More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0540 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0540  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
395 aa  794    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1152  beta-lactamase domain protein  41.88 
 
 
395 aa  298  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000210846  decreased coverage  0.000000422487 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1187  beta-lactamase domain-containing protein  43.33 
 
 
393 aa  295  7e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0816  beta-lactamase domain-containing protein  45.54 
 
 
393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1282  rhodanese-like protein  37.34 
 
 
397 aa  225  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1932  beta-lactamase domain-containing protein  35.26 
 
 
403 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.516166  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2641  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
379 aa  188  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0673  metallo-beta-lactamase family protein  32.02 
 
 
376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00215478  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0739  metallo-beta-lactamase family protein  32.28 
 
 
376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000119995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0687  metallo-beta-lactamase family protein  32.28 
 
 
376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.879597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0777  metallo-beta-lactamase family protein  32.28 
 
 
376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0871  metallo-beta-lactamase family protein  32.55 
 
 
376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000195083 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0938  metallo-beta-lactamase family protein  31.87 
 
 
376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4505  metallo-beta-lactamase family protein  32.72 
 
 
378 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000320753 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0687  beta-lactamase domain-containing protein  32.55 
 
 
378 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.596111  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0831  metallo-beta-lactamase family protein  31.76 
 
 
376 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00416077  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  32.64 
 
 
375 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0867  metallo-beta-lactamase family protein  31.5 
 
 
376 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  29.26 
 
 
378 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0257  beta-lactamase domain protein  33.08 
 
 
397 aa  144  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4316  beta-lactamase domain protein  31.59 
 
 
397 aa  142  7e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558515  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2422  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 
400 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2930  beta-lactamase domain-containing protein  33.44 
 
 
378 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4261  beta-lactamase domain protein  28.76 
 
 
369 aa  129  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3702  Rhodanese domain protein  30.43 
 
 
397 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.418788  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3386  beta-lactamase domain protein  29.43 
 
 
428 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1375  beta-lactamase domain protein  30.79 
 
 
390 aa  122  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4110  Rhodanese domain protein  29.53 
 
 
370 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0612  beta-lactamase domain protein  30.2 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4293  beta-lactamase domain protein  29.47 
 
 
376 aa  109  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3631  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 
374 aa  110  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.162031  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3034  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 
382 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3284  beta-lactamase domain-containing protein  31.32 
 
 
369 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  32.18 
 
 
489 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 
488 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.29 
 
 
456 aa  71.2  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  34.59 
 
 
462 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1046  Rhodanese domain protein  30.1 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  33.7 
 
 
470 aa  68.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 
471 aa  66.6  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  30.72 
 
 
457 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1299  metallo-beta-lactamase family protein  31.07 
 
 
237 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827065  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4317  putative metallo-beta-lactamase family protein  31.32 
 
 
214 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  30.43 
 
 
450 aa  64.3  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 
466 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  32.26 
 
 
244 aa  63.9  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  31.89 
 
 
233 aa  63.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  27.84 
 
 
442 aa  63.2  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  28.49 
 
 
467 aa  63.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  32 
 
 
464 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.89 
 
 
214 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  26.37 
 
 
471 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 
214 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  28.87 
 
 
463 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 
214 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 
214 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  29.89 
 
 
214 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  33.16 
 
 
470 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 
214 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 
214 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 
214 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 
214 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  26.32 
 
 
448 aa  62  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.19 
 
 
472 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3165  beta-lactamase domain protein  32.44 
 
 
421 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  27.69 
 
 
250 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 
214 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  27 
 
 
244 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.26 
 
 
471 aa  60.5  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  28.88 
 
 
470 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1429  Rhodanese domain protein  30.33 
 
 
401 aa  60.5  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  29.73 
 
 
237 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  32.68 
 
 
480 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 
459 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  28.8 
 
 
241 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 
453 aa  59.7  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 
243 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 
214 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  28.8 
 
 
214 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 
212 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.03 
 
 
453 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.67 
 
 
471 aa  58.9  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  41.46 
 
 
250 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  28.9 
 
 
450 aa  58.9  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  32.02 
 
 
467 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  30.93 
 
 
479 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.76 
 
 
502 aa  57.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  27 
 
 
214 aa  57.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  28.25 
 
 
472 aa  57  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 
470 aa  57.4  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  28.87 
 
 
214 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  25.11 
 
 
617 aa  57  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  26.71 
 
 
226 aa  56.6  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  30.53 
 
 
245 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  30 
 
 
248 aa  56.6  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  29.23 
 
 
214 aa  56.6  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  25.79 
 
 
246 aa  56.2  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 
459 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  31.85 
 
 
484 aa  56.2  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  27.8 
 
 
459 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>