36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0054 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0054  TadE family protein  100 
 
 
192 aa  388  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.264779  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1688  TadE family protein  40.22 
 
 
175 aa  115  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.598074  hitchhiker  1.54995e-07 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1267  TadE family protein  38.67 
 
 
175 aa  98.2  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.131769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  32.02 
 
 
170 aa  70.1  2e-11  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  1.25282e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  30 
 
 
162 aa  54.3  1e-06  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  44 
 
 
137 aa  53.5  2e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1409  TadE family protein  37.66 
 
 
217 aa  50.4  1e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.659631  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  45.83 
 
 
140 aa  48.1  8e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  42.86 
 
 
147 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2369  hypothetical protein  51.11 
 
 
163 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00453138  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  30.77 
 
 
156 aa  45.1  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  40.82 
 
 
147 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2705  TadE family protein  33.8 
 
 
154 aa  44.7  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  40.82 
 
 
147 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  42.55 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  40.82 
 
 
147 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  40.82 
 
 
147 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  27.85 
 
 
135 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  38.78 
 
 
148 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  37.21 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  38.78 
 
 
134 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  46.81 
 
 
126 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  40 
 
 
153 aa  43.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  40 
 
 
153 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  32.81 
 
 
165 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  40 
 
 
153 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3347  TadE family protein  35.48 
 
 
140 aa  42.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  40 
 
 
153 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  42.55 
 
 
145 aa  42.4  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  41.6  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  38 
 
 
151 aa  41.6  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  41.67 
 
 
136 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  40.74 
 
 
138 aa  41.6  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  41.67 
 
 
136 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4160  TadE family protein  33.7 
 
 
131 aa  41.2  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1061  TadE family protein  35.29 
 
 
166 aa  41.2  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>