More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0270 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
318 aa  640    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  55.34 
 
 
315 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  53.9 
 
 
311 aa  292  4e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  42.11 
 
 
306 aa  222  7e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  42.72 
 
 
309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2380  2-dehydropantoate 2-reductase  45.83 
 
 
317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0336446 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  41.44 
 
 
317 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  40 
 
 
307 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  39 
 
 
307 aa  185  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
301 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  35.31 
 
 
302 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 
299 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  32.89 
 
 
307 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  36.84 
 
 
315 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  33.77 
 
 
302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  31.17 
 
 
314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 
300 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  30.74 
 
 
307 aa  152  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  36.47 
 
 
315 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  36.47 
 
 
315 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  35.36 
 
 
315 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  35.34 
 
 
315 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  36.12 
 
 
312 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  36.94 
 
 
312 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  29.02 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  34.42 
 
 
312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  32.33 
 
 
299 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  28.37 
 
 
314 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  28.32 
 
 
314 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  28.37 
 
 
314 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  31.68 
 
 
319 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  28.32 
 
 
314 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  28.32 
 
 
314 aa  142  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  32.47 
 
 
345 aa  142  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  31.27 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  33.11 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  30.49 
 
 
307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  33.11 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  27.62 
 
 
314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  32.59 
 
 
335 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  31.58 
 
 
306 aa  140  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  34.98 
 
 
315 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  27.62 
 
 
314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  32.55 
 
 
311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 
306 aa  139  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  33.55 
 
 
307 aa  139  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 
314 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  31.49 
 
 
301 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  33.71 
 
 
311 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  32.46 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  32.13 
 
 
319 aa  136  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  32.56 
 
 
325 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  34.53 
 
 
315 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  30.13 
 
 
312 aa  135  7.000000000000001e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  29.33 
 
 
295 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  33.66 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  33.33 
 
 
311 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  33.66 
 
 
312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  34.2 
 
 
315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  32.64 
 
 
306 aa  132  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  33.88 
 
 
341 aa  133  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  30.97 
 
 
310 aa  132  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  29.33 
 
 
313 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  29.32 
 
 
307 aa  132  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  30.94 
 
 
329 aa  132  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  34.63 
 
 
312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  30.69 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1107  2-dehydropantoate 2-reductase  33.11 
 
 
319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  30.7 
 
 
342 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  33.55 
 
 
306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  29.33 
 
 
298 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  31 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  30.12 
 
 
346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  32.47 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  32.47 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  29.07 
 
 
317 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  33.1 
 
 
306 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  30.92 
 
 
306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  30.09 
 
 
325 aa  126  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  31.15 
 
 
335 aa  125  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  32.09 
 
 
326 aa  125  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  31.99 
 
 
324 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  32.45 
 
 
306 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  33.45 
 
 
310 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  31.78 
 
 
332 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0067  2-dehydropantoate 2-reductase  35.19 
 
 
321 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  31.37 
 
 
307 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  30.53 
 
 
332 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02788  2-dehydropantoate 2-reductase  34.8 
 
 
312 aa  123  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0174  2-dehydropantoate 2-reductase  33.99 
 
 
313 aa  122  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 
324 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0059  2-dehydropantoate 2-reductase  34.57 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  31.62 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  29.88 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  29.03 
 
 
305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  30.5 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 
333 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  33.12 
 
 
316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  28.96 
 
 
324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  29.91 
 
 
337 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>