More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0355 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0355  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
520 aa  1004    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  hitchhiker  0.000000558214 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.12 
 
 
608 aa  297  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  42.46 
 
 
621 aa  259  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  47.97 
 
 
586 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  35.23 
 
 
641 aa  235  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0268  RND family efflux transporter MFP subunit  46.47 
 
 
587 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0795166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4067  RND family efflux transporter MFP subunit  42.7 
 
 
621 aa  227  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1544  secretion protein HlyD family protein  37.17 
 
 
504 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0500  secretion protein HlyD family protein  37.62 
 
 
502 aa  208  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3213  multidrug resistance efflux pump-like protein  40.09 
 
 
502 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4302  secretion protein HlyD family protein  39.89 
 
 
477 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.358477  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2438  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.44 
 
 
586 aa  195  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017106  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3638  secretion protein HlyD family protein  37.88 
 
 
503 aa  190  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266214  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2709  multidrug resistance efflux pump-like protein  40.22 
 
 
501 aa  189  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64951  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2731  secretion protein HlyD family protein  43.2 
 
 
497 aa  166  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4169  secretion protein HlyD family protein  40.58 
 
 
477 aa  161  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00575947  hitchhiker  0.00428587 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.64 
 
 
509 aa  134  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1441  RND family efflux transporter MFP subunit  28.11 
 
 
634 aa  108  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0790  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31 
 
 
521 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1593  RND family efflux transporter MFP subunit  27.25 
 
 
631 aa  106  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351482  normal  0.814117 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  33.74 
 
 
541 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4357  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  31.35 
 
 
514 aa  101  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155847  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  23.93 
 
 
500 aa  101  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0177  secretion protein HlyD family protein  31.73 
 
 
514 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.624945  normal  0.250507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1765  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 
541 aa  93.6  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186436  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0460  hypothetical protein  31.84 
 
 
513 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3151  secretion protein HlyD family protein  27.88 
 
 
533 aa  90.5  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.19 
 
 
432 aa  89  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2316  secretion protein HlyD family protein  26.89 
 
 
533 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  37.02 
 
 
349 aa  87.8  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.44 
 
 
505 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  33.98 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.43 
 
 
467 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  34.34 
 
 
399 aa  84.7  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.75 
 
 
430 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.29 
 
 
448 aa  81.3  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  32.92 
 
 
509 aa  80.9  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  33.5 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.96 
 
 
504 aa  80.5  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  39.81 
 
 
404 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  38.71 
 
 
489 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.19 
 
 
465 aa  79.7  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.16 
 
 
379 aa  79  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  27.45 
 
 
609 aa  77.8  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0453  secretion protein HlyD family protein  27.72 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  30.8 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  27.87 
 
 
424 aa  77  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4736  secretion protein HlyD  26.03 
 
 
510 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325985  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.97 
 
 
500 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  27.85 
 
 
417 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4231  hypothetical protein  30.12 
 
 
514 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442876 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2665  RND family efflux transporter MFP subunit  41.84 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  28.25 
 
 
517 aa  75.1  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.52 
 
 
481 aa  74.7  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  29.51 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.68 
 
 
663 aa  74.3  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0212  secretion protein HlyD family protein  36.41 
 
 
536 aa  74.3  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6122  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  36.09 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  30.92 
 
 
384 aa  73.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  32.57 
 
 
393 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0764  RND family efflux transporter MFP subunit  34.78 
 
 
385 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  32.33 
 
 
353 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  40.19 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0950  secretion protein HlyD  34.03 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.57805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  29.33 
 
 
335 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  31.87 
 
 
411 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  30.7 
 
 
376 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  37.16 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  30.1 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  30.77 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  31.61 
 
 
394 aa  71.2  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.53 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  32.68 
 
 
443 aa  71.2  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  30.92 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  27.01 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  34.64 
 
 
456 aa  70.1  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.11 
 
 
496 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.89 
 
 
496 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  30.2 
 
 
328 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  31.98 
 
 
341 aa  69.7  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  30.2 
 
 
328 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  30.29 
 
 
401 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140483  hitchhiker  0.000000766037 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0553  secretion protein HlyD  37.5 
 
 
450 aa  70.1  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  32.58 
 
 
350 aa  69.7  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  31.4 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  27.38 
 
 
463 aa  68.9  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  30.18 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0618  secretion protein HlyD family protein  32.66 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  29.27 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  29.64 
 
 
351 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.81 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  29.84 
 
 
344 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  27.73 
 
 
355 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03415  hypothetical protein  32.85 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3671  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.38 
 
 
516 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.91 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  34.9 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  36.3 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>