More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0476 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 286 aa  587  1e-166  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  59.12 
 
 		 291 aa  332  4e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  46.98 
 
 		 289 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.81 
 
 		 285 aa  259  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.15 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  35.84 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.67 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  31.23 
 
 		 270 aa  146  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.22 
 
 		 290 aa  142  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  32.56 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  34.48 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.26 
 
 		 289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.26 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2542  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.98 
 
 		 306 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2129  NifU domain-containing protein  35.85 
 
 		 294 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0750308  normal  0.014165 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2142  nitrogen-fixing NifU-like protein  35.22 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2188  NifU domain-containing protein  35.22 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2413  NifU domain-containing protein  32.09 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0708227  normal  0.256977 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3360  nitrogen-fixing NifU-like  38.4 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.595792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4600  nitrogen-fixing NifU-like  33.77 
 
 		 158 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 77 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  47.69 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.27 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  45.45 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  45.45 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  45.45 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  45.45 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  45.45 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  45.45 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  45.45 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  45.45 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.23 
 
 		 73 aa  66.2  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  45.45 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  45.45 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3815  hypothetical protein  30.07 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473897  normal  0.0339082 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  43.28 
 
 		 73 aa  65.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4593  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.78 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.67 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09103  apoptosis-inducing factor (Eurofung)  37.5 
 
 		 561 aa  65.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0266985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.67 
 
 		 86 aa  65.1  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6339  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.58 
 
 		 125 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.515952 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.65 
 
 		 73 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.61 
 
 		 106 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  43.48 
 
 		 72 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1109  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.08 
 
 		 88 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  42.86 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.93 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.9 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.31 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  46.88 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  50 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0398  NifU protein, putative  42.86 
 
 		 89 aa  62  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.939749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.5 
 
 		 74 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.19 
 
 		 79 aa  61.6  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.35 
 
 		 109 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2015  NifU domain-containing protein  42.86 
 
 		 86 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213209  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  49.18 
 
 		 75 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  42.42 
 
 		 80 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  48.28 
 
 		 103 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0419  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.86 
 
 		 86 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2526  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.7 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672374  normal  0.0193911 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  41.54 
 
 		 80 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  40.91 
 
 		 80 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  45.76 
 
 		 74 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  40.91 
 
 		 80 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  45.16 
 
 		 74 aa  60.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1782  NifU family protein  42.47 
 
 		 88 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.44 
 
 		 523 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  35.71 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.37 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0814  benzene 1,2-dioxygenase, ferredoxin protein  31.37 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.72 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2358  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.43 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  45.9 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2324  nitrogen-fixing NifU domain protein  44 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.575512  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.37 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.39 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3347  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  32.56 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.28 
 
 		 87 aa  58.5  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.62 
 
 		 77 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  42.19 
 
 		 72 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.24 
 
 		 74 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3443  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.95 
 
 		 116 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775174 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  40 
 
 		 81 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0669  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  32.32 
 
 		 123 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.163122  normal  0.0446226 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.7 
 
 		 99 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.54 
 
 		 79 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.54 
 
 		 79 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  41.54 
 
 		 79 aa  57  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  34.41 
 
 		 119 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.66 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.359094 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0484  yhgI protein  36.67 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.508791  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  43.75 
 
 		 73 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.5 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3445  hypothetical protein  39.39 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40630  hypothetical protein  39.39 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1525  HesB/YadR/YfhF-family protein  40.91 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  41.54 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  40.91 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  40.79 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>