21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0654 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0654  O-antigen polymerase  100 
 
 
480 aa  933    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4391  O-antigen polymerase  55.67 
 
 
494 aa  451  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6355  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0733  O-antigen polymerase  56.7 
 
 
485 aa  443  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480414  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4465  O-antigen polymerase  47.83 
 
 
479 aa  328  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000989096  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3537  membrane protein PslJ  30.96 
 
 
471 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0975897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3309  hypothetical protein  28.09 
 
 
471 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4279  hypothetical protein  31.94 
 
 
480 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.95109  hitchhiker  0.00017763 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  25.4 
 
 
467 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  22.78 
 
 
540 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  24.21 
 
 
471 aa  54.3  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  24.63 
 
 
492 aa  53.9  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0845  hypothetical protein  26.47 
 
 
537 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  27.48 
 
 
443 aa  50.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  23.26 
 
 
436 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4494  hypothetical protein  26.88 
 
 
447 aa  47.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00401546  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  23.27 
 
 
393 aa  47  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  26.81 
 
 
457 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  26.81 
 
 
457 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  23.13 
 
 
461 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  25.79 
 
 
475 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  26.67 
 
 
498 aa  43.1  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>