113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0451 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0451  DNA mismatch endonuclease Vsr  100 
 
 
138 aa  285  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000180735  decreased coverage  0.00102916 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1812  T/G mismatch-specific endonuclease  40.46 
 
 
137 aa  103  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0390542  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3575  DNA mismatch endonuclease Vsr  37.04 
 
 
141 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.0000168268  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08500  T/G mismatch-specific endonuclease  40.74 
 
 
146 aa  99.8  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.119138 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02370  DNA mismatch endonuclease Vsr, putative  34.06 
 
 
163 aa  97.4  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.225751  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4111  DNA mismatch endonuclease vsr  33.81 
 
 
136 aa  97.1  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1534  T/G mismatch-specific endonuclease  35.94 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.899719  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2315  T/G mismatch-specific endonuclease  44.54 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0528  DNA mismatch endonuclease Vsr  35.34 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.027881  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4758  DNA mismatch endonuclease Vsr  39.13 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2284  DNA mismatch endonuclease Vsr  40.98 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_255  Vsr domain protein T:G mismatch repair endonuclease  39.26 
 
 
138 aa  94.4  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0112407  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4985  DNA mismatch endonuclease Vsr  35.56 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3921  DNA mismatch endonuclease Vsr  35.29 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7047  DNA mismatch endonuclease Vsr  34.07 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1618  DNA mismatch endonuclease, vsr  36.5 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.465937  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3762  T/G mismatch-specific endonuclease  34.81 
 
 
142 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00377311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1156  T/G mismatch-specific endonuclease  34.07 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0270  DNA mismatch endonuclease Vsr  37.69 
 
 
130 aa  90.1  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3385  DNA mismatch endonuclease vsr  33.83 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.48656  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1715  DNA mismatch endonuclease vsr  37.07 
 
 
137 aa  89  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301273  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4864  DNA mismatch endonuclease Vsr  39.13 
 
 
167 aa  88.2  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0234649  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1387  DNA mismatch endonuclease vsr  32.85 
 
 
136 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2517  DNA mismatch endonuclease vsr  35.11 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1452  DNA mismatch endonuclease Vsr  35.83 
 
 
144 aa  87.8  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68518  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0546  DNA mismatch endonuclease Vsr  36.76 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2144  DNA mismatch endonuclease Vsr  39.45 
 
 
190 aa  87.4  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384099  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2517  patch repair protein  34.33 
 
 
149 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0753026  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1536  DNA mismatch endonuclease Vsr  38.81 
 
 
150 aa  86.7  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000110853 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2536  T/G mismatch-specific endonuclease  33.09 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0413  DNA mismatch endonuclease vsr  36.67 
 
 
167 aa  84.7  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23201  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0146  hypothetical protein  36.59 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3323  DNA mismatch endonuclease vsr  35.11 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.116572 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3075  DNA mismatch endonuclease vsr  36 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0758  DNA mismatch endonuclease Vsr  42.86 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00181018  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1524  DNA mismatch endonuclease Vsr  35.25 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000359719  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0654  DNA mismatch endonuclease vsr  41.46 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000000411075  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2062  very short patch repair protein  36.51 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00234153  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2736  very short patch repair protein  36.22 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.148066  normal  0.265119 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1689  DNA mismatch endonuclease Vsr  36.51 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0196387  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1747  T/G mismatch-specific endonuclease  41.18 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000813449  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1683  DNA mismatch endonuclease Vsr  36.51 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0286378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1226  very short patch repair protein  36.51 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.129783  normal  0.848224 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7068  DNA mismatch endonuclease Vsr  32.59 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000952537  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0959  DNA mismatch endonuclease Vsr  33.82 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000487043  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1180  T/G mismatch-specific endonuclease  35 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.209463  normal  0.125774 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0925  very short patch repair protein  36.51 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.896374  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2656  DNA mismatch endonuclease Vsr  34.43 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.902598  normal  0.103187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4450  putative very short patch repair protein  36.36 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000172417  hitchhiker  0.000789657 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2798  DNA mismatch endonuclease vsr  33.06 
 
 
129 aa  79  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0146615  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0082  T/G mismatch-specific endonuclease  35.77 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.199273  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0823  DNA mismatch endonuclease vsr  37.04 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1128  T/G mismatch-specific endonuclease  34.59 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000897003  unclonable  0.00000721328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4747  DNA mismatch endonuclease Vsr  33.1 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  0.973977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0683  DNA mismatch endonuclease Vsr  30.83 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000492028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1490  DNA mismatch endonuclease Vsr  32.84 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3924  DNA mismatch endonuclease Vsr  34.38 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3439  patch repair protein  33.62 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2191  very short patch repair protein  35.71 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000114608  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0890  DNA mismatch endonuclease Vsr  33.88 
 
 
154 aa  77  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0259609  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0930  DNA mismatch endonuclease Vsr  34.07 
 
 
140 aa  76.6  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.202867  hitchhiker  0.0000000000699744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1415  DNA mismatch endonuclease Vsr  38.74 
 
 
124 aa  77  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0184056  normal  0.0884677 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0471  putative patch repair protein  35.61 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797287  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0818  DNA mismatch endonuclease vsr  36.04 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0834  DNA mismatch endonuclease vsr  36.04 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8537  DNA mismatch endonuclease Vsr  42.17 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00124177  hitchhiker  0.000481782 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2062  DNA mismatch endonuclease vsr  31.62 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023533 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1087  DNA mismatch endonuclease vsr  34.15 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.603393  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2197  putative very short patch repair protein  40.98 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0715413  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1176  putative very short patch repair protein  35.38 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411245  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04381  hypothetical protein  30.77 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0584444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0572  DNA mismatch endonuclease vsr  34.19 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.529151  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0295  DNA mismatch endonuclease Vsr  34.19 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0208  DNA mismatch endonuclease Vsr  36.11 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221365  decreased coverage  0.000000121793 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04271  hypothetical protein  29.69 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.300408  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1917  Very short patch repair (Vsr) endonuclease  35.65 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.715559  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0353  DNA mismatch endonuclease Vsr  34.09 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1616  DNA mismatch endonuclease Vsr  36.29 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000954953 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0761  DNA mismatch endonuclease Vsr  31.01 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0372  T/G mismatch-specific endonuclease  29.13 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0872  T/G mismatch-specific endonuclease  32.41 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2150  very short patch repair protein  34.19 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.304903 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1128  very short patch repair protein  34.19 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00164567  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1250  very short patch repair protein  34.19 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.77058  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4265  T/G mismatch-specific endonuclease  30.22 
 
 
144 aa  72  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0348  DNA mismatch endonuclease Vsr  43.21 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2550  T/G mismatch-specific endonuclease  34.19 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242916  normal  0.437604 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3582  DNA mismatch endonuclease vsr  33.33 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.684164  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4307  DNA mismatch endonuclease vsr  36.84 
 
 
105 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.545239  normal  0.0670699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3854  DNA mismatch endonuclease vsr  35.04 
 
 
165 aa  72  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.151081  normal  0.0341159 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2154  very short patch repair protein  33.33 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.646058  normal  0.0336526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2207  very short patch repair protein  33.33 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0981  DNA mismatch endonuclease Vsr  32.14 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00168911 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2741  DNA G:T-mismatch repair endonuclease  35.24 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1051  DNA mismatch endonuclease Vsr  33.59 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.080129  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0566  DNA mismatch endonuclease vsr  41.67 
 
 
177 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892788  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0010  DNA mismatch endonuclease Vsr  30.51 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.191415  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0533  DNA mismatch endonuclease Vsr  34.19 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0160507  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3056  T/G mismatch-specific endonuclease  33.61 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1412  DNA mismatch endonuclease Vsr  30.71 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.961068  normal  0.106603 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>