More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1845 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1845  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 253 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.478423  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0295  30S ribosomal protein S3  92.89 
 
 		 249 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2223  30S ribosomal protein S3  94.81 
 
 		 251 aa  448  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000780693  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2417  30S ribosomal protein S3  92.64 
 
 		 250 aa  437  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000314718  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0187  30S ribosomal protein S3  86.64 
 
 		 252 aa  436  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000114695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2058  30S ribosomal protein S3  90.91 
 
 		 251 aa  435  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00124748  normal  0.255543 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2290  30S ribosomal protein S3  88.14 
 
 		 252 aa  408  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000815753  hitchhiker  0.00311978 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  56.19 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5781  ribosomal protein S3  56.34 
 
 		 302 aa  252  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.336905 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  54.76 
 
 		 219 aa  250  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  52.59 
 
 		 223 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  49.79 
 
 		 243 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  49.79 
 
 		 243 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4349  30S ribosomal protein S3  54.46 
 
 		 275 aa  244  6.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122787  normal  0.048354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0262  30S ribosomal protein S3  47.49 
 
 		 301 aa  244  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3156  30S ribosomal protein S3  54.93 
 
 		 254 aa  244  9e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0220  ribosomal protein S3  53.37 
 
 		 210 aa  244  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 237 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  52.97 
 
 		 226 aa  242  5e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0704  30S ribosomal protein S3  48.55 
 
 		 236 aa  241  5e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220755  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0672  30S ribosomal protein S3  48.55 
 
 		 236 aa  241  5e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114905  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  50.42 
 
 		 252 aa  242  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  52.36 
 
 		 210 aa  241  7.999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  54.29 
 
 		 220 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  52.36 
 
 		 223 aa  241  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000695636  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  54.29 
 
 		 218 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  50.21 
 
 		 235 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  53.33 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  49.79 
 
 		 236 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2812  30S ribosomal protein S3  49.58 
 
 		 235 aa  239  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102151  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1360  ribosomal protein S3  54.29 
 
 		 241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.0370461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  51.43 
 
 		 211 aa  239  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  52.58 
 
 		 218 aa  239  4e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1771  30S ribosomal protein S3  50.66 
 
 		 232 aa  239  4e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000585037  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 214 aa  238  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  52.7 
 
 		 219 aa  238  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  51.8 
 
 		 219 aa  238  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2972  30S ribosomal protein S3  52.73 
 
 		 225 aa  239  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.845651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  53.33 
 
 		 218 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0326  30S ribosomal protein S3  48.28 
 
 		 232 aa  238  6.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364603  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  50.94 
 
 		 278 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  50.21 
 
 		 232 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0090  30S ribosomal protein S3  53.39 
 
 		 231 aa  238  8e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0574  ribosomal protein S3  51.32 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0475  30S ribosomal protein S3  51.43 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00134596  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001736  SSU ribosomal protein S3p (S3e)  47.62 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  51.43 
 
 		 210 aa  237  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1940  30S ribosomal protein S3  51.36 
 
 		 225 aa  237  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  52.25 
 
 		 219 aa  237  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  52.25 
 
 		 219 aa  237  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  52.25 
 
 		 219 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  52.25 
 
 		 219 aa  237  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  52.25 
 
 		 219 aa  237  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  52.25 
 
 		 219 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0325  30S ribosomal protein S3  51.9 
 
 		 261 aa  236  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.85995e-16  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1370  30S ribosomal protein S3  49.79 
 
 		 231 aa  237  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  51.64 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  52.25 
 
 		 219 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  49.79 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3178  30S ribosomal protein S3  49.79 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  52.25 
 
 		 219 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0154  30S ribosomal protein S3  48.47 
 
 		 229 aa  236  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000551432  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1789  SSU ribosomal protein S3P  52.75 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.309908  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1027  30S ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000269281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  52.25 
 
 		 219 aa  237  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  55.24 
 
 		 236 aa  236  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4907  30S ribosomal protein S3  52.38 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0459562  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0694  ribosomal protein S3  45.24 
 
 		 282 aa  236  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  50.21 
 
 		 231 aa  235  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  47.6 
 
 		 229 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  53.05 
 
 		 219 aa  235  5.0000000000000005e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1561  ribosomal protein S3  53.33 
 
 		 233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  51.9 
 
 		 256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2681  ribosomal protein S3  51.6 
 
 		 276 aa  235  6e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2446  ribosomal protein S3  53.33 
 
 		 248 aa  235  6e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0056  ribosomal protein S3  50.95 
 
 		 271 aa  235  6e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.000000000000180668  hitchhiker  1.0517300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2168  ribosomal protein S3  53.33 
 
 		 248 aa  235  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00736  30S ribosomal protein S3  47.19 
 
 		 232 aa  234  7e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0059  ribosomal protein S3  50.95 
 
 		 275 aa  234  7e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000192317  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  52.29 
 
 		 227 aa  234  8e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  52.29 
 
 		 227 aa  234  8e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2129  ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 248 aa  234  9e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.429997 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1255  30S ribosomal protein S3  49.55 
 
 		 231 aa  234  9e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.378037  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3789  30S ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 298 aa  234  9e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.461405  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1347  30S ribosomal protein S3  49.55 
 
 		 231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5130  ribosomal protein S3  50.96 
 
 		 268 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.805435 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  51.36 
 
 		 222 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3437  30S ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0722902  normal  0.23465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3137  ribosomal protein S3  50.7 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1914  ribosomal protein S3  53.33 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0533377  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2969  SSU ribosomal protein S3P  52.83 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.530475  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0040  30S ribosomal protein S3  48.91 
 
 		 232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0666312  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  48.23 
 
 		 230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0344  30S ribosomal protein S3  52.38 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.212701  decreased coverage  0.000331478 
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  51.9 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1092  SSU ribosomal protein S3P  50 
 
 		 288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0427  30S ribosomal protein S3  51.9 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159032  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1962  ribosomal protein S3  48.54 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.180974  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  52.38 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0209  30S ribosomal protein S3  52.38 
 
 		 295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>