More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_2015 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_2015  ATP synthase F1, epsilon subunit  100 
 
 
88 aa  176  8e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0049  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  73.86 
 
 
88 aa  137  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.116999  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0020  ATP synthase F1, epsilon subunit  72.73 
 
 
88 aa  137  7e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.118966 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0048  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  72.73 
 
 
88 aa  136  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0028  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  70.45 
 
 
88 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0047  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  72.73 
 
 
88 aa  131  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0030  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  62.5 
 
 
88 aa  120  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00561191  normal  0.882026 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5126  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  48.75 
 
 
81 aa  80.1  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285472  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3416  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  43.21 
 
 
80 aa  73.9  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3764  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  46.15 
 
 
80 aa  72.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0911  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  43.42 
 
 
78 aa  72  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2381  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.97 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7072  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  41.56 
 
 
83 aa  69.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.689202  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0565  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.77 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0344  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.59 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0213495 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_504  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.77 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115824  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0337  H+-transporting two-sector ATPase, epsilon subunit  43.59 
 
 
80 aa  69.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0539  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.51 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000746068  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0072  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.56 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0836713  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01405  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.56 
 
 
92 aa  66.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.913461  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.68 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.68 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0818  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  35.16 
 
 
93 aa  64.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.51 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4347  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.71 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2189  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.24 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4483  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.71 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4502  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.71 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.68 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1739  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.84 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.577687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3219  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.94 
 
 
135 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816212  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0217  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.97 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.812773  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0084  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.33 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.78895  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1046  ATP synthase F1, epsilon subunit  35 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.100266 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0115  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.8 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0115  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.9 
 
 
129 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0001138  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.68 
 
 
142 aa  60.8  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1028  hypothetical protein  38.16 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0918  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.21 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0350639  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21390  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  36.36 
 
 
87 aa  60.1  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1798  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.53 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0434  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.639575  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0062  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.18 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1106  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.53 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4869  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.04 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1524  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.84 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000172904  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0103  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.33 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0143  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.33 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000440039  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2377  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.24 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163402 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4164  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.73 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000197005  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0892  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.04 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0173  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.9 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4494  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.18 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3939  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.44 
 
 
135 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3735  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.68 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0810  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.18 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116067  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3628  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  40 
 
 
94 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160412  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0604  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.8 
 
 
133 aa  57  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000108005  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1731  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.68 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4010  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  40 
 
 
94 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000597874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6913  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3283  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.57 
 
 
141 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3650  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.18 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.33 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1402  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.62 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.537501  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1227  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  32 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0528  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.9 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1423  ATP synthase F1, epsilon subunit  27.16 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3021  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.59 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4790  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.91 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2403  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0560  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.71 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.53 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2609  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.38 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.182872  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.9 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.300977  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17790  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.25 
 
 
134 aa  55.1  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1764  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.47 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.05 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00211971  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0013  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.36 
 
 
140 aa  54.3  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.1 
 
 
140 aa  54.3  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2921  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.91 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0027  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.17 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1695  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.76 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0409  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.9 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.384593 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3457  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.21 
 
 
137 aa  53.5  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0198  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4104  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.38 
 
 
135 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.205701  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0516  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.05 
 
 
131 aa  53.5  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0170  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.62 
 
 
135 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41505  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4735  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.49 
 
 
86 aa  52.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461948 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1773  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  36.36 
 
 
92 aa  53.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.960325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1466  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.77 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.47 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1050  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.33 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6634  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.1 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0501397 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.44 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0373  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.47 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0874  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.33 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18170  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  32.5 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.316901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>