37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0536 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0536  protein of unknown function DUF83  100 
 
 
170 aa  346  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513907  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2603  hypothetical protein  58.33 
 
 
170 aa  187  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.519513  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1816  hypothetical protein  58.11 
 
 
170 aa  164  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115857  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2838  hypothetical protein  54.36 
 
 
171 aa  161  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529444  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  39.64 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0305  CRISPR-associated protein Cas4  33.15 
 
 
323 aa  111  5e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1015  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.53 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.3 
 
 
210 aa  55.1  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  31.4 
 
 
200 aa  54.3  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  30.15 
 
 
214 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  33.61 
 
 
255 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  29.55 
 
 
228 aa  52  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  27.5 
 
 
196 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  27.5 
 
 
196 aa  51.2  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  28.29 
 
 
210 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  29.29 
 
 
206 aa  48.5  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  31.45 
 
 
190 aa  47.8  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  29.2 
 
 
199 aa  47.8  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  30.08 
 
 
204 aa  47.8  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0265039 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2270  CRISPR-associated protein Cas4  27.61 
 
 
201 aa  47.4  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.33 
 
 
193 aa  45.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.33 
 
 
190 aa  45.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  28.24 
 
 
216 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1930  hypothetical protein  24.79 
 
 
272 aa  44.7  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1603  hypothetical protein  32.73 
 
 
181 aa  44.3  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.73 
 
 
190 aa  44.3  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.71 
 
 
212 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  28.33 
 
 
196 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.66 
 
 
212 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.16 
 
 
211 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  25 
 
 
194 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  30.16 
 
 
218 aa  42.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  26.67 
 
 
212 aa  41.6  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  26.52 
 
 
215 aa  40.8  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  29.01 
 
 
558 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.02 
 
 
208 aa  40.8  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0553  hypothetical protein  25.62 
 
 
273 aa  40.8  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>