49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0021 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0021  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 
684 aa  1332  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4324  hypothetical protein  38.75 
 
 
620 aa  256  1e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.534524  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4427  hypothetical protein  39.01 
 
 
620 aa  239  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4038  hypothetical protein  29.55 
 
 
596 aa  159  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  32.57 
 
 
1005 aa  76.3  2e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  38.03 
 
 
1067 aa  53.1  2e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  32.26 
 
 
1084 aa  52  3e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.82269e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  33.33 
 
 
1060 aa  51.6  4e-05  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  34.44 
 
 
1062 aa  51.6  5e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  1.93716e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  34.44 
 
 
445 aa  51.6  5e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  34.44 
 
 
1062 aa  51.6  5e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  9.34915e-08 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  26.89 
 
 
1065 aa  51.6  5e-05  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  1.14616e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  34.44 
 
 
1062 aa  51.2  6e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  38.03 
 
 
1062 aa  51.2  7e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  34.44 
 
 
1062 aa  51.2  7e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  36.26 
 
 
1049 aa  50.8  8e-05  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  32.22 
 
 
1066 aa  50.8  9e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  32.77 
 
 
1090 aa  50.4  9e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  62.5 
 
 
914 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  31.13 
 
 
1097 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0140  WD40 domain protein beta Propeller  29.21 
 
 
970 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  38.03 
 
 
1062 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  7.11997e-06 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.9 
 
 
667 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  33.33 
 
 
1062 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  41.07 
 
 
1031 aa  49.7  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  35.21 
 
 
1069 aa  49.3  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  45.31 
 
 
408 aa  48.1  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  31.11 
 
 
1081 aa  48.1  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.72228e-05 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  29.65 
 
 
428 aa  47.8  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  27.94 
 
 
430 aa  47.4  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  29.6 
 
 
443 aa  47.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  32.1 
 
 
416 aa  46.2  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.05 
 
 
675 aa  46.2  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  27.94 
 
 
430 aa  46.6  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0522  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.11 
 
 
610 aa  45.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450113  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  30.16 
 
 
444 aa  45.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  30.16 
 
 
444 aa  45.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  27.89 
 
 
1138 aa  45.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  30.16 
 
 
444 aa  45.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1808  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.54 
 
 
687 aa  44.7  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  1.3403e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  25 
 
 
449 aa  44.3  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  29.37 
 
 
445 aa  44.3  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  33.33 
 
 
1042 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  33.61 
 
 
1082 aa  44.3  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  43.75 
 
 
421 aa  44.7  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0490  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  42.42 
 
 
729 aa  43.9  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  33.33 
 
 
1042 aa  43.9  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  26.32 
 
 
440 aa  43.9  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  37.1 
 
 
1125 aa  43.9  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>