More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1753 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1753  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  502  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  71.6 
 
 
251 aa  350  2e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  70.68 
 
 
253 aa  336  1.9999999999999998e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2160  integral membrane protein TerC  77.11 
 
 
249 aa  334  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  66.53 
 
 
250 aa  332  3e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2490  Integral membrane protein TerC  75.7 
 
 
251 aa  331  5e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  68.31 
 
 
249 aa  331  7.000000000000001e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  66.13 
 
 
248 aa  329  3e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2087  Integral membrane protein TerC  77.02 
 
 
248 aa  323  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  62.65 
 
 
248 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  64.78 
 
 
247 aa  299  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  62.61 
 
 
238 aa  298  7e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  59.92 
 
 
250 aa  295  7e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  59.57 
 
 
241 aa  291  6e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  61.63 
 
 
259 aa  291  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  58.2 
 
 
259 aa  290  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  59.36 
 
 
252 aa  287  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  57.92 
 
 
246 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  55.08 
 
 
253 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  59.6 
 
 
253 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  62.4 
 
 
245 aa  280  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2187  Integral membrane protein TerC  64.85 
 
 
245 aa  280  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  60.08 
 
 
255 aa  280  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  65.24 
 
 
241 aa  280  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000873859 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  56.9 
 
 
239 aa  280  2e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5995  hypothetical protein  64.4 
 
 
252 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69320  putative integral membrane transport protein  64.4 
 
 
252 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  58.51 
 
 
250 aa  276  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49600  Integral membrane protein TerC family  59.51 
 
 
248 aa  275  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0146  integral membrane protein TerC  58.82 
 
 
265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.125302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0164  integral membrane protein TerC  58.82 
 
 
256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0032  integral membrane protein TerC  57.25 
 
 
255 aa  272  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43134  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  58.57 
 
 
257 aa  272  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  60.74 
 
 
249 aa  273  3e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0162  integral membrane protein TerC  58.43 
 
 
256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  57.92 
 
 
238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5081  integral membrane protein TerC  58.59 
 
 
256 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0792895 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  58.4 
 
 
241 aa  270  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6267  hypothetical protein  60.73 
 
 
254 aa  270  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47510  integral membrane protein  58.8 
 
 
252 aa  267  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  56.52 
 
 
253 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  56.52 
 
 
253 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  57.98 
 
 
238 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  58.82 
 
 
264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  56.52 
 
 
253 aa  265  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  59.5 
 
 
253 aa  263  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  58.92 
 
 
250 aa  261  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  56.35 
 
 
295 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1505  integral membrane protein TerC  54.36 
 
 
241 aa  259  4e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0874873 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0787  integral membrane protein TerC  57.09 
 
 
256 aa  258  7e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1505  integral membrane protein TerC  59.26 
 
 
244 aa  257  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1725  Integral membrane protein TerC  58.23 
 
 
268 aa  257  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  51.71 
 
 
253 aa  254  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3826  integral membrane protein TerC  57.2 
 
 
238 aa  253  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000678399  normal  0.474132 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72180  putative membrane protein TerC  58.87 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.559812  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5729  Integral membrane protein TerC  60.08 
 
 
249 aa  252  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02680  predicted inner membrane protein  58.9 
 
 
237 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000474889  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0858  Integral membrane protein TerC  58.9 
 
 
237 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000383082  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0883  integral membrane protein TerC  58.9 
 
 
237 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0104396  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3152  TerC family integral membrane protein  58.9 
 
 
237 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251436  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2979  TerC family integral membrane protein  58.9 
 
 
237 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702037  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02641  hypothetical protein  58.9 
 
 
237 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000421681  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3030  integral membrane protein, TerC family  58.9 
 
 
237 aa  251  9.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130968  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4099  integral membrane protein, TerC family  58.9 
 
 
237 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000012685  hitchhiker  0.00127098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2980  TerC family integral membrane protein  58.9 
 
 
237 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000029602  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  49.4 
 
 
522 aa  250  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3334  hypothetical protein  58.47 
 
 
237 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00486837  hitchhiker  0.00634804 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3171  protein YegH  58.47 
 
 
237 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00710454  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3234  hypothetical protein  58.47 
 
 
237 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00228616  hitchhiker  0.000000995784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3153  protein YegH  58.47 
 
 
237 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000196217  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3219  hypothetical protein  58.47 
 
 
237 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  hitchhiker  0.00113241 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  50.4 
 
 
250 aa  250  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  52.77 
 
 
242 aa  250  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3200  Integral membrane protein TerC  56.72 
 
 
238 aa  248  9e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  48.61 
 
 
522 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9165  integral membrane protein TerC  57.37 
 
 
254 aa  245  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2953  Integral membrane protein TerC  56.15 
 
 
258 aa  244  6.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000321183  unclonable  0.0000000329078 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2045  integral membrane protein TerC  52.61 
 
 
241 aa  244  6.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7344  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  49.58 
 
 
510 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1471  integral membrane protein, TerC family  55.93 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.848938  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  49.58 
 
 
518 aa  241  7.999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2948  Integral membrane protein TerC  50.21 
 
 
240 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  46.61 
 
 
523 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  46.61 
 
 
523 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  47.04 
 
 
518 aa  240  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  46.61 
 
 
518 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  46.61 
 
 
518 aa  239  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  46.61 
 
 
518 aa  239  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  49.15 
 
 
522 aa  239  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  47.81 
 
 
514 aa  239  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  46.61 
 
 
518 aa  239  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000647451  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  46.61 
 
 
518 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  46.61 
 
 
518 aa  239  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  46.61 
 
 
518 aa  239  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  46.61 
 
 
518 aa  239  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2868  Integral membrane protein TerC  51.98 
 
 
529 aa  238  5e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  46.61 
 
 
516 aa  238  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000129507  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  46.22 
 
 
523 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  48.03 
 
 
577 aa  238  9e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  51.1 
 
 
528 aa  238  9e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>