More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_2023 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  66.38 
 
 		 471 aa  641    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  70.21 
 
 		 471 aa  673    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  72.49 
 
 		 471 aa  674    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  100 
 
 		 471 aa  964    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  77.49 
 
 		 471 aa  738    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  79.19 
 
 		 471 aa  776    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  74.26 
 
 		 471 aa  703    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  44.3 
 
 		 456 aa  343  5e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  42.01 
 
 		 469 aa  332  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0462  aspartate kinase III  38.77 
 
 		 455 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3769  aspartate kinase III  39.02 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0346162  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  39.48 
 
 		 451 aa  302  9e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3947  aspartate kinase III  38.59 
 
 		 458 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002356  aspartokinase  38.36 
 
 		 450 aa  298  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4479  aspartate kinase III  39.61 
 
 		 455 aa  297  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.829602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  38.26 
 
 		 450 aa  293  6e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0372  aspartate kinase III  38.08 
 
 		 454 aa  289  7e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0372  aspartate kinase III  38.84 
 
 		 461 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0301  aspartate kinase III  38.84 
 
 		 461 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0222  aspartate kinase  40.04 
 
 		 462 aa  288  2e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.774613  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0603  aspartate kinase III  38.97 
 
 		 452 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  39.66 
 
 		 467 aa  286  7e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3919  aspartate kinase III  38.41 
 
 		 461 aa  285  9e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.78738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  36.44 
 
 		 468 aa  282  1e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  35.56 
 
 		 818 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0229  aspartate kinase III  37.53 
 
 		 449 aa  281  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0205463  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0346  aspartate kinase  36.38 
 
 		 465 aa  279  7e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2004  aspartate kinase III  35.21 
 
 		 456 aa  277  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0535  aspartate kinase III  38.97 
 
 		 459 aa  277  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.04 
 
 		 817 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1642  aspartate kinase  36.38 
 
 		 468 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03418  aspartate kinase III  36.36 
 
 		 449 aa  273  6e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000466048  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0817  aspartate kinase III  38.33 
 
 		 450 aa  273  6e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.784951  hitchhiker  0.0000472432 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0259  aspartate kinase  36.38 
 
 		 468 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.889739  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0577  aspartate kinase  35.96 
 
 		 468 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.798745  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03896  aspartate kinase III  38.03 
 
 		 449 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3973  aspartate kinase  38.03 
 
 		 449 aa  272  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03856  hypothetical protein  38.03 
 
 		 449 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5502  aspartate kinase III  38.03 
 
 		 449 aa  272  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3840  aspartate kinase III  37.58 
 
 		 451 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135381  hitchhiker  0.000112136 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4529  aspartate kinase III  38.03 
 
 		 449 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4485  aspartate kinase III  38.03 
 
 		 449 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0735  aspartate kinase III  38.09 
 
 		 456 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000266355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4572  aspartate kinase III  38.03 
 
 		 449 aa  270  5e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4263  aspartate kinase III  38.03 
 
 		 449 aa  270  5e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25490  aspartate kinase  42.42 
 
 		 450 aa  270  5.9999999999999995e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4411  aspartate kinase III  37.47 
 
 		 449 aa  270  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135104  normal  0.165896 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4477  aspartate kinase III  37.47 
 
 		 449 aa  269  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4562  aspartate kinase III  37.47 
 
 		 449 aa  269  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4562  aspartate kinase III  37.47 
 
 		 449 aa  269  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.379136 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4614  aspartate kinase III  37.47 
 
 		 449 aa  269  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.476812 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2982  aspartate kinase III  37.53 
 
 		 449 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0788  aspartate kinase III  37.37 
 
 		 451 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3717  aspartate kinase III  37.37 
 
 		 451 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345443  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6475  aspartate kinase  37.04 
 
 		 446 aa  268  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4006  aspartate kinase III  37.82 
 
 		 449 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.193511 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3658  aspartate kinase III  37.31 
 
 		 451 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.492894  hitchhiker  0.000000794712 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.32 
 
 		 815 aa  267  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3986  aspartate kinase III  37.02 
 
 		 451 aa  267  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3079  aspartate kinase  39.96 
 
 		 467 aa  266  7e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244781  hitchhiker  0.00296029 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0653  aspartate kinase III  37 
 
 		 451 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.515096  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3369  aspartate kinase III  37 
 
 		 451 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000680196  hitchhiker  0.00822859 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0652  aspartate kinase III  37 
 
 		 451 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000108783  normal  0.0665157 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0680  aspartate kinase III  36.6 
 
 		 451 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5429  aspartate kinase  35.81 
 
 		 815 aa  264  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.788208  normal  0.56505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4508  aspartate kinase  37.98 
 
 		 478 aa  264  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.995886  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  34.04 
 
 		 814 aa  263  6e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3817  aspartate kinase  36.11 
 
 		 452 aa  262  8e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00114248  normal  0.367639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3054  aspartate kinase  37.77 
 
 		 465 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2189  aspartate kinase  35.95 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1127  aspartate kinase  36.03 
 
 		 470 aa  260  4e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.892413  hitchhiker  0.00887106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6874  aspartate kinase  35.93 
 
 		 440 aa  259  8e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.52096 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0401  aspartate kinase  37.34 
 
 		 462 aa  259  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.271601 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2333  aspartate kinase  34.57 
 
 		 437 aa  259  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299294  normal  0.136558 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0779  aspartate kinase III  38.46 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705118  hitchhiker  0.0010565 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  35.91 
 
 		 541 aa  256  5e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.33 
 
 		 815 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0861  aspartate kinase  35.68 
 
 		 472 aa  251  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3721  aspartate kinase  32.97 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14309  normal  0.63585 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0843  aspartate kinase  34.25 
 
 		 468 aa  251  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  35.24 
 
 		 823 aa  249  6e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.35 
 
 		 818 aa  249  7e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1820  aspartate kinase  34.39 
 
 		 466 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000320312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1754  aspartate kinase  32.47 
 
 		 467 aa  248  1e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3764  aspartate kinase III  37.31 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226925  hitchhiker  0.00174261 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.11 
 
 		 819 aa  245  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0142  aspartate kinase  35.55 
 
 		 463 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1253  aspartate kinase  34.76 
 
 		 465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.312523  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3425  aspartate kinase III  39.65 
 
 		 452 aa  243  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000055532  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1139  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.3 
 
 		 822 aa  242  9e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0421485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1138  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.09 
 
 		 822 aa  242  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.592327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5632  aspartate kinase  34.28 
 
 		 441 aa  240  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000704481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1980  aspartate kinase  34.27 
 
 		 469 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0255525  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1209  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.88 
 
 		 822 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2556  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.77 
 
 		 819 aa  238  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2735  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.56 
 
 		 822 aa  236  9e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331448  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1175  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.3 
 
 		 821 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004457  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  33.19 
 
 		 819 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1271  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.95 
 
 		 822 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.279623  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3415  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.2 
 
 		 822 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>