More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1997 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1997  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
248 aa  511  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0088  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  60.82 
 
 
185 aa  223  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0092  TPR repeat-containing protein  55.56 
 
 
186 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0096  TPR repeat-containing protein  50.29 
 
 
191 aa  195  6e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00110052  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2669  TPR repeat-containing protein  47.46 
 
 
189 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00543716  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0131  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 
192 aa  137  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0110  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.1 
 
 
180 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.563747 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  37.16 
 
 
404 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
357 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
187 aa  91.7  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  33.79 
 
 
334 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  36.84 
 
 
581 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
306 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  36.31 
 
 
233 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  38.35 
 
 
582 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.26 
 
 
406 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.26 
 
 
406 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  33.79 
 
 
306 aa  89  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  35.17 
 
 
361 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.79 
 
 
174 aa  86.3  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0341047  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  34.06 
 
 
462 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  33.12 
 
 
706 aa  85.5  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  37.98 
 
 
706 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22531  TPR repeat-containing protein  32.87 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 
280 aa  78.6  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 
301 aa  78.6  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  34.78 
 
 
750 aa  77  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.88 
 
 
542 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1828  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.28 
 
 
175 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.68 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.36 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  37.3 
 
 
539 aa  76.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.85 
 
 
1056 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 
617 aa  75.5  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.86 
 
 
219 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  35.66 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.13 
 
 
818 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  34.53 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  35.61 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 
649 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  34.53 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1770  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0543  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.34 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 
349 aa  73.2  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 
556 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.78 
 
 
1022 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 
547 aa  72.4  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 
1827 aa  72.4  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 
295 aa  72  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 
1276 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  30.46 
 
 
820 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 
1421 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20381  hypothetical protein  27.95 
 
 
164 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136589 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.37 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.04 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.06 
 
 
988 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2558  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.62 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 
308 aa  68.6  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
331 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.47 
 
 
1056 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.89 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  30.22 
 
 
269 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
605 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  33.83 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.05 
 
 
738 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.88 
 
 
746 aa  66.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.41 
 
 
784 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.92 
 
 
632 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3982  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 
305 aa  64.7  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.588459  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.56 
 
 
471 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.37 
 
 
373 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.64 
 
 
810 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1162  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 
205 aa  64.3  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.81 
 
 
778 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 
3560 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 
271 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
422 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 
391 aa  63.5  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
543 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
446 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  28.37 
 
 
635 aa  63.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3965  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 
425 aa  62.8  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.25 
 
 
286 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  35.25 
 
 
286 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
4079 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.55 
 
 
466 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 
750 aa  62  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  33.03 
 
 
1240 aa  62  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
236 aa  62  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4354  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 
304 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>