244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0399 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.67 
 
 
938 aa  889  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.73 
 
 
929 aa  945  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 
933 aa  1897  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.62 
 
 
952 aa  905  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  42.69 
 
 
931 aa  726  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  41.09 
 
 
906 aa  619  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.29 
 
 
1002 aa  610  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.33 
 
 
1001 aa  605  1e-172  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  41.54 
 
 
937 aa  601  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.29 
 
 
985 aa  600  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.68 
 
 
933 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.53 
 
 
936 aa  595  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.96 
 
 
920 aa  593  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.13 
 
 
929 aa  595  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.12 
 
 
957 aa  594  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2699  Phosphoenolpyruvate carboxylase  39.44 
 
 
915 aa  595  1e-168  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.66 
 
 
933 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38 
 
 
945 aa  587  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.61 
 
 
928 aa  587  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  41.18 
 
 
918 aa  588  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.53 
 
 
946 aa  582  1e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.53 
 
 
946 aa  582  1e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.53 
 
 
946 aa  582  1e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1661  Phosphoenolpyruvate carboxylase  41.46 
 
 
938 aa  580  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2536  Phosphoenolpyruvate carboxylase  39.01 
 
 
921 aa  579  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366441  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.97 
 
 
929 aa  575  1e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  40.11 
 
 
923 aa  574  1e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.02 
 
 
929 aa  575  1e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  1.74255e-10 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.77 
 
 
994 aa  573  1e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0994  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.88 
 
 
892 aa  575  1e-162  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43848  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.02 
 
 
929 aa  575  1e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.68 
 
 
926 aa  571  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.62 
 
 
949 aa  571  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.76 
 
 
982 aa  568  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0138  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.13 
 
 
932 aa  568  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.497432 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.37 
 
 
1009 aa  568  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.09 
 
 
929 aa  566  1e-160  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.81 
 
 
951 aa  563  1e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.39 
 
 
1004 aa  564  1e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.27 
 
 
937 aa  565  1e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.54 
 
 
928 aa  559  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0729  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.03 
 
 
994 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.03 
 
 
994 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.23 
 
 
1088 aa  560  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.03 
 
 
994 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.03 
 
 
1024 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.77 
 
 
934 aa  559  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.03 
 
 
994 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.27 
 
 
936 aa  560  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.45 
 
 
1075 aa  561  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4238  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.07 
 
 
1021 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2286  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.03 
 
 
994 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1228  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.93 
 
 
1085 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.774396  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.41 
 
 
949 aa  557  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.73 
 
 
947 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.3 
 
 
949 aa  555  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17821  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.81 
 
 
989 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.73 
 
 
896 aa  553  1e-156  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2430  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.7 
 
 
1009 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76585  normal  0.238617 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3469  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.97 
 
 
1024 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.96 
 
 
1030 aa  554  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.1 
 
 
1006 aa  553  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2647  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.97 
 
 
1024 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.261414  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.03 
 
 
998 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17661  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.78 
 
 
989 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.09 
 
 
1018 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.92 
 
 
998 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1814  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.7 
 
 
994 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594671  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0836  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.1 
 
 
1038 aa  550  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2426  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.7 
 
 
1009 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.15 
 
 
939 aa  546  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.14 
 
 
938 aa  548  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.87 
 
 
946 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4375  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.38 
 
 
896 aa  546  1e-154  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0553395  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1696  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.37 
 
 
1017 aa  543  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.55 
 
 
932 aa  543  1e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0472  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.84 
 
 
898 aa  545  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.77 
 
 
972 aa  545  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.54 
 
 
970 aa  542  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.36 
 
 
950 aa  544  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.09332e-07 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0841  Phosphoenolpyruvate carboxylase  41.08 
 
 
939 aa  543  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0828  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.98 
 
 
928 aa  540  1e-152  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.891362  normal  0.27066 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5753  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.65 
 
 
1008 aa  540  1e-152  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.61686  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22741  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.28 
 
 
1002 aa  540  1e-152  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.114136 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20211  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.92 
 
 
994 aa  540  1e-152  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17621  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.92 
 
 
989 aa  540  1e-152  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.26 
 
 
930 aa  540  1e-152  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1653  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.31 
 
 
892 aa  540  1e-152  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0256628  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1147  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.03 
 
 
994 aa  541  1e-152  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0396  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.79 
 
 
997 aa  536  1e-151  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411219  normal  0.654727 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1933  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.13 
 
 
995 aa  537  1e-151  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1667  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.21 
 
 
989 aa  538  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.79 
 
 
954 aa  536  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2522  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.93 
 
 
898 aa  533  1e-150  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314131  normal  0.688456 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16951  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.73 
 
 
1007 aa  535  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.33 
 
 
1023 aa  533  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2494  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.16 
 
 
897 aa  530  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2252  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.04 
 
 
1017 aa  528  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0123033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.27 
 
 
947 aa  527  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0661  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.88 
 
 
831 aa  523  1e-147  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>