More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0019 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 
378 aa  764  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  64.29 
 
 
377 aa  502  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  60.85 
 
 
377 aa  482  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  47.51 
 
 
381 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  1.66783e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  45.89 
 
 
378 aa  348  9e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  3.28779e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  45.62 
 
 
378 aa  345  6e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  5.12645e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  45.62 
 
 
378 aa  345  1e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  1.28167e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  44.3 
 
 
376 aa  337  2e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.33 
 
 
365 aa  226  6e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.63 
 
 
370 aa  208  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  7.29086e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  33.25 
 
 
390 aa  203  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.45 
 
 
370 aa  201  2e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  32.34 
 
 
394 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.89 
 
 
366 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.89 
 
 
366 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.71 
 
 
367 aa  196  4e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  30.89 
 
 
382 aa  193  5e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.5 
 
 
369 aa  192  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  32 
 
 
393 aa  191  3e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  2.81863e-09 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  32 
 
 
393 aa  191  3e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.39 
 
 
377 aa  188  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.6 
 
 
366 aa  188  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.39 
 
 
377 aa  188  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  31.79 
 
 
385 aa  185  1e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  31.79 
 
 
385 aa  184  2e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.5 
 
 
385 aa  184  2e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.65 
 
 
387 aa  184  2e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.75 
 
 
385 aa  183  5e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  29.59 
 
 
397 aa  182  9e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  29.41 
 
 
386 aa  182  9e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  27.39 
 
 
367 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  30.61 
 
 
381 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  3.41772e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  30.61 
 
 
381 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  29.77 
 
 
386 aa  181  3e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  28.76 
 
 
366 aa  180  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.6 
 
 
366 aa  178  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  5.53224e-06  hitchhiker  3.89013e-07 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  27.48 
 
 
385 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.99 
 
 
385 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.79 
 
 
372 aa  176  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.59068e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  28.2 
 
 
372 aa  176  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.65 
 
 
365 aa  174  2e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  5.99685e-05 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  28.57 
 
 
377 aa  174  3e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.2 
 
 
388 aa  174  3e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  29.77 
 
 
374 aa  173  4e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  5.79402e-05  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  29.64 
 
 
379 aa  173  4e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.2 
 
 
379 aa  173  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.56 
 
 
381 aa  173  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.2 
 
 
379 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  30.15 
 
 
379 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  8.20509e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.2 
 
 
379 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.64 
 
 
379 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  29.2 
 
 
379 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.83 
 
 
381 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  26.72 
 
 
369 aa  171  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  3.52181e-08 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  29.79 
 
 
374 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.53 
 
 
378 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  1.67002e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.34 
 
 
370 aa  170  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.97 
 
 
380 aa  169  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  29.5 
 
 
376 aa  167  3e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.88302e-11  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4118  DNA polymerase III, beta subunit  29.95 
 
 
368 aa  166  7e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.000107371  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.44 
 
 
365 aa  164  2e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.18 
 
 
368 aa  165  2e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0963742  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  28.19 
 
 
366 aa  164  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.05 
 
 
365 aa  163  4e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.57 
 
 
374 aa  163  4e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.53 
 
 
378 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  28.95 
 
 
367 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.54 
 
 
372 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.09 
 
 
373 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.49 
 
 
367 aa  160  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  7.44787e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3032  DNA polymerase III, beta subunit  29.71 
 
 
366 aa  160  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.59 
 
 
368 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.4 
 
 
367 aa  159  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.21 
 
 
372 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.89 
 
 
372 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.76 
 
 
367 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201514  hitchhiker  0.00206466 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0003  DNA polymerase III, beta subunit  26.98 
 
 
366 aa  156  6e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.21 
 
 
372 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.76 
 
 
367 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243689  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.65 
 
 
375 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  4.18991e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4145  DNA polymerase III, beta subunit  28.61 
 
 
368 aa  155  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.258487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4461  DNA polymerase III subunit beta  28.76 
 
 
367 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0591962  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  25.32 
 
 
376 aa  154  3e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  25.32 
 
 
376 aa  154  3e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  4.91978e-05 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0686  DNA polymerase III, beta subunit  29.02 
 
 
366 aa  154  3e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0347365  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.61 
 
 
368 aa  154  3e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  29.26 
 
 
378 aa  153  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  25.32 
 
 
376 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.10658e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.15 
 
 
372 aa  152  6e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.38199e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.38 
 
 
366 aa  152  6e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.366013 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3235  DNA polymerase III, beta subunit  26.18 
 
 
374 aa  153  6e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0867918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.42 
 
 
372 aa  152  6e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.82 
 
 
372 aa  152  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00413752  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  25.58 
 
 
376 aa  152  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  8.41235e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.42 
 
 
372 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0351  DNA polymerase III subunit beta  29.21 
 
 
412 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.16 
 
 
372 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  28.95 
 
 
373 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.57 
 
 
372 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201968  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.93 
 
 
388 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>