transcriptional regulator  32 
 
 
280 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001755  predicted transcriptional regulator  24.23 
 
 
206 aa  63.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0263515  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1711  putative transcriptional regulator  28.36 
 
 
210 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.42173  normal  0.540015 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3278  putative transcriptional regulator  26.29 
 
 
207 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0971152 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  24.88 
 
 
231 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1844  putative transcriptional regulator  28.64 
 
 
271 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000755788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  25.73 
 
 
231 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1048  putative transcriptional regulator  25.76 
 
 
207 aa  62.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  24.88 
 
 
231 aa  62  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>