More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1749 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  61.46 
 
 		 567 aa  647    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 574 aa  1147    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  55.54 
 
 		 568 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  49.65 
 
 		 569 aa  543  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0623  DNA repair protein RecN  50.97 
 
 		 568 aa  530  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.72171  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0537  DNA repair protein RecN  52.02 
 
 		 568 aa  513  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.674533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1612  DNA repair protein RecN  51.91 
 
 		 573 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.458504 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  46.48 
 
 		 578 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  38.69 
 
 		 577 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  37.74 
 
 		 554 aa  363  6e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  37.78 
 
 		 572 aa  349  7e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  36.06 
 
 		 558 aa  342  9e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  38.09 
 
 		 574 aa  339  7e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  29.93 
 
 		 574 aa  334  3e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  35.13 
 
 		 579 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  35.78 
 
 		 561 aa  330  4e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  32.86 
 
 		 566 aa  330  4e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  34.79 
 
 		 567 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  35.13 
 
 		 579 aa  329  8e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  34.96 
 
 		 583 aa  329  9e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  36.23 
 
 		 553 aa  329  9e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  34.96 
 
 		 579 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  34.96 
 
 		 579 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  35.88 
 
 		 553 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  34.96 
 
 		 579 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  35.48 
 
 		 579 aa  327  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  35.87 
 
 		 588 aa  327  3e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  34.84 
 
 		 579 aa  327  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  34.78 
 
 		 583 aa  327  5e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  34.67 
 
 		 579 aa  326  9e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  34.26 
 
 		 579 aa  325  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  33.86 
 
 		 573 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  34.68 
 
 		 573 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  36.17 
 
 		 556 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  35.87 
 
 		 588 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  36.17 
 
 		 554 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  36.43 
 
 		 572 aa  320  5e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  35.24 
 
 		 553 aa  318  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  34.33 
 
 		 559 aa  317  4e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  34.33 
 
 		 559 aa  317  4e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  32.35 
 
 		 555 aa  316  6e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 570 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  33.63 
 
 		 560 aa  315  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  35.15 
 
 		 588 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  34.08 
 
 		 558 aa  311  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  36.09 
 
 		 553 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  36.09 
 
 		 553 aa  310  4e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  36.09 
 
 		 553 aa  310  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  35.06 
 
 		 555 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  33.68 
 
 		 580 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  35.56 
 
 		 599 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  32.88 
 
 		 556 aa  304  3.0000000000000004e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  36.59 
 
 		 558 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  31.14 
 
 		 565 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  34.04 
 
 		 562 aa  301  3e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  34.35 
 
 		 601 aa  300  7e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  35.25 
 
 		 553 aa  299  8e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  35.39 
 
 		 555 aa  298  1e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  30.8 
 
 		 565 aa  299  1e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  36.67 
 
 		 558 aa  299  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  33.16 
 
 		 555 aa  298  2e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  33.04 
 
 		 555 aa  297  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  34.97 
 
 		 557 aa  296  5e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0703  DNA repair protein RecN  37.24 
 
 		 557 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926549  hitchhiker  0.000359109 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  32.81 
 
 		 562 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  35.92 
 
 		 557 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  34.68 
 
 		 586 aa  293  5e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  32.01 
 
 		 587 aa  293  7e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  36.1 
 
 		 557 aa  293  8e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  34.14 
 
 		 559 aa  292  9e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  33.92 
 
 		 565 aa  292  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  34.09 
 
 		 556 aa  292  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  34.33 
 
 		 551 aa  292  1e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  32.12 
 
 		 560 aa  291  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  32.45 
 
 		 561 aa  291  3e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  35.29 
 
 		 558 aa  290  4e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  33.17 
 
 		 589 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  36.1 
 
 		 558 aa  290  6e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1303  DNA repair protein RecN  34.04 
 
 		 557 aa  290  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.523963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  32.69 
 
 		 559 aa  289  1e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  35.81 
 
 		 564 aa  289  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  31.21 
 
 		 551 aa  288  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4595  DNA repair protein RecN  36.21 
 
 		 557 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  32.86 
 
 		 557 aa  288  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4730  DNA repair protein RecN  36.38 
 
 		 557 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  34.27 
 
 		 554 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4729  DNA repair protein RecN  36.03 
 
 		 557 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  34.78 
 
 		 553 aa  286  7e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  34.8 
 
 		 553 aa  286  8e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  33.98 
 
 		 557 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  33.91 
 
 		 553 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  34.5 
 
 		 556 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  33.56 
 
 		 553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6893  DNA repair protein RecN  34.15 
 
 		 549 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23585  normal  0.532581 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1845  Sigma 54 interacting domain protein  34.39 
 
 		 552 aa  284  2.0000000000000002e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34764  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  33.04 
 
 		 552 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  33.56 
 
 		 553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  32.7 
 
 		 557 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5209  DNA repair protein RecN  34.15 
 
 		 551 aa  283  5.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  33.39 
 
 		 553 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>