More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0071 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0071  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  100 
 
 
556 aa  1140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4111  FAD dependent oxidoreductase  64.87 
 
 
556 aa  679  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0402229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3299  FAD dependent oxidoreductase  63.64 
 
 
559 aa  700  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2622  FAD dependent oxidoreductase  56.27 
 
 
514 aa  598  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0001851  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2844  FAD dependent oxidoreductase  42.83 
 
 
533 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676215  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1021  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  43.98 
 
 
552 aa  431  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0397  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  42.16 
 
 
560 aa  410  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0686  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  42.38 
 
 
547 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2962  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  42.88 
 
 
556 aa  400  1e-110  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0933  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  43.63 
 
 
556 aa  400  1e-110  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0218972  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1521  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  43.25 
 
 
535 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0946096  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0200  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.6 
 
 
547 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0341607 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3991  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.62 
 
 
551 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.172557  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1471  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  42.99 
 
 
585 aa  394  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0227  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.23 
 
 
551 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0200  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  42.07 
 
 
547 aa  391  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207234  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0512  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  39.73 
 
 
562 aa  385  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  6.82192e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3957  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  42.44 
 
 
556 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4148  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  42.07 
 
 
556 aa  385  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00376439  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2805  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.74 
 
 
542 aa  381  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.701913 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2516  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  40.78 
 
 
572 aa  379  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.191896 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0248  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  42.02 
 
 
552 aa  382  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0402203  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1410  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.78 
 
 
542 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2382  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.58 
 
 
542 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2623  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.58 
 
 
542 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2539  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.58 
 
 
542 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1418  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  40.58 
 
 
542 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.556923  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02167  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase (anaerobic), large subunit, FAD/NAD(P)-binding  40.58 
 
 
542 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2393  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.58 
 
 
542 aa  371  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3378  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.58 
 
 
542 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02126  hypothetical protein  40.58 
 
 
542 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2420  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  39.42 
 
 
542 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2628  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  39.42 
 
 
542 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.710716  normal  0.455755 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2524  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  39.42 
 
 
542 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2512  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  39.42 
 
 
542 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2469  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  39.3 
 
 
542 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.357992 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2102  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  40.39 
 
 
512 aa  363  4e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.150536 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1228  FAD dependent oxidoreductase  41.2 
 
 
516 aa  363  4e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.677137  normal  0.683893 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1123  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  41.09 
 
 
582 aa  356  5e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3499  FAD dependent oxidoreductase  38.13 
 
 
522 aa  353  5e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1438  FAD dependent oxidoreductase  37.24 
 
 
539 aa  347  3e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.198287  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0332  FAD dependent oxidoreductase  39.9 
 
 
445 aa  303  7e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0880  FAD dependent oxidoreductase  36.49 
 
 
486 aa  285  2e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2572  FAD dependent oxidoreductase  45.29 
 
 
407 aa  278  1e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.22049 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1177  FAD dependent oxidoreductase  39.63 
 
 
435 aa  273  4e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.624502 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1127  FAD dependent oxidoreductase  41.26 
 
 
384 aa  270  4e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46832  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0583  FAD dependent oxidoreductase  40.48 
 
 
389 aa  263  9e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.6721  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1126  FAD dependent oxidoreductase  39.3 
 
 
392 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1799  FAD dependent oxidoreductase  37.82 
 
 
432 aa  249  7e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  2.52779e-09  normal  0.373628 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3076  FAD dependent oxidoreductase  43.27 
 
 
408 aa  234  4e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5204  FAD dependent oxidoreductase  41.81 
 
 
424 aa  230  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1336  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 
545 aa  190  6e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2532  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 
545 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.941625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1317  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 
545 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1419  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
545 aa  168  3e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 
562 aa  149  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.29 
 
 
530 aa  133  7e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  1.66291e-05 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 
556 aa  132  1e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 
559 aa  130  5e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 
532 aa  130  5e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  8.68135e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  30.38 
 
 
543 aa  130  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 
539 aa  130  9e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 
576 aa  129  1e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.39 
 
 
525 aa  129  2e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 
532 aa  128  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 
547 aa  127  4e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 
543 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 
582 aa  122  1e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 
516 aa  122  2e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 
529 aa  122  2e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 
537 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  31.81 
 
 
518 aa  121  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 
574 aa  120  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 
519 aa  120  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 
537 aa  118  2e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 
533 aa  118  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  8.58537e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2576  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 
508 aa  117  7e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0499  glycerol-3-phosphate oxidase  27.01 
 
 
525 aa  115  2e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717318  normal  0.0321239 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
528 aa  115  2e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  1.74141e-05  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  29.29 
 
 
559 aa  115  2e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 
525 aa  114  4e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  28.09 
 
 
700 aa  113  7e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.91 
 
 
585 aa  113  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 
531 aa  112  2e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 
546 aa  112  2e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 
546 aa  112  2e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 
603 aa  111  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5316  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  26.43 
 
 
581 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 
557 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 
566 aa  110  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 
572 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 
559 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5410  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 
529 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 
548 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.66 
 
 
532 aa  107  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 
536 aa  107  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  30.61 
 
 
517 aa  106  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 
542 aa  106  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  27.65 
 
 
543 aa  106  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0375  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 
587 aa  106  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>