More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0010 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0524  valyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 
953 aa  776  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2441  valyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
958 aa  748  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.602088  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2799  valyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 
959 aa  774  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4823  valyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
951 aa  764  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.232184  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0253  valyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
904 aa  694  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1591  valyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 
957 aa  772  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888773  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1723  valyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
912 aa  752  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.419395  hitchhiker  0.00814152 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0094  valyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
994 aa  698  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1360  valyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 
955 aa  766  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1434  valyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
963 aa  749  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.02022  normal  0.262872 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3628  valyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
953 aa  732  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0792576 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5880  valyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 
903 aa  756  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1419  valyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
955 aa  777  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1059  valyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 
966 aa  778  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106828  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5430  valyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 
905 aa  744  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0396856  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4240  valyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
948 aa  828  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4738  valyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
951 aa  762  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0366213  normal  0.55715 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02657  valyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 
980 aa  701  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
885 aa  871  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5237  valyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
906 aa  769  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1860  valyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 
938 aa  782  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4861  valyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
951 aa  780  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.522647 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4761  valyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
951 aa  760  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.795159  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1531  valyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 
888 aa  842  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1474  valyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 
1051 aa  780  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333205  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01578  valyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 
924 aa  807  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.337374  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4731  valyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 
951 aa  779  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.342203 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4880  valyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 
951 aa  777  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4824  valyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
951 aa  780  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0533  valyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
942 aa  734  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535322  normal  0.45531 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2381  valyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
903 aa  730  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81105  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1836  valyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 
902 aa  759  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.66816  normal  0.802298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2853  valyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
957 aa  759  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.250427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2036  valyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
918 aa  719  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.895366 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2538  valyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 
897 aa  837  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0406  valyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
904 aa  719  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
865 aa  831  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3754  valyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
951 aa  763  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.775633  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3681  valyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 
965 aa  788  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.470005  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1008  valyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 
971 aa  780  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0987932  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4829  valyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
951 aa  764  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.204033  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4514  valyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
951 aa  762  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00256873  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03637  valyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
952 aa  773  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0367  valyl-tRNA synthetase  69.49 
 
 
907 aa  1287  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.159173  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0874  valyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
920 aa  763  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4237  valyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 
930 aa  745  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19671  normal  0.989502 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3006  valyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 
909 aa  781  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
867 aa  783  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3545  valyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 
965 aa  788  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.562165  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1477  valyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 
1052 aa  810  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516539  normal  0.491266 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
881 aa  863  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2241  valyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 
910 aa  736  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3121  valyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
958 aa  800  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.65477e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1279  valyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
950 aa  815  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4005  valyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 
927 aa  795  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.311642 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0560  valyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 
958 aa  782  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.16607  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0901  valyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 
971 aa  775  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174794  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1729  valyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 
884 aa  801  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  50.33 
 
 
881 aa  872  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  1.4278e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2150  valyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 
907 aa  734  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0616063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0983  valyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 
948 aa  828  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 
879 aa  870  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
881 aa  850  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4694  valyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
906 aa  758  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.146741  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4045  valyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 
965 aa  787  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.230085  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1143  valyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 
920 aa  761  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1874  valyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
955 aa  771  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0384626 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
874 aa  808  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2216  valyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 
970 aa  773  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0832976 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
892 aa  837  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3264  valyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
958 aa  803  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.205067  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18101  valyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 
933 aa  772  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2855  valyl-tRNA synthetase  58.16 
 
 
921 aa  1072  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3872  valyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
872 aa  807  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1151  valyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 
947 aa  757  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0456653  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 
1006 aa  775  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0442  valyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
951 aa  775  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
880 aa  872  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  49.78 
 
 
882 aa  868  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1495  valyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
899 aa  754  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280307  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0251  valyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
886 aa  814  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 
881 aa  866  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  6.51158e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
881 aa  836  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2450  valyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 
887 aa  779  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970931  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1241  valyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
879 aa  768  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11750  valyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
889 aa  691  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.276015  normal  0.0378318 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0705  valyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
909 aa  836  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.727948  normal  0.597989 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12260  valyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 
882 aa  802  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7290  valyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 
882 aa  782  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0570872  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1165  valyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
877 aa  798  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4095  valyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 
880 aa  696  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2685  valyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
888 aa  835  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91784e-09 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1377  valyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
952 aa  752  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2053  valyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 
884 aa  791  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0948742  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002426  valyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
952 aa  779  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2550  valyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 
872 aa  761  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464758  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2474  valyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 
891 aa  844  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1468  valyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 
893 aa  768  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.774867  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2572  valyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
884 aa  742  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00293466  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2069  valyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
998 aa  707  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>