More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0061 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0061  Phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 
433 aa  872  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.490327 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0551  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.34 
 
 
455 aa  422  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0351  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.8 
 
 
455 aa  413  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.350619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4460  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.75 
 
 
453 aa  315  9e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311483  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.11 
 
 
425 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.18 
 
 
419 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.41 
 
 
419 aa  208  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.64 
 
 
422 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.79 
 
 
591 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.57 
 
 
428 aa  204  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  3.23466e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.88 
 
 
425 aa  203  5e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.25 
 
 
419 aa  202  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.33 
 
 
430 aa  200  4e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0519  phosphoribosylamine/glycine ligase  29.7 
 
 
415 aa  199  8e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.941545  normal  0.807449 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.89 
 
 
423 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.26 
 
 
423 aa  196  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.39 
 
 
425 aa  194  3e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.41 
 
 
424 aa  193  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.79977e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.21 
 
 
423 aa  192  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  32.19 
 
 
430 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.57 
 
 
430 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.57 
 
 
429 aa  190  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.93 
 
 
430 aa  189  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35150  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.11 
 
 
429 aa  189  8e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  27.36 
 
 
420 aa  189  9e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.11 
 
 
428 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  32.12 
 
 
423 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  32.12 
 
 
423 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0195  phosphoribosylamine--glycine ligase  30 
 
 
425 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.28 
 
 
433 aa  187  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.6 
 
 
424 aa  186  6e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  28.97 
 
 
428 aa  186  9e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2413  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.63 
 
 
436 aa  186  9e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545734  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2113  phosphoribosylamine/glycine ligase  27.08 
 
 
416 aa  185  1e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000276572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.87 
 
 
425 aa  185  1e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.06 
 
 
429 aa  184  2e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.89 
 
 
422 aa  184  4e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0127  phosphoribosylamine/glycine ligase  32.64 
 
 
413 aa  183  5e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.37 
 
 
423 aa  183  5e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  30.07 
 
 
428 aa  183  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0267  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.29 
 
 
424 aa  183  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.51 
 
 
433 aa  182  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.28 
 
 
433 aa  182  8e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3600  phosphoribosylamine/glycine ligase  32.48 
 
 
433 aa  182  9e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.25 
 
 
423 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0231  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.19 
 
 
425 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595549  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.64 
 
 
429 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.14 
 
 
423 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.35 
 
 
429 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.49 
 
 
423 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.83828e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3187  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.03 
 
 
438 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0296  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.6 
 
 
426 aa  181  3e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.73 
 
 
423 aa  181  3e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0401  phosphoribosylamine/glycine ligase  30.79 
 
 
428 aa  181  3e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000120381  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0029  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.7 
 
 
423 aa  181  3e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.03 
 
 
446 aa  180  5e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.72 
 
 
436 aa  180  6e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.09 
 
 
423 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5964  phosphoribosylamine/glycine ligase  28.54 
 
 
428 aa  179  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.262465 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.12 
 
 
429 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.6 
 
 
429 aa  179  9e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0676  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.36 
 
 
416 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  29.95 
 
 
428 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1400  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.92 
 
 
420 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.49 
 
 
427 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.25 
 
 
432 aa  179  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3465  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.21 
 
 
456 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1119  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.62 
 
 
421 aa  178  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.7 
 
 
423 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.18 
 
 
425 aa  178  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.12 
 
 
429 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.12 
 
 
429 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.75 
 
 
429 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.68 
 
 
427 aa  178  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02975  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.64 
 
 
427 aa  178  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0569996  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.43 
 
 
431 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2684  phosphoribosylamine/glycine ligase  30.37 
 
 
432 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0337126  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.13 
 
 
423 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.89 
 
 
429 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.9 
 
 
429 aa  176  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.49 
 
 
433 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.28 
 
 
425 aa  176  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0487  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.77 
 
 
427 aa  177  5e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.493201  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.09 
 
 
428 aa  177  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.09 
 
 
428 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0036  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.05 
 
 
424 aa  176  6e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.413084  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0054  phosphoribosylamine/glycine ligase  25.69 
 
 
403 aa  176  7e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.14 
 
 
428 aa  176  1e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.24 
 
 
423 aa  175  1e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.21 
 
 
430 aa  176  1e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.47 
 
 
423 aa  175  1e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.34 
 
 
432 aa  175  1e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18510  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.03 
 
 
429 aa  174  2e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.52 
 
 
429 aa  175  2e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.18 
 
 
422 aa  174  2e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.52 
 
 
429 aa  174  2e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0386  Phosphoribosylamine--glycine ligase  33.41 
 
 
410 aa  174  2e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.65 
 
 
424 aa  174  3e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  30.43 
 
 
429 aa  174  3e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.36 
 
 
423 aa  174  3e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.88348e-06  normal  0.785686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>