192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1777 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1777  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 143 aa  300  5.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406004  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4019  PilT protein-like  52.82 
 
 		 144 aa  154  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  51.45 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  48.18 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1048  PilT protein domain protein  47.1 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.71366  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  41.43 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1070  PilT protein-like protein  47.06 
 
 		 145 aa  116  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3575  PilT protein domain protein  42.34 
 
 		 140 aa  115  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00704853  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  39.86 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  40.29 
 
 		 140 aa  110  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1045  PilT domain-containing protein  40.88 
 
 		 139 aa  110  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0543043  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23550  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain protein  41.01 
 
 		 142 aa  107  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46968  normal  0.640927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  39.86 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  38.41 
 
 		 140 aa  104  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  41.01 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3027  PilT protein domain protein  38.13 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4151  PilT protein-like  41.73 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1880  PilT-type plasmid stability protein  41.73 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4764  PilT domain-containing protein  38.41 
 
 		 138 aa  98.6  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.310304 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0018  plasmid stability protein StbB  38.85 
 
 		 139 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0242004  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4619  PilT domain-containing protein  35.77 
 
 		 159 aa  97.8  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0896  PilT protein-like  35.77 
 
 		 139 aa  97.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4710  PilT domain-containing protein  35.04 
 
 		 139 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0469  PilT domain-containing protein  36.96 
 
 		 141 aa  97.1  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4188  PilT domain-containing protein  35.04 
 
 		 139 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.990127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3889  PilT domain-containing protein  38.69 
 
 		 142 aa  97.1  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3180  PilT domain-containing protein  40.88 
 
 		 141 aa  96.7  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3797  PilT domain-containing protein  36.5 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238578 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1045  putative nucleic acid-binding protein  37.68 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.883513  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2795  PilT domain-containing protein  38.85 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.517688  normal  0.128803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  37.86 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2332  PilT protein-like  35.71 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.221502 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3569  PilT protein domain protein  35.51 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5841  PilT domain-containing protein  37.23 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  38.69 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7721  plasmid stability protein  39.13 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.859418 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1456  PilT protein domain protein  36.5 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.208651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1710  PilT domain-containing protein  40.88 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.164761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1780  plasmid stability protein, putative  36.5 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0076  PilT protein domain protein  36.5 
 
 		 140 aa  92  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3138  PilT protein-like  38.97 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464533  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3192  PilT domain-containing protein  36.5 
 
 		 141 aa  90.1  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  33.1 
 
 		 141 aa  89.4  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2302  plasmid stabilization protein  34.78 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  39.71 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  36.23 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1214  PilT domain-containing protein  37.68 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3521  PilT domain-containing protein  37.68 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764562 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3455  PilT protein, N-terminal  39.13 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1876  plasmid stabilization protein StbB-like  40.29 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.417395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4674  PilT protein domain protein  38.46 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4284  prevent-host-death protein  36.03 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.600657  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4334  PilT domain-containing protein  37.23 
 
 		 139 aa  87  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  32.61 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4210  PilT domain-containing protein  37.23 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.242184  normal  0.98897 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2075  PilT domain-containing protein  34.06 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0526989 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4575  PilT protein-like  35.29 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2505  PilT protein domain protein  35.62 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  33.57 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0728  PilT protein domain protein  34.06 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1964  PilT protein domain protein  36.96 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2640  PilT domain-containing protein  35.97 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  33.1 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4574  PilT domain-containing protein  32.88 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0680986  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0155  PilT protein domain protein  34.53 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.538447 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0805  PilT protein-like  35.51 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0792  nucleic acid binding protein  35.85 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.705991  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  32.62 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1400  PilT protein domain protein  31.16 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.310156 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0624  PilT protein-like  33.1 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.810517  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  33.09 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4589  PilT protein domain protein  31.91 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000022459  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0713  PilT domain-containing protein  28.99 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000185206  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  36.17 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  32.65 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  33.81 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  35.04 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  33.11 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0057  PilT protein domain protein  30 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  31.25 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1213  PilT domain-containing protein  32.39 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6402  PilT protein domain protein  32.19 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2987  PilT protein domain protein  34.04 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  31.39 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  34.72 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3418  PilT protein, N-terminal  33.33 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  33.58 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4543  PilT protein domain protein  32.87 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1602  PilT protein-like  33.57 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  31.65 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  31.11 
 
 		 136 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3962  PilT domain-containing protein  30.43 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1997 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  30.34 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6277  PilT protein domain protein  30.94 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.466445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  31.51 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  31.51 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  31.51 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2919  PilT protein domain protein  29.37 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3732  nucleic acid-binding protein  31.62 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2826  PilT protein-like  30.56 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>