More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0315 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  100 
 
 		 655 aa  1326    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  45.5 
 
 		 652 aa  561  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  44.18 
 
 		 651 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0014  DNA primase  41.54 
 
 		 645 aa  478  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0081672  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  39.48 
 
 		 623 aa  359  9.999999999999999e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  37.23 
 
 		 590 aa  347  3e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  38.41 
 
 		 588 aa  347  6e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  39.55 
 
 		 590 aa  343  5e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  35.23 
 
 		 595 aa  327  3e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  33.89 
 
 		 595 aa  325  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  36.64 
 
 		 626 aa  321  3e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  37.68 
 
 		 605 aa  313  7.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  34.78 
 
 		 599 aa  307  4.0000000000000004e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  35.51 
 
 		 599 aa  300  6e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  36.53 
 
 		 600 aa  297  4e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  36.94 
 
 		 599 aa  290  5.0000000000000004e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  41.5 
 
 		 605 aa  288  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  37.61 
 
 		 601 aa  287  4e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  37.81 
 
 		 595 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  36.59 
 
 		 686 aa  283  5.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  42.15 
 
 		 593 aa  278  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  38.13 
 
 		 614 aa  278  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  36.29 
 
 		 682 aa  277  5e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  36.42 
 
 		 613 aa  277  5e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  35.86 
 
 		 646 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  35.86 
 
 		 646 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  32.49 
 
 		 601 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  39.1 
 
 		 611 aa  273  7e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  36.01 
 
 		 587 aa  273  8.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  39.02 
 
 		 564 aa  272  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  33.23 
 
 		 684 aa  271  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  31.46 
 
 		 571 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  31.46 
 
 		 598 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  31.46 
 
 		 598 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  31.46 
 
 		 598 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  33.79 
 
 		 588 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  31.46 
 
 		 598 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  31.46 
 
 		 598 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  33.83 
 
 		 598 aa  266  8e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  30.48 
 
 		 583 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  31.26 
 
 		 598 aa  266  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  34.21 
 
 		 676 aa  266  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0860  DNA primase  31.19 
 
 		 677 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262059  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1824  DNA primase  35.38 
 
 		 690 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.982037  normal  0.672025 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  30.99 
 
 		 677 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  38.12 
 
 		 578 aa  265  3e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  33.68 
 
 		 604 aa  264  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  30.18 
 
 		 677 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  35.45 
 
 		 655 aa  264  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  34.67 
 
 		 660 aa  264  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  32.63 
 
 		 603 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  30.1 
 
 		 582 aa  263  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  34.12 
 
 		 600 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  33.57 
 
 		 598 aa  263  8e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  34.52 
 
 		 598 aa  263  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  34.52 
 
 		 598 aa  262  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  34.96 
 
 		 651 aa  263  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2216  DNA primase  33.88 
 
 		 603 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  35.58 
 
 		 604 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  34.51 
 
 		 652 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  32.61 
 
 		 675 aa  260  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  32.52 
 
 		 588 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  32.63 
 
 		 603 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  35.19 
 
 		 660 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  34.54 
 
 		 598 aa  259  8e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10221  DNA primase  29.27 
 
 		 678 aa  259  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.081725  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  37.07 
 
 		 647 aa  258  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  34.14 
 
 		 663 aa  258  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  34.97 
 
 		 660 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  35.68 
 
 		 660 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0311  DNA primase  33.83 
 
 		 583 aa  257  5e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  35.42 
 
 		 656 aa  256  7e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  35.1 
 
 		 660 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  33.92 
 
 		 664 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  34.34 
 
 		 584 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  34.26 
 
 		 623 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  35.81 
 
 		 675 aa  253  5.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  35.41 
 
 		 642 aa  253  9.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  32.34 
 
 		 587 aa  252  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1427  DNA primase  35.64 
 
 		 602 aa  252  1e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0410677  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  36.53 
 
 		 638 aa  253  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  34.96 
 
 		 574 aa  252  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  33.96 
 
 		 584 aa  253  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3106  DNA primase  37.92 
 
 		 641 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0887  DNA primase  33.28 
 
 		 604 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.612944  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  35.07 
 
 		 544 aa  251  2e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  33.4 
 
 		 592 aa  252  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5107  DNA primase  35.42 
 
 		 634 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  36.56 
 
 		 605 aa  251  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  36.56 
 
 		 605 aa  251  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  32.88 
 
 		 679 aa  250  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0757  DNA primase  37.3 
 
 		 647 aa  250  6e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.255391  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  36.59 
 
 		 577 aa  250  6e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  33.91 
 
 		 634 aa  250  7e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 604 aa  250  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  34.17 
 
 		 645 aa  249  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  36.36 
 
 		 640 aa  248  2e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  35.13 
 
 		 584 aa  249  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  34.51 
 
 		 663 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  35 
 
 		 629 aa  249  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>