More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0040 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2998  isocitrate lyase  76.92 
 
 
1111 aa  646  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0311  isocitrate lyase  74.88 
 
 
429 aa  634  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.251887  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1480  isocitrate lyase  80.76 
 
 
428 aa  712  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1961  isocitrate lyase  73.58 
 
 
431 aa  662  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1377  isocitrate lyase  77 
 
 
429 aa  642  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.228552  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0028  isocitrate lyase  76 
 
 
427 aa  659  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1210  isocitrate lyase  76.61 
 
 
425 aa  681  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1017  isocitrate lyase  76.76 
 
 
430 aa  683  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1295  isocitrate lyase  71.46 
 
 
434 aa  641  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0485225  normal  0.330509 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0189  isocitrate lyase  72.94 
 
 
433 aa  647  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0259015  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3198  malate synthase A  77.45 
 
 
1111 aa  654  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2490  isocitrate lyase  75.3 
 
 
429 aa  642  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000238202  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3097  malate synthase A  77.45 
 
 
1111 aa  655  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2249  isocitrate lyase  77.73 
 
 
428 aa  674  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.44014  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1385  isocitrate lyase  72.99 
 
 
431 aa  652  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.422305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1232  isocitrate lyase  71.46 
 
 
434 aa  641  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.635123  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1287  isocitrate lyase  74.28 
 
 
443 aa  647  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.745788  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2063  isocitrate lyase  76.42 
 
 
426 aa  682  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.226491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1287  isocitrate lyase  76.37 
 
 
425 aa  679  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.93732e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1030  isocitrate lyase  76.61 
 
 
425 aa  681  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1132  isocitrate lyase  76.61 
 
 
425 aa  681  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00988678  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1033  isocitrate lyase  76.85 
 
 
425 aa  682  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00237406  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1229  isocitrate lyase  76.85 
 
 
425 aa  682  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154992  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4054  isocitrate lyase  78.19 
 
 
492 aa  664  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1358  isocitrate lyase  72.17 
 
 
443 aa  645  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.355427  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0854  isocitrate lyase  75.66 
 
 
425 aa  677  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00269898  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1009  isocitrate lyase  73.1 
 
 
429 aa  639  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2963  malate synthase  75.43 
 
 
1110 aa  637  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.821485  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0040  isocitrate lyase  100 
 
 
426 aa  884  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4375  isocitrate lyase  74.47 
 
 
428 aa  664  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4157  isocitrate lyase  76.61 
 
 
425 aa  681  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0289432  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1229  isocitrate lyase  71.33 
 
 
435 aa  634  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19821 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0665  isocitrate lyase  81.15 
 
 
428 aa  714  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.67053e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1182  isocitrate lyase  76.61 
 
 
425 aa  681  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00317473  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1558  isocitrate lyase  75.61 
 
 
429 aa  634  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0308  isocitrate lyase  74.46 
 
 
429 aa  637  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4164  isocitrate lyase  74.12 
 
 
428 aa  659  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.652432  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1027  isocitrate lyase  76.13 
 
 
425 aa  677  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.156161  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1865  isocitrate lyase  76.94 
 
 
430 aa  639  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1052  isocitrate lyase  76.61 
 
 
425 aa  681  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203555  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0698  isocitrate lyase  76.04 
 
 
435 aa  633  1e-180  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0768  isocitrate lyase  72.45 
 
 
431 aa  632  1e-180  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.139053  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1368  isocitrate lyase  71.56 
 
 
434 aa  633  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.871931  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2067  isocitrate lyase  70.86 
 
 
435 aa  628  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94036  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2088  isocitrate lyase  71.1 
 
 
475 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00747543  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2524  isocitrate lyase  71.1 
 
 
435 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2470  isocitrate lyase  71.1 
 
 
435 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3224  isocitrate lyase  71.1 
 
 
475 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1361  isocitrate lyase  71.1 
 
 
435 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1501  isocitrate lyase  74.75 
 
 
461 aa  630  1e-179  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1998  isocitrate lyase  71.33 
 
 
435 aa  630  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223202  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1614  isocitrate lyase  75.12 
 
 
429 aa  630  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.642543  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1586  isocitrate lyase  71.1 
 
 
435 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0742206  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2613  isocitrate lyase  71.1 
 
 
435 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3930  isocitrate lyase  74.15 
 
 
429 aa  627  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5357  isocitrate lyase  70.16 
 
 
435 aa  625  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1950  isocitrate lyase  70.16 
 
 
435 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8838  normal  0.412611 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4706  isocitrate lyase  72.18 
 
 
438 aa  626  1e-178  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0405  isocitrate lyase  74.88 
 
 
429 aa  626  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156057 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6029  isocitrate lyase  70.86 
 
 
435 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3449  putative isocitrate lyase  75 
 
 
430 aa  625  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0890897  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2048  isocitrate lyase  70.86 
 
 
435 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28360  isocitrate lyase  73.49 
 
 
432 aa  624  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.721222  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2080  isocitrate lyase  70.16 
 
 
435 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250902  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0816  isocitrate lyase  73.41 
 
 
429 aa  622  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.745785  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2486  isocitrate lyase  70.86 
 
 
434 aa  622  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203517  hitchhiker  0.000410073 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0373  isocitrate lyase  74.27 
 
 
429 aa  621  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432855  hitchhiker  0.00124435 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1097  isocitrate lyase  72.55 
 
 
435 aa  622  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1651  isocitrate lyase  71.33 
 
 
434 aa  624  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232298  normal  0.0282677 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1402  isocitrate lyase  69.95 
 
 
422 aa  619  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2006  isocitrate lyase  72.55 
 
 
422 aa  616  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249594  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2985  isocitrate lyase  72.55 
 
 
435 aa  612  1e-174  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.54257  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1429  isocitrate lyase  71.84 
 
 
432 aa  612  1e-174  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6438  isocitrate lyase  69.52 
 
 
443 aa  607  1e-172  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0846232  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1506  isocitrate lyase  68.37 
 
 
432 aa  605  1e-172  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2860  isocitrate lyase  67.82 
 
 
439 aa  603  1e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1335  isocitrate lyase  68.29 
 
 
439 aa  602  1e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0592  isocitrate lyase  71.22 
 
 
432 aa  600  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442111  normal  0.573655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2766  isocitrate lyase  69.44 
 
 
440 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0008216  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2942  isocitrate lyase  69.44 
 
 
440 aa  598  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.337122  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3957  isocitrate lyase  68.51 
 
 
435 aa  598  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02080  isocitrate lyase  68.68 
 
 
435 aa  598  1e-170  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2855  isocitrate lyase  67.82 
 
 
439 aa  598  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0489134 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1276  isocitrate lyase  69.2 
 
 
450 aa  597  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1869  isocitrate lyase  66.67 
 
 
439 aa  595  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.612764  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2101  isocitrate lyase  66.9 
 
 
439 aa  596  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0829587 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2844  isocitrate lyase  69.21 
 
 
440 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166361  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3778  isocitrate lyase  68.28 
 
 
435 aa  597  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03847  hypothetical protein  67.52 
 
 
434 aa  591  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4015  isocitrate lyase  67.52 
 
 
434 aa  591  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.857815  normal  0.048313 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4469  isocitrate lyase  67.52 
 
 
434 aa  591  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0668028  normal  0.0385997 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1484  isocitrate lyase  68.98 
 
 
440 aa  592  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3982  isocitrate lyase  67.52 
 
 
434 aa  591  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03887  isocitrate lyase  67.52 
 
 
434 aa  591  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4509  isocitrate lyase  67.75 
 
 
434 aa  592  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0366  isocitrate lyase  68.05 
 
 
435 aa  593  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4557  isocitrate lyase  67.52 
 
 
434 aa  591  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5485  isocitrate lyase  67.75 
 
 
434 aa  592  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4249  isocitrate lyase  67.52 
 
 
434 aa  591  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4517  isocitrate lyase  67.98 
 
 
434 aa  591  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.169882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>