280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0569 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  85.79 
 
 
779 aa  1386    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
781 aa  1600    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  52.62 
 
 
804 aa  794    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  76.79 
 
 
783 aa  1229    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  37.28 
 
 
795 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  32.8 
 
 
741 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1639  CRISPR-associated helicase Cas3  38.3 
 
 
791 aa  364  3e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  31.29 
 
 
750 aa  359  9.999999999999999e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  30.43 
 
 
811 aa  242  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  30.48 
 
 
1027 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  30.93 
 
 
801 aa  233  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  33.85 
 
 
729 aa  201  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  28.11 
 
 
726 aa  200  7e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  24.97 
 
 
729 aa  195  3e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  29.88 
 
 
762 aa  192  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  25.28 
 
 
737 aa  185  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  28.15 
 
 
775 aa  182  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  27.44 
 
 
763 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  22.93 
 
 
764 aa  174  7.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  27.75 
 
 
744 aa  173  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  26.78 
 
 
741 aa  165  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  27.88 
 
 
750 aa  165  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  27.68 
 
 
917 aa  160  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  23.15 
 
 
736 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  27.12 
 
 
907 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  28.11 
 
 
888 aa  121  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  28.27 
 
 
888 aa  120  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.324 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  27.68 
 
 
888 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  32.35 
 
 
887 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  29.43 
 
 
912 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  28.49 
 
 
823 aa  114  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  29.57 
 
 
921 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  23.92 
 
 
807 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.56 
 
 
892 aa  110  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  27.38 
 
 
948 aa  110  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2629  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.97 
 
 
971 aa  110  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.174712  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  31.48 
 
 
899 aa  107  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  29.67 
 
 
799 aa  106  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  21.78 
 
 
778 aa  105  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  29.69 
 
 
905 aa  104  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  26.78 
 
 
944 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  28.3 
 
 
922 aa  103  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  30.89 
 
 
901 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  28.12 
 
 
783 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  25.46 
 
 
883 aa  101  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  33.51 
 
 
885 aa  101  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  32.39 
 
 
854 aa  101  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  30.77 
 
 
919 aa  99.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  28.73 
 
 
860 aa  99  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5415  CRISPR-associated helicase Cas3  31.64 
 
 
897 aa  98.6  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  29.92 
 
 
906 aa  98.6  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  30.99 
 
 
899 aa  98.6  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3591  CRISPR-associated helicase Cas3  29.65 
 
 
912 aa  98.2  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.355005  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2158  CRISPR-associated helicase Cas3  27.99 
 
 
594 aa  97.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  30.43 
 
 
837 aa  96.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  28.34 
 
 
892 aa  96.3  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2438  CRISPR-associated helicase Cas3  26.1 
 
 
908 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  29.22 
 
 
701 aa  94.7  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0912  CRISPR-associated helicase Cas3  30.7 
 
 
871 aa  95.1  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00865  CRISPR-associated helicase Cas3  26.36 
 
 
915 aa  94.7  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.798987  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  26.85 
 
 
778 aa  94  9e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1593  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.93 
 
 
944 aa  93.6  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0156673  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2889  CRISPR-associated helicase Cas3  27.98 
 
 
899 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0793506  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0651  CRISPR-associated helicase Cas3  25.3 
 
 
927 aa  92.4  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522649  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  25.2 
 
 
836 aa  92.4  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1010  CRISPR-associated helicase Cas3  29.08 
 
 
859 aa  91.7  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.445271  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0955  CRISPR-associated helicase Cas3  24.73 
 
 
871 aa  91.7  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3063  CRISPR-associated helicase Cas3  28.3 
 
 
885 aa  91.3  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.949207  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0657  CRISPR-associated helicase Cas3  27.17 
 
 
732 aa  90.9  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  29.12 
 
 
904 aa  90.5  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  23.39 
 
 
776 aa  90.5  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4014  CRISPR-associated helicase Cas3  27.98 
 
 
899 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.317175  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0428  CRISPR-associated helicase Cas3  28.21 
 
 
897 aa  88.6  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752021  normal  0.154756 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0922  CRISPR-associated helicase Cas3  24.62 
 
 
860 aa  88.6  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  29.19 
 
 
1540 aa  88.6  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0498  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.52 
 
 
724 aa  87.4  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  22 
 
 
800 aa  85.9  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  27.34 
 
 
854 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  25.13 
 
 
827 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  24.43 
 
 
651 aa  85.9  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  28.17 
 
 
929 aa  85.5  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  28.61 
 
 
832 aa  85.5  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0175  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.85 
 
 
920 aa  84.7  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  27.07 
 
 
887 aa  84.7  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  27.15 
 
 
887 aa  84.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.57 
 
 
962 aa  84  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  26.46 
 
 
850 aa  84  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  28.05 
 
 
740 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2343  CRISPR-associated helicase Cas3  24.42 
 
 
879 aa  82.8  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0480  CRISPR-associated helicase Cas3  28.5 
 
 
868 aa  82  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227979  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  24.93 
 
 
829 aa  81.3  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0936  CRISPR-associated helicase Cas3  27.36 
 
 
881 aa  80.9  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1436  CRISPR-associated helicase Cas3  26.01 
 
 
667 aa  80.9  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1601  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.96 
 
 
970 aa  80.9  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0436721  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02701  crispr-associated helicase Cas3 domain protein  23.81 
 
 
722 aa  80.9  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0428162  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  23.36 
 
 
733 aa  80.5  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.99 
 
 
492 aa  80.1  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1125  CRISPR-associated helicase Cas3  22.25 
 
 
880 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00422902  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  22.34 
 
 
765 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1002  metal dependent phosphohydrolase  23.7 
 
 
731 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>