More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0513 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0513  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 269 aa  529  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3278  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  0.241519 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1846  extracellular solute-binding protein  43.68 
 
 		 277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.898841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3183  extracellular solute-binding protein  37.6 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.15 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.15 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.15 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.15 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  29.69 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.83 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.07 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.38 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.38 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  27.63 
 
 		 502 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  27.63 
 
 		 502 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.38 
 
 		 513 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.36 
 
 		 259 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18700  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  31.51 
 
 		 273 aa  96.3  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.7204  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 281 aa  96.3  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0375  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6986  extracellular solute-binding protein family 3  28.51 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 246 aa  93.2  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  26.67 
 
 		 260 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  29.02 
 
 		 263 aa  92  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  28 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  25.63 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  25.63 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  31.72 
 
 		 268 aa  90.1  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1050  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 286 aa  90.1  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875025  normal  0.0927945 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0429  extracellular solute-binding protein family 3  29.57 
 
 		 283 aa  90.1  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  30.04 
 
 		 247 aa  89.7  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0961  extracellular solute-binding protein family 3  26.95 
 
 		 258 aa  89.4  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.611577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  26.13 
 
 		 247 aa  89.4  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 246 aa  89.7  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.05 
 
 		 244 aa  89.4  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 244 aa  89.4  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 244 aa  89  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 283 aa  89  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 		 279 aa  89  8e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1455  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.81 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000239011  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  28.7 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.94 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24310  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  27.2 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 242 aa  87  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.68 
 
 		 264 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.33 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 271 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  21.18 
 
 		 263 aa  86.3  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  26.99 
 
 		 244 aa  85.5  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2600  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 252 aa  85.5  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1259  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3922  extracellular solute-binding protein family 3  27.88 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0949  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.9 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.2503  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  25.23 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1156  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.63 
 
 		 248 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0360  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.89 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000870142  hitchhiker  0.00010092 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1236  ABC-type amino acid transport system, periplasmic component  24.23 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  25.88 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2011  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.986691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  25.88 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1148  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.614659 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  27.31 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.68 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  25.23 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  25.23 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.25 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.24 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  25.23 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.32 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  26.75 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2345  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.949438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.23 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1863  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  25.44 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.32 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  27.8 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  25.44 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>