241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0058 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0559  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.67 
 
 
922 aa  869  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0808  phosphoenolpyruvate carboxylase  54.73 
 
 
908 aa  913  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0058  Phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 
910 aa  1830  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.424552 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2974  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.58 
 
 
914 aa  853  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2967  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.21 
 
 
910 aa  906  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  1.03268e-05 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0209  Phosphoenolpyruvate carboxylase  51.6 
 
 
912 aa  848  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00083066 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1629  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.2 
 
 
923 aa  826  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2855  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.42 
 
 
922 aa  852  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0226  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.98 
 
 
911 aa  865  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.695017  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3110  phosphoenolpyruvate carboxylase  54.18 
 
 
908 aa  886  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.150886 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0683  Phosphoenolpyruvate carboxylase  51.53 
 
 
922 aa  909  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.781097  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0577  Phosphoenolpyruvate carboxylase  49.67 
 
 
922 aa  880  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.222337 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0606  Phosphoenolpyruvate carboxylase  52.08 
 
 
922 aa  917  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1718  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.55 
 
 
919 aa  512  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.333688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7118  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.02 
 
 
920 aa  506  1e-142  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700949  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1801  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.49 
 
 
922 aa  506  1e-142  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.369049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2137  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.37 
 
 
922 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.24789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1753  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.36 
 
 
922 aa  504  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0935488  normal  0.649239 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5925  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.84 
 
 
946 aa  494  1e-138  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613814  normal  0.197386 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3664  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.35 
 
 
916 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0387741  normal  0.313845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6558  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.18 
 
 
920 aa  480  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.985726  normal  0.0731651 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3255  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.77 
 
 
920 aa  462  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38 
 
 
906 aa  444  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.26 
 
 
929 aa  442  1e-122  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.26 
 
 
929 aa  442  1e-122  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  1.74255e-10 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04694  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.93 
 
 
896 aa  437  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.510612  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  37 
 
 
933 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.53 
 
 
939 aa  425  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.15 
 
 
951 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.26 
 
 
938 aa  416  1e-115  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.56 
 
 
933 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.73 
 
 
933 aa  416  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.33 
 
 
947 aa  416  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.41 
 
 
929 aa  411  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.39 
 
 
946 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.39 
 
 
946 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.39 
 
 
946 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.25 
 
 
936 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.71 
 
 
949 aa  410  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.3 
 
 
932 aa  407  1e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.83 
 
 
1002 aa  407  1e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1822  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.68 
 
 
926 aa  407  1e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.389962  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.48 
 
 
929 aa  409  1e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.71 
 
 
949 aa  409  1e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.84 
 
 
929 aa  406  1e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.17 
 
 
928 aa  404  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5805  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.27 
 
 
914 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.454197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.21 
 
 
936 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.87 
 
 
1001 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.64 
 
 
945 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2522  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.76 
 
 
898 aa  400  1e-110  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314131  normal  0.688456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.37 
 
 
970 aa  402  1e-110  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.7 
 
 
929 aa  401  1e-110  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2536  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.87 
 
 
921 aa  400  1e-110  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366441  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.75 
 
 
949 aa  402  1e-110  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.7 
 
 
985 aa  400  1e-110  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.4 
 
 
928 aa  401  1e-110  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1138  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.86 
 
 
926 aa  403  1e-110  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118011  normal  0.338902 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.65 
 
 
957 aa  400  1e-110  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.49 
 
 
926 aa  402  1e-110  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.29 
 
 
950 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.09332e-07 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.4 
 
 
896 aa  399  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.93 
 
 
947 aa  399  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.56 
 
 
918 aa  396  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2311  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.41 
 
 
900 aa  396  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.900921 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.04 
 
 
920 aa  395  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.32 
 
 
930 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0628  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.99 
 
 
903 aa  393  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.472091  normal  0.156419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.01 
 
 
937 aa  395  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.6 
 
 
934 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.57 
 
 
982 aa  392  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.49 
 
 
952 aa  392  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0994  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.87 
 
 
892 aa  390  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43848  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.76 
 
 
1006 aa  389  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.43 
 
 
946 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1468  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.99 
 
 
898 aa  386  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0472  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.85 
 
 
898 aa  388  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.96 
 
 
1009 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0841  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.43 
 
 
939 aa  385  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.8 
 
 
1075 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3135  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.31 
 
 
929 aa  383  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.365231  normal  0.570221 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.91 
 
 
1088 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.64 
 
 
931 aa  382  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0138  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.58 
 
 
932 aa  382  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.497432 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4375  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.4 
 
 
896 aa  380  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0553395  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.37 
 
 
923 aa  378  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.6 
 
 
994 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.65 
 
 
938 aa  378  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1714  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.14 
 
 
957 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.686661  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.91 
 
 
1004 aa  379  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3372  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.88 
 
 
954 aa  374  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16897  normal  0.0169506 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2494  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.24 
 
 
897 aa  373  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.54 
 
 
998 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.91 
 
 
994 aa  376  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  35 
 
 
1030 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1653  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.83 
 
 
892 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0256628  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.91 
 
 
994 aa  376  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.91 
 
 
994 aa  376  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.65 
 
 
998 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.91 
 
 
1024 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>