More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0003 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0003  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 378 aa  754    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.761486  hitchhiker  0.000119798 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2027  GntR family transcriptional regulator  47.49 
 
 		 383 aa  322  7e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3001  GntR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 383 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0712  putative transcriptional regulator, GntR family  41.4 
 
 		 375 aa  266  7e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0052998  normal  0.0161379 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 397 aa  263  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1567  GntR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 397 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1049  putative GntR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 		 425 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  34.4 
 
 		 436 aa  229  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 416 aa  229  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 463 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  36.34 
 
 		 433 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  36.51 
 
 		 398 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  35.71 
 
 		 420 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  37.2 
 
 		 398 aa  219  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  37.18 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  36.79 
 
 		 437 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  39.46 
 
 		 377 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 398 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  34.68 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1052  putative transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 398 aa  217  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  35.7 
 
 		 437 aa  216  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  35.11 
 
 		 446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  38.01 
 
 		 430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  36.29 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 393 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  35.98 
 
 		 438 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 438 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  34.51 
 
 		 440 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 		 401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  32.09 
 
 		 399 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 437 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 395 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  35.54 
 
 		 435 aa  212  7.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  33.24 
 
 		 441 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  36.29 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  36.02 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  36.29 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  35.39 
 
 		 416 aa  210  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  32.98 
 
 		 439 aa  210  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 397 aa  209  5e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  33.07 
 
 		 611 aa  209  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 395 aa  209  9e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  34.13 
 
 		 397 aa  209  9e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  35.22 
 
 		 393 aa  209  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  34.58 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  34.6 
 
 		 404 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  32.54 
 
 		 433 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 404 aa  207  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  34.22 
 
 		 406 aa  206  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  34.95 
 
 		 393 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  36.68 
 
 		 417 aa  206  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 399 aa  206  5e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  31.64 
 
 		 397 aa  205  9e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 409 aa  204  2e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  34.22 
 
 		 454 aa  204  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 399 aa  203  3e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 397 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  38.48 
 
 		 400 aa  202  8e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 		 414 aa  202  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 400 aa  202  9.999999999999999e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  32.17 
 
 		 394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 401 aa  199  6e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  34.22 
 
 		 402 aa  199  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  34.57 
 
 		 440 aa  199  9e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  33.42 
 
 		 396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  37.29 
 
 		 416 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  33.95 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  33.42 
 
 		 396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  33.94 
 
 		 410 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 386 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  31.82 
 
 		 436 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  34.95 
 
 		 393 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  34.95 
 
 		 393 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  34.95 
 
 		 393 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  34.95 
 
 		 393 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  34.95 
 
 		 393 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  34.95 
 
 		 393 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 405 aa  196  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  33.68 
 
 		 410 aa  196  7e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  35.29 
 
 		 404 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  28.31 
 
 		 480 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  28.83 
 
 		 480 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  34.29 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  32.44 
 
 		 401 aa  193  5e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 426 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>