More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0335 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  100 
 
 
249 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  74.18 
 
 
253 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  75.83 
 
 
267 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  73.06 
 
 
246 aa  387  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  73.97 
 
 
254 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  73.06 
 
 
254 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  72.54 
 
 
253 aa  384  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  74.48 
 
 
273 aa  384  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  73.31 
 
 
253 aa  385  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  72.65 
 
 
254 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  74.04 
 
 
258 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  74.47 
 
 
257 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  75.21 
 
 
258 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  72.65 
 
 
254 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  74.36 
 
 
267 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  72.65 
 
 
254 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  71.95 
 
 
253 aa  381  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  71.72 
 
 
253 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  74.04 
 
 
258 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  75.21 
 
 
268 aa  381  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.19 
 
 
269 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  74.79 
 
 
256 aa  377  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.19 
 
 
249 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  72.24 
 
 
253 aa  380  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  73.5 
 
 
262 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  73.62 
 
 
257 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  73.75 
 
 
246 aa  378  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  73.19 
 
 
269 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  74.06 
 
 
273 aa  378  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  73.5 
 
 
262 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  72.5 
 
 
252 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  72.92 
 
 
252 aa  380  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  72.5 
 
 
252 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  72.5 
 
 
252 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  72.08 
 
 
252 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  72.08 
 
 
252 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  71.6 
 
 
254 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  73.03 
 
 
247 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  72.02 
 
 
254 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  69.96 
 
 
252 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  72.61 
 
 
247 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  73.08 
 
 
262 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  74.04 
 
 
257 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  72.08 
 
 
252 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  72.08 
 
 
252 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  72.08 
 
 
252 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  70.66 
 
 
249 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0985  ABC transporter related  71.37 
 
 
247 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.178128 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  71.61 
 
 
263 aa  371  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  69.83 
 
 
259 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  71.61 
 
 
258 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  69.83 
 
 
249 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4002  ABC transporter related  74.18 
 
 
253 aa  368  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410109  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  69.76 
 
 
266 aa  367  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  68.8 
 
 
252 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  70.25 
 
 
249 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  71.79 
 
 
255 aa  367  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  71.91 
 
 
263 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  69.14 
 
 
245 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  70.42 
 
 
246 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2001  ABC transporter related  73.33 
 
 
258 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  68.27 
 
 
251 aa  365  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  71.37 
 
 
247 aa  362  2e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  71.13 
 
 
261 aa  363  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  71.55 
 
 
254 aa  362  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  68.31 
 
 
247 aa  358  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  69.04 
 
 
251 aa  358  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  69.17 
 
 
246 aa  358  3e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4395  ABC transporter related  69.96 
 
 
243 aa  359  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0223537  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  69.17 
 
 
246 aa  357  7e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  70.83 
 
 
244 aa  357  9.999999999999999e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  70.9 
 
 
252 aa  355  5e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  66.27 
 
 
250 aa  353  1e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  70.83 
 
 
257 aa  349  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  67.77 
 
 
259 aa  349  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2068  ABC transporter related  68.85 
 
 
247 aa  348  6e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  68.57 
 
 
251 aa  347  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  69.42 
 
 
244 aa  347  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  66.53 
 
 
248 aa  347  1e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  67.62 
 
 
251 aa  346  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  67.63 
 
 
243 aa  345  3e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  66.12 
 
 
248 aa  346  3e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0249  ATPase  69.14 
 
 
261 aa  344  8.999999999999999e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  67.36 
 
 
265 aa  343  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  64.68 
 
 
242 aa  343  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  66.67 
 
 
242 aa  342  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  66.38 
 
 
242 aa  342  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  67.9 
 
 
245 aa  342  4e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.09 
 
 
251 aa  342  4e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5511  ABC transporter related  64.34 
 
 
247 aa  342  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233836  decreased coverage  0.000387504 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  65.83 
 
 
252 aa  341  5e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  68.33 
 
 
252 aa  341  7e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  66.81 
 
 
242 aa  340  1e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  67.49 
 
 
245 aa  340  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  67.51 
 
 
243 aa  339  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  67.76 
 
 
261 aa  340  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.67 
 
 
251 aa  339  2.9999999999999998e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  65.71 
 
 
265 aa  339  2.9999999999999998e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  63.45 
 
 
253 aa  338  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  67.93 
 
 
243 aa  338  7e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>