More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1910 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  100 
 
 		 440 aa  896    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  58.1 
 
 		 444 aa  511  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  57.75 
 
 		 442 aa  498  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  53.76 
 
 		 440 aa  479  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  53.95 
 
 		 449 aa  464  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  50.11 
 
 		 441 aa  435  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  48.31 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  42.96 
 
 		 438 aa  329  6e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  37.47 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  35.32 
 
 		 432 aa  276  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  37.63 
 
 		 457 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  36 
 
 		 429 aa  265  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  37.59 
 
 		 430 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  35.56 
 
 		 435 aa  252  7e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  39.34 
 
 		 407 aa  249  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  38.44 
 
 		 407 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  34.64 
 
 		 427 aa  246  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  34.56 
 
 		 428 aa  232  1e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  37.5 
 
 		 445 aa  223  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  31.5 
 
 		 434 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  31.76 
 
 		 434 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  31.4 
 
 		 437 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  31.23 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  30.05 
 
 		 422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.05 
 
 		 422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  31.4 
 
 		 428 aa  200  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  32.02 
 
 		 441 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  34.65 
 
 		 441 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  29.36 
 
 		 443 aa  192  9e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  31.28 
 
 		 437 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  29.86 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  31.77 
 
 		 438 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 438 aa  190  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  33.55 
 
 		 440 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  31.37 
 
 		 450 aa  189  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 425 aa  186  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0588  WD40 domain protein beta Propeller  34.29 
 
 		 439 aa  186  7e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000301748  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  29.22 
 
 		 427 aa  186  8e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  33.44 
 
 		 421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1585  WD40 domain protein beta Propeller  28.9 
 
 		 437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.637887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  31.02 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  30.32 
 
 		 432 aa  184  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  31.49 
 
 		 434 aa  184  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  30.89 
 
 		 442 aa  183  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  30.49 
 
 		 415 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  34.52 
 
 		 441 aa  182  9.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  34.94 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  31.4 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  30.32 
 
 		 434 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3632  tolB protein, putative  30.18 
 
 		 441 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000231281  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  32.69 
 
 		 421 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  28.85 
 
 		 430 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  30.61 
 
 		 446 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  29.71 
 
 		 450 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  31.21 
 
 		 435 aa  176  6e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  33.54 
 
 		 439 aa  176  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  28.85 
 
 		 430 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  31.8 
 
 		 434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2360  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.51 
 
 		 446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.28939 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  28.36 
 
 		 430 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  29.51 
 
 		 433 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  29.51 
 
 		 433 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  29.57 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  28.8 
 
 		 419 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  28.7 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  28.54 
 
 		 431 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  28.54 
 
 		 431 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  28.78 
 
 		 431 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  29.79 
 
 		 461 aa  170  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  28.5 
 
 		 436 aa  170  6e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  29.25 
 
 		 419 aa  169  7e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  29.36 
 
 		 450 aa  169  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  29.61 
 
 		 449 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  28.98 
 
 		 431 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  29.24 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  28.98 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  29.33 
 
 		 449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  28.38 
 
 		 403 aa  167  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  26.39 
 
 		 423 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  28.72 
 
 		 431 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  29.03 
 
 		 444 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  29.53 
 
 		 444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  32.05 
 
 		 408 aa  166  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  29.53 
 
 		 444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  26.16 
 
 		 423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  25.93 
 
 		 433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  28.99 
 
 		 427 aa  163  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  25.93 
 
 		 423 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  28.41 
 
 		 436 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  29.31 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.23 
 
 		 442 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  29.4 
 
 		 469 aa  160  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000201302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  30.32 
 
 		 439 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  32.1 
 
 		 443 aa  160  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0278  WD40 domain-containing protein  29.35 
 
 		 463 aa  160  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000605867  unclonable  0.0000100324 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  26.44 
 
 		 432 aa  159  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  29.46 
 
 		 425 aa  159  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  26.42 
 
 		 443 aa  159  8e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  30.05 
 
 		 445 aa  159  8e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>