More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0032 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  39.36 
 
 
1182 aa  769  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  38.25 
 
 
1132 aa  763  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  40.11 
 
 
1183 aa  846  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  38.67 
 
 
1191 aa  828  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  38.58 
 
 
1132 aa  771  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  38.96 
 
 
1176 aa  821  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.68 
 
 
1132 aa  767  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  39.23 
 
 
1197 aa  807  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  40.03 
 
 
1224 aa  858  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.42 
 
 
1132 aa  760  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  100 
 
 
1196 aa  2431  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  39.32 
 
 
1212 aa  833  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  38.88 
 
 
1191 aa  830  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  52.93 
 
 
1150 aa  1169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  41.63 
 
 
1184 aa  841  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  43.85 
 
 
1151 aa  857  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  40.86 
 
 
1178 aa  841  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  38.67 
 
 
1136 aa  769  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  52.76 
 
 
1150 aa  1155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3349  methionine synthase  38.26 
 
 
1214 aa  738  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  40.82 
 
 
1168 aa  825  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  52.84 
 
 
1150 aa  1156  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  38.96 
 
 
1214 aa  789  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  41.85 
 
 
1171 aa  848  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  77.14 
 
 
1208 aa  1890  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  52.42 
 
 
1149 aa  1137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.13 
 
 
1132 aa  773  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  40.79 
 
 
1192 aa  837  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  77.26 
 
 
1254 aa  1894  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  35.96 
 
 
1188 aa  754  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  38.18 
 
 
1182 aa  802  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  35.46 
 
 
1187 aa  743  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  35.75 
 
 
1188 aa  760  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  38.21 
 
 
1216 aa  732  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  42.82 
 
 
1158 aa  858  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  39.33 
 
 
1169 aa  780  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  41.5 
 
 
1167 aa  829  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  38.65 
 
 
1132 aa  765  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1267  methionine synthase  45.43 
 
 
832 aa  730  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  36.76 
 
 
1191 aa  778  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  3.69495e-05 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  65.55 
 
 
1180 aa  1610  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  41.77 
 
 
1171 aa  836  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  40.02 
 
 
1181 aa  801  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  42.88 
 
 
1158 aa  891  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  39.85 
 
 
1199 aa  797  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  41.71 
 
 
1157 aa  857  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.42 
 
 
1133 aa  762  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  37.53 
 
 
1156 aa  758  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  40.7 
 
 
1176 aa  828  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  40.31 
 
 
1178 aa  835  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  41.16 
 
 
1193 aa  796  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  52.38 
 
 
1189 aa  1202  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.68 
 
 
1132 aa  766  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  42.94 
 
 
1154 aa  888  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  40.99 
 
 
1173 aa  843  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.33 
 
 
1132 aa  759  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  42.02 
 
 
1154 aa  874  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.42 
 
 
1133 aa  763  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  38.1 
 
 
1182 aa  801  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  42.27 
 
 
1215 aa  867  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  34.83 
 
 
1266 aa  639  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  41.2 
 
 
1156 aa  828  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  36.39 
 
 
1188 aa  771  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  36.87 
 
 
1163 aa  753  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.33 
 
 
1132 aa  759  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  42.2 
 
 
1169 aa  863  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  40.64 
 
 
1195 aa  791  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  1.02663e-05 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  41.61 
 
 
1190 aa  838  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  39.6 
 
 
1136 aa  776  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.98 
 
 
1208 aa  826  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  40.24 
 
 
1208 aa  835  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  41.94 
 
 
1223 aa  878  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  36.27 
 
 
1236 aa  614  1e-174  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  34.66 
 
 
1228 aa  611  1e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3368  B12-dependent methionine synthase  33.12 
 
 
1233 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  34 
 
 
1250 aa  602  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  33.52 
 
 
1238 aa  600  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  32.79 
 
 
1232 aa  598  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1007  B12-dependent methionine synthase  33.12 
 
 
1244 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0973  B12-dependent methionine synthase  33.04 
 
 
1244 aa  598  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0995  B12-dependent methionine synthase  32.96 
 
 
1244 aa  595  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0391552  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1123  B12-dependent methionine synthase  34.4 
 
 
1246 aa  591  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.833597 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  33.28 
 
 
1237 aa  591  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2965  B12-dependent methionine synthase  33.12 
 
 
1244 aa  591  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  32.6 
 
 
1274 aa  589  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  33.66 
 
 
1245 aa  586  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3545  B12-dependent methionine synthase  33.71 
 
 
1245 aa  587  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.229259 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.55 
 
 
1226 aa  587  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3775  B12-dependent methionine synthase  32.68 
 
 
1227 aa  587  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  33.85 
 
 
1226 aa  588  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  33.36 
 
 
1227 aa  584  1e-165  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  32.85 
 
 
1244 aa  585  1e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0234  B12-dependent methionine synthase  33.87 
 
 
1237 aa  584  1e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.545849  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  33.09 
 
 
1241 aa  582  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0838  B12-dependent methionine synthase  32.69 
 
 
1244 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  32.14 
 
 
1263 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  33.28 
 
 
1232 aa  580  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3184  B12-dependent methionine synthase  32.61 
 
 
1244 aa  578  1e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  32.22 
 
 
1227 aa  576  1e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1894  B12-dependent methionine synthase  33.82 
 
 
1229 aa  578  1e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>