270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0941 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 137 aa  265  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  59.71 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  57.04 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  54.35 
 
 		 138 aa  143  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  53.9 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  52.82 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  52.82 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  51.82 
 
 		 138 aa  140  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  51.82 
 
 		 137 aa  140  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  53.85 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  51.09 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  52.82 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  52.11 
 
 		 139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3208  large conductance mechanosensitive channel protein  55.56 
 
 		 141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0654251  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  50.71 
 
 		 142 aa  137  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  55.07 
 
 		 140 aa  137  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  52.55 
 
 		 134 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  46.72 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  54.01 
 
 		 163 aa  134  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  56.62 
 
 		 143 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  49.29 
 
 		 141 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3512  large conductance mechanosensitive channel protein  56.52 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.178106  normal  0.287508 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  53.68 
 
 		 143 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  49.29 
 
 		 141 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  51.43 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0929  large-conductance mechanosensitive channel  53.96 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  54.48 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  55.24 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  50.36 
 
 		 125 aa  131  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 155 aa  130  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  53.96 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 163 aa  127  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1030  large conductance mechanosensitive channel protein  48.95 
 
 		 139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184236  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  52.52 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  51.08 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  49.26 
 
 		 123 aa  124  6e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  50.36 
 
 		 136 aa  123  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  50.36 
 
 		 136 aa  123  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  50.36 
 
 		 136 aa  123  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  50.36 
 
 		 136 aa  123  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 136 aa  123  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  50.36 
 
 		 136 aa  123  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  50.36 
 
 		 136 aa  123  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  50.36 
 
 		 136 aa  123  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  50.36 
 
 		 136 aa  123  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  51.41 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  49.3 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  51.8 
 
 		 142 aa  121  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  49.14 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1343  large conductance mechanosensitive channel protein  51.8 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.954232  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  48.09 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  46.81 
 
 		 151 aa  118  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  47.1 
 
 		 137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  48.23 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  48.57 
 
 		 137 aa  116  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  47.1 
 
 		 154 aa  116  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  48.94 
 
 		 148 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  54.13 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  47.83 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1961  mechanosensitive channel  46.04 
 
 		 141 aa  114  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  50.43 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  47.1 
 
 		 139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  47.22 
 
 		 141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3094  large-conductance mechanosensitive channel  49.65 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.350384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  43.51 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0848  large-conductance mechanosensitive channel  47.06 
 
 		 137 aa  114  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  49.57 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0622  large conductance mechanosensitive channel protein  52.34 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0241  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  47.41 
 
 		 137 aa  113  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3455  large conductance mechanosensitive channel protein  43.75 
 
 		 142 aa  113  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0277457  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0172  large conductance mechanosensitive channel protein  53.6 
 
 		 147 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  44.53 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  52.08 
 
 		 144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  46.38 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  47.52 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2455  large-conductance mechanosensitive channel  49.64 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4749  large conductance mechanosensitive channel protein  59.26 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  43.97 
 
 		 137 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1262  large conductance mechanosensitive channel protein  50.39 
 
 		 148 aa  110  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  43.88 
 
 		 132 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  44.14 
 
 		 143 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  45 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  43.97 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  46.32 
 
 		 121 aa  110  9e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  43.45 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  43.45 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  43.48 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  44.93 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  43.45 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  43.45 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  43.45 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  43.45 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  43.45 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  43.7 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  44.83 
 
 		 199 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0386  large conductance mechanosensitive channel protein  45.71 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.242536 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3697  large-conductance mechanosensitive channel  49.29 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  43.97 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>