More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0647 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
944 aa  1906    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
1207 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
933 aa  253  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  38.59 
 
 
762 aa  249  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  30.69 
 
 
1629 aa  237  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
677 aa  235  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.49 
 
 
1021 aa  233  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 
758 aa  230  7e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
711 aa  227  6e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
719 aa  225  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.688425  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
754 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 
755 aa  222  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0485  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
726 aa  221  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0662755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 
799 aa  219  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
885 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.72 
 
 
1064 aa  218  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
763 aa  217  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.508031  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.07 
 
 
953 aa  214  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 
755 aa  213  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
1319 aa  211  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 
965 aa  211  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 
687 aa  210  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 
1362 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1160  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.78 
 
 
829 aa  209  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.380489 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.92 
 
 
839 aa  207  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  32.57 
 
 
1361 aa  207  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.82 
 
 
1352 aa  206  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 
1692 aa  205  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0857  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.67 
 
 
698 aa  202  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0897898 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 
827 aa  202  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 
974 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.24 
 
 
1611 aa  201  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.32 
 
 
916 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.85 
 
 
1043 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
695 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
1236 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
1236 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
1236 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  31.93 
 
 
1188 aa  196  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
725 aa  197  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 
975 aa  196  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  25.5 
 
 
1331 aa  194  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 
625 aa  194  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
718 aa  194  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
1060 aa  194  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.92 
 
 
1514 aa  194  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 
1234 aa  194  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.92 
 
 
1514 aa  194  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  41.57 
 
 
1026 aa  193  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  42.57 
 
 
617 aa  193  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
2161 aa  193  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.02 
 
 
1002 aa  193  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
2153 aa  192  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  31.37 
 
 
998 aa  193  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 
1238 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4104  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 
557 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 
823 aa  191  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 
1238 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  30.88 
 
 
1427 aa  191  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 
1238 aa  191  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 
1238 aa  191  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  30.62 
 
 
923 aa  191  8e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 
1316 aa  190  8e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 
503 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 
1042 aa  189  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 
991 aa  189  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0334  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
492 aa  188  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.091816  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
1039 aa  189  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.74 
 
 
1415 aa  188  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  36.53 
 
 
535 aa  187  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01227  two-component hybrid sensor and regulator  29.9 
 
 
699 aa  187  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
884 aa  187  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  28.55 
 
 
1135 aa  187  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0738  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.47 
 
 
925 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4049  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 
553 aa  187  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.92854 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.45 
 
 
833 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
701 aa  186  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 
815 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  31.06 
 
 
1001 aa  185  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
639 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
899 aa  185  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
899 aa  184  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
639 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 
556 aa  184  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  31.7 
 
 
1201 aa  184  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
634 aa  184  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 
639 aa  184  9.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.37 
 
 
1291 aa  183  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.75 
 
 
1659 aa  183  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
444 aa  182  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 
640 aa  182  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  30.16 
 
 
785 aa  183  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
453 aa  183  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 
858 aa  182  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.74 
 
 
1260 aa  182  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.62 
 
 
1267 aa  182  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.78 
 
 
956 aa  182  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.31 
 
 
1142 aa  182  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 
977 aa  181  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 
1390 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>