More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0081 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0081  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 
327 aa  672  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1069  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  37.27 
 
 
328 aa  229  5e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.209088 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0588  LacI family transcription regulator  37.27 
 
 
328 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.979882  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0527  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  37.27 
 
 
328 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  38.44 
 
 
346 aa  201  1e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  37.79 
 
 
346 aa  197  1e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  35.03 
 
 
336 aa  196  4e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  34.74 
 
 
334 aa  193  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  36.51 
 
 
340 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  35.24 
 
 
336 aa  191  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  36 
 
 
347 aa  190  3e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  34.89 
 
 
334 aa  189  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  35.83 
 
 
334 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  35.62 
 
 
331 aa  184  1e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  36.99 
 
 
341 aa  184  2e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.81496e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  36.56 
 
 
348 aa  183  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  35.53 
 
 
340 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  34.73 
 
 
336 aa  183  4e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  35.53 
 
 
340 aa  183  4e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  33.84 
 
 
329 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  35.06 
 
 
337 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  30.48 
 
 
339 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.59796e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  33.84 
 
 
332 aa  180  3e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  34.87 
 
 
340 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  35.65 
 
 
328 aa  179  6e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  36.53 
 
 
339 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  35.22 
 
 
353 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  29.54 
 
 
327 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  32.44 
 
 
338 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  31 
 
 
341 aa  176  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  31.72 
 
 
333 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03609  transcriptional regulator LacI family  39.08 
 
 
350 aa  176  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.34339  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  30.7 
 
 
342 aa  175  9e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  9.20501e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.86 
 
 
336 aa  175  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.84 
 
 
337 aa  174  2e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.13 
 
 
328 aa  174  2e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  31.42 
 
 
335 aa  174  2e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  34.36 
 
 
342 aa  174  2e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  33.96 
 
 
338 aa  174  2e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.85 
 
 
333 aa  173  3e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  35.6 
 
 
338 aa  173  3e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  34.04 
 
 
339 aa  173  3e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00410  transcriptional regulator, LacI family  33.85 
 
 
337 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.43 
 
 
336 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  3.48221e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  35.62 
 
 
333 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.02 
 
 
330 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  29.43 
 
 
341 aa  170  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  31.68 
 
 
333 aa  169  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.07214e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  29.74 
 
 
386 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0210  LacI family transcription regulator  29.18 
 
 
353 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  1.88149e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  32.36 
 
 
328 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  29.08 
 
 
337 aa  166  6e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  33.96 
 
 
343 aa  165  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1024  LacI family transcription regulator  34.82 
 
 
342 aa  165  9e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  33.96 
 
 
343 aa  165  1e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  34.29 
 
 
333 aa  165  1e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  7.82419e-07 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  33.96 
 
 
343 aa  165  1e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1396  LacI family transcription regulator  28.94 
 
 
332 aa  165  1e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.188133  hitchhiker  0.000600717 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  33.96 
 
 
343 aa  165  1e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  34.43 
 
 
333 aa  164  2e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  29.81 
 
 
332 aa  164  2e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20530  transcriptional regulator, LacI family  31.11 
 
 
341 aa  164  2e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  34.63 
 
 
332 aa  163  4e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  32.69 
 
 
333 aa  163  4e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  35.29 
 
 
340 aa  163  4e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  34.63 
 
 
332 aa  163  4e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  33.64 
 
 
343 aa  163  4e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  33.64 
 
 
343 aa  163  4e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  34.63 
 
 
332 aa  163  4e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  32.65 
 
 
342 aa  162  5e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  28.94 
 
 
332 aa  163  5e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.15 
 
 
332 aa  162  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  33.64 
 
 
343 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 
343 aa  162  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  33.64 
 
 
343 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  33.64 
 
 
343 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  34.63 
 
 
332 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0049  transcriptional regulator, LacI family  36.61 
 
 
337 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.825102  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  28.62 
 
 
332 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  33.64 
 
 
343 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  34.2 
 
 
357 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.68 
 
 
341 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  34.3 
 
 
332 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.77 
 
 
339 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.45 
 
 
352 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  31.55 
 
 
337 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  5.48778e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  32.91 
 
 
343 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.42 
 
 
339 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.35 
 
 
341 aa  160  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6650  transcriptional regulator, LacI family  34.5 
 
 
364 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.33 
 
 
341 aa  160  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0519  LacI family transcription regulator  32.82 
 
 
334 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  35.12 
 
 
333 aa  159  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  1.8406e-05 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  32.73 
 
 
338 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  30.24 
 
 
334 aa  159  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  31.15 
 
 
336 aa  159  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  28.36 
 
 
333 aa  158  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  30.67 
 
 
355 aa  158  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  34.63 
 
 
339 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1243  LacI family transcription regulator  32.42 
 
 
339 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>