More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1840 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1840  50S ribosomal protein L24  100 
 
 
80 aa  157  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0647015  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0300  50S ribosomal protein L24  90 
 
 
80 aa  144  5e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2412  50S ribosomal protein L24  82.5 
 
 
80 aa  130  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000749977  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2218  50S ribosomal protein L24  80 
 
 
80 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000567909  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2285  50S ribosomal protein L24  80 
 
 
80 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000123735  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0192  50S ribosomal protein L24  77.5 
 
 
80 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0553712  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2053  50S ribosomal protein L24  75.95 
 
 
80 aa  122  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000596769  normal  0.391774 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  59.21 
 
 
118 aa  87.8  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  65.22 
 
 
107 aa  86.7  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0702  50S ribosomal protein L24  59.42 
 
 
117 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000192817  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2570  50S ribosomal protein L24  56.52 
 
 
115 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949988  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  63.77 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  59.42 
 
 
119 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0238  50S ribosomal protein L24  56.94 
 
 
117 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0241  50S ribosomal protein L24  56.94 
 
 
117 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19921  50S ribosomal protein L24  52.11 
 
 
118 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  54.93 
 
 
115 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  61.76 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1274  ribosomal protein L24  51.61 
 
 
127 aa  82.8  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23131  50S ribosomal protein L24  51.39 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  59.15 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  57.97 
 
 
106 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1966  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
118 aa  82  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2221  50S ribosomal protein L24  56.52 
 
 
113 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  60.87 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  56.34 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  60.29 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  60.87 
 
 
106 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  59.42 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  59.42 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1118  50S ribosomal protein L24  50.7 
 
 
118 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  53.62 
 
 
109 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0365  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
118 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.889516  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  60.29 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  60.29 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  60.29 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  60.29 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  60.29 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  60.29 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  60.29 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  60.29 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  60.29 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  60.29 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  60.29 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  58.82 
 
 
104 aa  78.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  55.07 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  56.52 
 
 
106 aa  77.4  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  55.71 
 
 
106 aa  77  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  55.71 
 
 
104 aa  77  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  55.71 
 
 
104 aa  77  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  57.58 
 
 
109 aa  77  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  55.07 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1639  50S ribosomal protein L24  44.74 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16671  50S ribosomal protein L24  48.53 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  53.62 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  53.62 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17541  50S ribosomal protein L24  44.74 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  55.07 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17291  50S ribosomal protein L24  45.83 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0070  50S ribosomal protein L24  50.68 
 
 
75 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.033879  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  56.52 
 
 
116 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000440948  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  53.42 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  57.97 
 
 
110 aa  73.9  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  54.41 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17381  50S ribosomal protein L24  43.42 
 
 
118 aa  73.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  54.17 
 
 
115 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  54.41 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  52.17 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  52.17 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  56.06 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  53.62 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  57.35 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  56.72 
 
 
107 aa  72  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2896  ribosomal protein L24  51.35 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  56.72 
 
 
107 aa  72  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  55.56 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  51.47 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0606  50S ribosomal protein L24P  54.41 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000125199  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  54.41 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1864  50S ribosomal protein L24  48.61 
 
 
77 aa  71.2  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  52.24 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  50.72 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1693  50S ribosomal protein L24  48.61 
 
 
77 aa  71.2  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0105327  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17263  Plastid ribosomal protein L24 large ribosomal subunit  46.48 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00177842  decreased coverage  0.00283524 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  54.41 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17050  50S ribosomal protein L24  56.52 
 
 
113 aa  70.5  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000932171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  54.41 
 
 
106 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  50.72 
 
 
101 aa  70.1  0.000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  54.55 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  53.52 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  54.55 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2070  50S ribosomal protein L24  47.22 
 
 
77 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.419716  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  53.73 
 
 
110 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  51.35 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0573  50S ribosomal protein L24  49.33 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>