More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0012 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
2161 aa  793  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
2153 aa  818  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
3470 aa  768  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
2783 aa  5634  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
884 aa  358  6e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
880 aa  347  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
905 aa  338  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
911 aa  337  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
885 aa  337  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.87 
 
 
1332 aa  284  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
815 aa  236  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.04 
 
 
1480 aa  236  6e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 
718 aa  224  1e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4649  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
533 aa  220  3e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
695 aa  217  2e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 
958 aa  216  5e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4216  diguanylate cyclase  29.13 
 
 
717 aa  214  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
592 aa  212  8e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  1.1549e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
458 aa  208  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
581 aa  207  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
444 aa  207  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
587 aa  204  2e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
899 aa  203  4e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
596 aa  202  6e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
899 aa  201  2e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 
725 aa  200  4e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 
1319 aa  199  8e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
589 aa  196  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
453 aa  195  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
546 aa  193  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 
1002 aa  192  6e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 
701 aa  191  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
594 aa  191  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.43993e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
590 aa  191  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
612 aa  188  1e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
489 aa  187  2e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0937  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
534 aa  187  2e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0830916  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.97 
 
 
1017 aa  186  5e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.22 
 
 
957 aa  186  5e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
584 aa  186  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
827 aa  185  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.94 
 
 
1014 aa  185  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
460 aa  184  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05451  two-component sensor histidine kinase  31.11 
 
 
685 aa  184  3e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15421  two-component sensor histidine kinase  30.9 
 
 
688 aa  184  3e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3226  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
650 aa  184  3e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 
608 aa  183  5e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  33.33 
 
 
537 aa  183  5e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15021  two-component sensor histidine kinase  30.98 
 
 
689 aa  182  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.1145  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 
595 aa  182  7e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437679  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
608 aa  182  9e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3278  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
645 aa  181  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.179777 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 
722 aa  181  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  1.04285e-09 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15271  two-component sensor histidine kinase  30.65 
 
 
688 aa  182  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1439  two-component sensor histidine kinase  30.65 
 
 
689 aa  181  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
584 aa  181  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
599 aa  180  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
619 aa  180  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
492 aa  180  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0351302  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  32.13 
 
 
762 aa  180  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
418 aa  179  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 
1042 aa  179  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.53 
 
 
1021 aa  179  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  29.46 
 
 
571 aa  179  8e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.36 
 
 
646 aa  178  1e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  29.19 
 
 
571 aa  178  2e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 
1527 aa  177  2e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
752 aa  178  2e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 
1039 aa  177  3e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  1.91257e-05 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
611 aa  176  4e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.59 
 
 
687 aa  176  4e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  31.64 
 
 
613 aa  177  4e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  7.19997e-07  hitchhiker  9.90225e-13 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
637 aa  176  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
604 aa  176  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  1.97924e-10  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
556 aa  176  6e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.16 
 
 
961 aa  176  8e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 
625 aa  175  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
758 aa  175  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1776  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 
710 aa  175  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.548217  normal  0.563692 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  31.02 
 
 
470 aa  174  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
590 aa  174  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 
568 aa  174  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
607 aa  174  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
874 aa  174  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  32.31 
 
 
617 aa  173  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
755 aa  172  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
754 aa  172  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0446  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 
1527 aa  172  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  33.71 
 
 
346 aa  171  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  1.16101e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.09 
 
 
944 aa  172  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
556 aa  172  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
609 aa  171  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
600 aa  171  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 
1326 aa  171  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
893 aa  171  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 
669 aa  171  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00391757  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  41.7 
 
 
461 aa  171  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 
456 aa  171  3e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  41.28 
 
 
461 aa  169  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  41.99 
 
 
461 aa  169  6e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>