More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0925 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 629 aa  1287    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  68.77 
 
 		 618 aa  827    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  45.95 
 
 		 620 aa  530  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  49.31 
 
 		 891 aa  243  7.999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3121  hypothetical protein  44.56 
 
 		 792 aa  236  7e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2358  hypothetical protein  45.26 
 
 		 769 aa  236  9e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.916043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3752  hypothetical protein  44.44 
 
 		 773 aa  221  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000190776  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0935  peptidase domain-containing protein  45.52 
 
 		 758 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  42.52 
 
 		 710 aa  214  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  45.42 
 
 		 709 aa  213  9e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3007  hypothetical protein  44.69 
 
 		 576 aa  211  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  40.94 
 
 		 717 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000836331  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1576  peptidase domain-containing protein  43.7 
 
 		 760 aa  208  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.599229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3913  hypothetical protein  36.88 
 
 		 289 aa  173  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3724  hypothetical protein  38.1 
 
 		 289 aa  167  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  35.65 
 
 		 510 aa  161  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  36.76 
 
 		 567 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  38.24 
 
 		 572 aa  105  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  35.71 
 
 		 316 aa  105  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  35.62 
 
 		 292 aa  103  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  30.86 
 
 		 427 aa  101  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  36.16 
 
 		 446 aa  97.4  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  31.71 
 
 		 450 aa  96.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.17 
 
 		 407 aa  95.9  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  34.88 
 
 		 450 aa  95.5  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  36.63 
 
 		 432 aa  94.7  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  35.23 
 
 		 434 aa  94.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  31.71 
 
 		 435 aa  93.6  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.17 
 
 		 407 aa  93.2  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  32.23 
 
 		 432 aa  92.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  34.04 
 
 		 434 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  32.86 
 
 		 721 aa  91.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  36.03 
 
 		 615 aa  91.3  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  33.76 
 
 		 434 aa  90.5  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.75 
 
 		 430 aa  90.5  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  33.12 
 
 		 434 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  31.86 
 
 		 461 aa  89.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  31.49 
 
 		 298 aa  89  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  31.68 
 
 		 443 aa  88.2  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  35.29 
 
 		 436 aa  88.6  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  27.36 
 
 		 437 aa  87.8  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  33.12 
 
 		 434 aa  88.2  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  33.53 
 
 		 403 aa  87.4  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  25.62 
 
 		 437 aa  86.3  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  25.62 
 
 		 440 aa  86.7  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  30.81 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_014148  Plim_3729  WD40 domain protein beta Propeller  40 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.135548  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  29.56 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  35.77 
 
 		 451 aa  85.1  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  29.56 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  29.56 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  39.42 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  29.68 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  32.2 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  33.77 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  29.68 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.4 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.42 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  28.34 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  33.96 
 
 		 428 aa  83.2  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  29.26 
 
 		 437 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  51.76 
 
 		 646 aa  83.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  30.1 
 
 		 454 aa  82.4  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  38.69 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  30.24 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  32.64 
 
 		 1005 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  30.73 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  29.7 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  33.77 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  29.11 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  28.64 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  33.54 
 
 		 424 aa  80.1  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 439 aa  80.1  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  33.77 
 
 		 442 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  33.77 
 
 		 442 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  35.42 
 
 		 439 aa  80.1  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  33.77 
 
 		 442 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  33.77 
 
 		 442 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  29.51 
 
 		 429 aa  80.5  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  33.77 
 
 		 442 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0888  translocation protein TolB  25.93 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  33.99 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  33.99 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  33.99 
 
 		 463 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  33.99 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  33.99 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  33.99 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  29.27 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  33.99 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  30.92 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.55 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  33.99 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  36.23 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  29.46 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  33.99 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.92 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  33.77 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1238  translocation protein TolB  32.68 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00586154  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3484  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.18 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.774244  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>