201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0090 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0090  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
489 aa  1000  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271567  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 
414 aa  79.7  1e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1150  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 
441 aa  76.3  1e-12  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344094  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 
418 aa  75.9  2e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 
393 aa  73.9  6e-12  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0295  extracellular solute-binding protein  21.21 
 
 
464 aa  72.4  2e-11  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 
420 aa  70.1  8e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  30.72 
 
 
413 aa  69.7  1e-10  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 
442 aa  66.2  1e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  22.85 
 
 
432 aa  65.9  2e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 
488 aa  64.3  5e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 
436 aa  62.8  1e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 
443 aa  62  2e-08  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  2.54304e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 
413 aa  62.4  2e-08  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  22.4 
 
 
416 aa  62  2e-08  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 
445 aa  61.6  3e-08  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  22.4 
 
 
416 aa  62  3e-08  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 
410 aa  61.6  3e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.08 
 
 
403 aa  61.6  3e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  31.47 
 
 
446 aa  61.2  4e-08  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 
421 aa  60.8  5e-08  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.68 
 
 
439 aa  60.5  6e-08  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 
443 aa  60.5  6e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.34 
 
 
426 aa  60.5  7e-08  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  29.65 
 
 
446 aa  59.3  1e-07  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  22.61 
 
 
410 aa  59.3  2e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3808  extracellular solute-binding protein family 1  28.35 
 
 
427 aa  59.3  2e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 
442 aa  58.5  3e-07  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  28.85 
 
 
424 aa  57.8  4e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 
410 aa  58.2  4e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1240  extracellular solute-binding protein  21.72 
 
 
465 aa  57.8  4e-07  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000394663  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  30.82 
 
 
429 aa  58.2  4e-07  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 
424 aa  57.4  5e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
443 aa  57.4  6e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 
488 aa  57.4  6e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  21.08 
 
 
420 aa  56.6  1e-06  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  21.41 
 
 
406 aa  55.8  1e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 
451 aa  55.8  2e-06  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  5.53575e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 
483 aa  55.1  3e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  3.31289e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  23.87 
 
 
439 aa  54.7  3e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 
447 aa  55.1  3e-06  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.22 
 
 
463 aa  55.1  3e-06  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1187  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 
426 aa  54.3  4e-06  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118326  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2920  extracellular solute-binding protein family 1  28.87 
 
 
424 aa  54.7  4e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 
455 aa  54.7  4e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  28.26 
 
 
479 aa  54.3  4e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.26 
 
 
430 aa  54.7  4e-06  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5002  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.29 
 
 
426 aa  54.3  5e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.287585  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.48 
 
 
434 aa  54.3  5e-06  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.07 
 
 
434 aa  54.3  5e-06  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.36 
 
 
427 aa  54.3  5e-06  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 
415 aa  53.9  6e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1080  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 
426 aa  53.9  7e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  32.61 
 
 
434 aa  53.9  7e-06  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.7577e-05 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 
458 aa  53.5  8e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25.43 
 
 
410 aa  53.5  9e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25.43 
 
 
410 aa  53.5  9e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.38 
 
 
426 aa  53.1  1e-05  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 
429 aa  53.1  1e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 
435 aa  52.8  1e-05  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 
435 aa  53.1  1e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 
422 aa  52.8  1e-05  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  23.05 
 
 
424 aa  53.1  1e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0589  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 
452 aa  53.1  1e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289831  normal  0.0417818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 
417 aa  52.8  2e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 
419 aa  52.4  2e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  21.4 
 
 
461 aa  52.4  2e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 
435 aa  52  2e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  32.41 
 
 
436 aa  52.4  2e-05  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  29.95 
 
 
450 aa  52.4  2e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 
422 aa  52.8  2e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3317  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 
492 aa  51.6  3e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.42443e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 
449 aa  51.6  3e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  22.52 
 
 
431 aa  51.6  3e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  21.36 
 
 
417 aa  51.6  3e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 
480 aa  52  3e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3526  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 
435 aa  51.6  3e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.077506  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  22.12 
 
 
421 aa  51.2  4e-05  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3842  extracellular solute-binding protein family 1  30.72 
 
 
429 aa  51.2  4e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0316121  normal  0.0422385 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2115  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 
432 aa  51.2  4e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.845793  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 
484 aa  51.2  4e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  22.53 
 
 
408 aa  51.2  4e-05  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.95685e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 
429 aa  51.2  4e-05  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 
435 aa  51.2  4e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4468  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 
436 aa  50.8  5e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 
439 aa  50.8  5e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 
418 aa  51.2  5e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.66 
 
 
431 aa  50.8  5e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3675  extracellular solute-binding protein family 1  21.53 
 
 
435 aa  50.4  7e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616273  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  21.64 
 
 
454 aa  50.4  7e-05  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 
456 aa  50.1  8e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2114  extracellular solute-binding protein family 1  22.98 
 
 
428 aa  50.1  9e-05  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  30.07 
 
 
426 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  29.17 
 
 
439 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  21.67 
 
 
444 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01900  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.53 
 
 
442 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.867357  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.43 
 
 
450 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
428 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0711  extracellular solute-binding protein family 1  21.28 
 
 
436 aa  49.7  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 
412 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>