More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0122 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  55.24 
 
 
866 aa  761    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  56.86 
 
 
870 aa  781    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  49.11 
 
 
839 aa  651    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  46.24 
 
 
847 aa  652    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  46.31 
 
 
850 aa  662    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  43.7 
 
 
855 aa  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
845 aa  1616    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  54.34 
 
 
849 aa  833    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  46.6 
 
 
847 aa  648    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  46.35 
 
 
843 aa  525  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  46.79 
 
 
837 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  44.73 
 
 
843 aa  490  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  30.07 
 
 
858 aa  302  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  34.29 
 
 
841 aa  282  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  29.82 
 
 
850 aa  261  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  28.09 
 
 
851 aa  253  7e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  33.5 
 
 
842 aa  250  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  28.74 
 
 
849 aa  245  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  27.73 
 
 
849 aa  245  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  27.64 
 
 
817 aa  236  9e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  34.03 
 
 
842 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  34.07 
 
 
842 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  27.55 
 
 
817 aa  234  6e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  28.71 
 
 
855 aa  233  8.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  28.85 
 
 
858 aa  226  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  28.62 
 
 
857 aa  209  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  26.93 
 
 
836 aa  209  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  28.69 
 
 
846 aa  205  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  29.18 
 
 
819 aa  203  9e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  30.09 
 
 
855 aa  198  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  26.02 
 
 
817 aa  198  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  29.79 
 
 
820 aa  197  7e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  30.02 
 
 
821 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  28.8 
 
 
835 aa  196  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  28.8 
 
 
835 aa  196  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  27.52 
 
 
879 aa  195  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  27.36 
 
 
884 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  27.63 
 
 
889 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  27.14 
 
 
889 aa  190  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  29.92 
 
 
821 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  28.59 
 
 
804 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  27.65 
 
 
845 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  27.27 
 
 
867 aa  182  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  28.21 
 
 
884 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  27.05 
 
 
878 aa  179  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  28.45 
 
 
815 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  27.44 
 
 
887 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  29.99 
 
 
800 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  26.85 
 
 
857 aa  175  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  29.11 
 
 
844 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  40.88 
 
 
846 aa  174  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  29.43 
 
 
877 aa  174  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  28.37 
 
 
866 aa  174  9e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  25.45 
 
 
865 aa  172  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  28.65 
 
 
819 aa  171  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  29.27 
 
 
877 aa  170  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  27.54 
 
 
889 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  28.85 
 
 
793 aa  167  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  27.53 
 
 
887 aa  165  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  28.39 
 
 
800 aa  165  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  26.25 
 
 
897 aa  157  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  27.27 
 
 
850 aa  153  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  27.51 
 
 
843 aa  149  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  24.55 
 
 
803 aa  145  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  25.32 
 
 
849 aa  142  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  24.88 
 
 
852 aa  140  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  26.12 
 
 
847 aa  140  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  32 
 
 
825 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  25.35 
 
 
836 aa  138  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  28.34 
 
 
802 aa  138  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  25.78 
 
 
855 aa  134  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  33.15 
 
 
820 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  27.5 
 
 
841 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  29.76 
 
 
848 aa  123  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  27.74 
 
 
840 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  23.52 
 
 
854 aa  120  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  26.22 
 
 
845 aa  118  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  27.43 
 
 
868 aa  117  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  24.66 
 
 
842 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  25.58 
 
 
859 aa  114  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  33.91 
 
 
826 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  31.91 
 
 
819 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  29.2 
 
 
820 aa  112  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  22.94 
 
 
813 aa  112  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  30.45 
 
 
872 aa  111  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  25.84 
 
 
856 aa  110  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  27 
 
 
825 aa  109  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  29.69 
 
 
853 aa  109  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  25.34 
 
 
836 aa  109  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  24.77 
 
 
834 aa  108  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  23.56 
 
 
873 aa  107  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  26.97 
 
 
853 aa  101  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  31.08 
 
 
821 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  30.37 
 
 
445 aa  100  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  28.79 
 
 
408 aa  99.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  30.86 
 
 
821 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  30.9 
 
 
819 aa  98.6  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  25.27 
 
 
855 aa  97.8  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  33.05 
 
 
795 aa  97.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  27.2 
 
 
836 aa  97.4  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>